More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4069 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  87.94 
 
 
423 aa  729    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
423 aa  836    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  48.9 
 
 
421 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  42.13 
 
 
417 aa  288  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  37.97 
 
 
377 aa  246  6e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  37.31 
 
 
379 aa  239  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  37.33 
 
 
377 aa  238  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  38.63 
 
 
377 aa  237  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  37.86 
 
 
472 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  29.88 
 
 
397 aa  229  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  41.54 
 
 
446 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  34.32 
 
 
423 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  36.99 
 
 
433 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  34.28 
 
 
418 aa  223  4e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  34.75 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  35.05 
 
 
496 aa  220  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  34.43 
 
 
443 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  35.05 
 
 
496 aa  220  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  36.75 
 
 
452 aa  219  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  34.95 
 
 
484 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  37.12 
 
 
387 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  38.15 
 
 
426 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  36.88 
 
 
429 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  34.95 
 
 
476 aa  216  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  31.31 
 
 
444 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  31.5 
 
 
482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  36.99 
 
 
478 aa  213  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  34.4 
 
 
443 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  35.04 
 
 
479 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
400 aa  211  2e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  32.35 
 
 
438 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  33.63 
 
 
491 aa  210  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  35.15 
 
 
441 aa  211  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  37.88 
 
 
479 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  36.94 
 
 
479 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 
432 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  35.71 
 
 
478 aa  209  6e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2135  carboxyl-terminal protease  37.57 
 
 
445 aa  209  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  34.3 
 
 
489 aa  209  7e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  35.71 
 
 
478 aa  209  9e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  34.82 
 
 
422 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  35.07 
 
 
457 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  37.77 
 
 
440 aa  208  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  35.91 
 
 
428 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3039  carboxyl-terminal protease  36.59 
 
 
445 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  32.53 
 
 
383 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  34.97 
 
 
428 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  35.26 
 
 
446 aa  207  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  32.35 
 
 
444 aa  207  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  33.15 
 
 
435 aa  207  4e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  33.24 
 
 
410 aa  206  5e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  32.76 
 
 
434 aa  206  6e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  37.95 
 
 
556 aa  206  9e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  33.24 
 
 
455 aa  206  9e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  32.25 
 
 
438 aa  205  1e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  34.53 
 
 
441 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  31.41 
 
 
478 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  32.88 
 
 
443 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  33.96 
 
 
462 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  34.4 
 
 
440 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  34.36 
 
 
434 aa  204  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  35.46 
 
 
445 aa  203  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  34.88 
 
 
469 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  32.56 
 
 
439 aa  203  5e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  33.77 
 
 
480 aa  203  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  34.6 
 
 
481 aa  203  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  34.55 
 
 
423 aa  202  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  33.95 
 
 
441 aa  202  8e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  34.88 
 
 
478 aa  202  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  34.88 
 
 
469 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
444 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  34.88 
 
 
478 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  34.88 
 
 
478 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  31.85 
 
 
478 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  34.88 
 
 
469 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  34.88 
 
 
478 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  32.98 
 
 
448 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  37.76 
 
 
444 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  34.89 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  31.81 
 
 
444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  34.15 
 
 
457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  34.67 
 
 
442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  36.39 
 
 
453 aa  200  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  32.98 
 
 
448 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  34.73 
 
 
444 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  35.91 
 
 
478 aa  201  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  33.63 
 
 
468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  32.97 
 
 
478 aa  200  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  35.15 
 
 
444 aa  200  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  34.88 
 
 
445 aa  199  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  34.62 
 
 
439 aa  199  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  32.55 
 
 
419 aa  199  7e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  35.06 
 
 
549 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  33.24 
 
 
439 aa  199  7.999999999999999e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  34.81 
 
 
438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  35.11 
 
 
437 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  32.48 
 
 
449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  33.09 
 
 
490 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  33.16 
 
 
483 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  34.75 
 
 
477 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>