217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0103 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  100 
 
 
275 aa  541  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  70.07 
 
 
277 aa  348  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  54.06 
 
 
293 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  52.65 
 
 
293 aa  242  6e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  51.94 
 
 
295 aa  235  7e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  44.09 
 
 
259 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  43.22 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  42.96 
 
 
262 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  42.96 
 
 
262 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  43.96 
 
 
266 aa  169  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  42.96 
 
 
262 aa  168  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  43.59 
 
 
265 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  43.59 
 
 
265 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  42.18 
 
 
256 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  40.55 
 
 
289 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  41.82 
 
 
256 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  41.82 
 
 
256 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  41.82 
 
 
256 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  41.82 
 
 
256 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  41.82 
 
 
256 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  40.29 
 
 
270 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  41.13 
 
 
270 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  39.85 
 
 
245 aa  135  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  35.56 
 
 
238 aa  115  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  33.57 
 
 
284 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  34.17 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  34.17 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  35.31 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  34.77 
 
 
254 aa  109  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  35.69 
 
 
262 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  34.53 
 
 
255 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  34.17 
 
 
256 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  37.99 
 
 
246 aa  102  9e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  31.29 
 
 
255 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  36.79 
 
 
254 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  32.26 
 
 
270 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  27.37 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  31.45 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  35.02 
 
 
244 aa  94  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.34 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  30.07 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  33.57 
 
 
262 aa  92  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  33.82 
 
 
248 aa  89.7  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  37.04 
 
 
254 aa  82  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3046  Baf family transcriptional activator  28.78 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  26.16 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  33.66 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0943  pantothenate kinase  25.45 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0973  pantothenate kinase  25.45 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  34.29 
 
 
253 aa  79  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  30.35 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  28.98 
 
 
251 aa  72  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  27.78 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.83 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  27.76 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2182  pantothenate kinase  38.84 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0183048  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  33.19 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0944  pantothenate kinase  32.64 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00303961  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2217  pantothenate kinase  28.47 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3221  pantothenate kinase  29.2 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02240  transcriptional activator, putative, Baf family  33.14 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  26.2 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  28.68 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  27.68 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0958  pantothenate kinase  30.86 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  27.68 
 
 
254 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  30.04 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  28.14 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  25 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2285  pantothenate kinase  34.67 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  27.11 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2817  pantothenate kinase  33.97 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.767052 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  29.06 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  25.55 
 
 
274 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  31.46 
 
 
221 aa  63.5  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  27.86 
 
 
254 aa  63.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.51 
 
 
254 aa  62.8  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  26.8 
 
 
247 aa  62.8  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3000  pantothenate kinase  32.89 
 
 
260 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  23.53 
 
 
255 aa  62.4  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1572  pantothenate kinase  28.4 
 
 
254 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1811  pantothenate kinase  34.5 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1477  pantothenate kinase  28.4 
 
 
254 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123819  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  28.37 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  29.01 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1570  pantothenate kinase  31.85 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.107574  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  28.4 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  24.9 
 
 
252 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  39.76 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  28.69 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  34.51 
 
 
253 aa  60.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  25.74 
 
 
248 aa  60.1  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  26.38 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  28.83 
 
 
258 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  29.58 
 
 
254 aa  59.3  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1294  pantothenate kinase  31.98 
 
 
261 aa  59.3  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3950  transcriptional activator, Baf family  35.71 
 
 
275 aa  59.3  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.151216  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.25 
 
 
241 aa  58.9  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  31.25 
 
 
241 aa  58.9  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1093  putative transcriptional activator, Baf family  36.64 
 
 
248 aa  58.9  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.040353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>