More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1353 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1353  non-specific protein-tyrosine kinase  100 
 
 		 624 aa  1259    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4270  non-specific protein-tyrosine kinase  83.33 
 
 		 605 aa  898    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0194  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  33.98 
 
 		 575 aa  233  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27748  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1545  capsular exopolysaccharide family  31.36 
 
 		 469 aa  197  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1670  non-specific protein-tyrosine kinase  36.04 
 
 		 790 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00511169  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3637  lipopolysaccharide biosynthesis protein  32.24 
 
 		 480 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1363  lipopolysaccharide biosynthesis  30.13 
 
 		 464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000148306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1539  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  31.56 
 
 		 730 aa  172  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5398  capsular exopolysaccharide family protein  40.99 
 
 		 233 aa  171  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.466197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5554  tyrosine-protein kinase YwqD  40.54 
 
 		 233 aa  171  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000192889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0944  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.05 
 
 		 720 aa  170  8e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4958  protein-tyrosine kinase  40.54 
 
 		 233 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5396  tyrosine-protein kinase YwqD  40.09 
 
 		 233 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5073  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.99 
 
 		 234 aa  169  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1657  non-specific protein-tyrosine kinase  33.03 
 
 		 721 aa  169  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.779278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5451  tyrosine-protein kinase YwqD  40.54 
 
 		 233 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0440072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1272  non-specific protein-tyrosine kinase  36.7 
 
 		 667 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0453  capsule synthesis gene, putative  39.91 
 
 		 217 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000667993  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3796  capsular exopolysaccharide family  29.7 
 
 		 741 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.263361  normal  0.369673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1045  lipopolysaccharide biosynthesis  31.9 
 
 		 736 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0728146  normal  0.010052 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3274  capsular exopolysaccharide family  41.18 
 
 		 232 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000194984  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4938  capsular exopolysaccharide family  32.68 
 
 		 750 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.831467 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0465  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.45 
 
 		 217 aa  163  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000141765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4107  capsular exopolysaccharide family  38.54 
 
 		 246 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517117 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1464  uncharacterized exopolysaccharide biosynthesis protein  31.77 
 
 		 804 aa  162  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000029273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1386  lipopolysaccharide biosynthesis  32.75 
 
 		 734 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1497  protein-tyrosine kinase  36.42 
 
 		 753 aa  161  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.764592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3310  protein-tyrosine kinase  30.03 
 
 		 756 aa  159  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.375683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1127  capsular exopolysaccharide family  33.24 
 
 		 722 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3668  non-specific protein-tyrosine kinase  44.83 
 
 		 233 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6509  Non-specific protein-tyrosine kinase  34.04 
 
 		 454 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0012  Non-specific protein-tyrosine kinase  29.62 
 
 		 463 aa  156  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.429064  hitchhiker  0.00275231 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0358  capsular exopolysaccharide family  27.8 
 
 		 490 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2183  lipopolysaccharide biosynthesis  27.53 
 
 		 745 aa  153  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.903272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  31.1 
 
 		 738 aa  151  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1180  capsular exopolysaccharide family  40.28 
 
 		 211 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4846  lipopolysaccharide biosynthesis  31.45 
 
 		 742 aa  150  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0566173  normal  0.0374732 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1662  capsular polysaccharide biosynthesis protein  42.93 
 
 		 240 aa  150  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.54254  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2235  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  38.76 
 
 		 235 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0897  capsular exopolysaccharide family  32.05 
 
 		 496 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.240779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1126  capsular exopolysaccharide family  33.42 
 
 		 790 aa  148  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0796389  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3472  protein-tyrosine kinase  35.85 
 
 		 615 aa  147  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5075  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  35.43 
 
 		 225 aa  147  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.064024  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1694  capsular exopolysaccharide family  29.54 
 
 		 779 aa  147  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4042  non-specific protein-tyrosine kinase  44.29 
 
 		 224 aa  147  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.921911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24630  capsular exopolysaccharide biosynthesis protein  29.27 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4960  tyrosine-protein kinase  35.14 
 
 		 225 aa  145  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.94095e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3268  capsular exopolysaccharide family  36 
 
 		 221 aa  145  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.582826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2583  protein-tyrosine kinase  32.15 
 
 		 711 aa  145  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5453  tyrosine-protein kinase YwqD  34.98 
 
 		 225 aa  144  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000155179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5400  capsular exopolysaccharide family protein  35.78 
 
 		 225 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00155134  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1943  protein-tyrosine kinase  38.18 
 
 		 239 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.641105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4006  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.47 
 
 		 215 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0952  capsular exopolysaccharide family  38.91 
 
 		 492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5247  capsular exopolysaccharide family  27.74 
 
 		 509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0835  protein-tyrosine kinase  29.79 
 
 		 743 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0461  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  28.32 
 
 		 737 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3012  lipopolysaccharide biosynthesis  30.15 
 
 		 797 aa  141  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5304  capsular exopolysaccharide family  31.42 
 
 		 539 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5368  exopolysaccharide transporter  29.55 
 
 		 747 aa  140  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3000  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  40.76 
 
 		 242 aa  140  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3195  lipopolysaccharide biosynthesis  33.12 
 
 		 503 aa  140  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1597  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  31.04 
 
 		 739 aa  140  8.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149486 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2653  hypothetical protein  31.93 
 
 		 249 aa  139  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  32.41 
 
 		 756 aa  139  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3190  exopolysaccharide transport protein family  28.08 
 
 		 764 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.732974  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5552  tyrosine-protein kinase YwqD  34.4 
 
 		 225 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000166595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1087  capsular exopolysaccharide family  33.33 
 
 		 763 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0136543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1681  lipopolysaccharide biosynthesis  34.51 
 
 		 505 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07230  putative tyrosine-protein kinase in cps region  29.41 
 
 		 815 aa  138  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0649  hypothetical protein  29.21 
 
 		 806 aa  137  5e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.304884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5398  tyrosine-protein kinase YwqD  33.94 
 
 		 257 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3874  capsular exopolysaccharide family  35.69 
 
 		 778 aa  137  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3224  protein-tyrosine kinase  31.73 
 
 		 733 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4817  non-specific protein-tyrosine kinase  29.33 
 
 		 727 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.963107 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1434  tyrosine-protein kinase  37.85 
 
 		 252 aa  134  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2481  chain length determinant protein  30.86 
 
 		 739 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0914  EpsB  30.86 
 
 		 739 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.121592  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0449  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.53 
 
 		 711 aa  134  6.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2619  chain length determinant protein  30.86 
 
 		 739 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4449  capsular exopolysaccharide family  38.2 
 
 		 472 aa  133  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4243  exopolysaccharide transport protein family  30.18 
 
 		 757 aa  133  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0880  tyrosine-protein kinase  28.92 
 
 		 786 aa  133  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.107004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0547  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase, putative  30.56 
 
 		 739 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4771  lipopolysaccharide biosynthesis  34.18 
 
 		 508 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4274  tyrosine kinase  27.44 
 
 		 745 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0501  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.95 
 
 		 488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.056909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4111  capsular exopolysaccharide family  33.06 
 
 		 741 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2615  non-specific protein-tyrosine kinase  41.3 
 
 		 244 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.11951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3276  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  27.8 
 
 		 736 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3804  protein-tyrosine kinase  31.58 
 
 		 774 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3321  lipopolysaccharide biosynthesis  31.58 
 
 		 772 aa  130  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134805 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1925  protein-tyrosine kinase  38.89 
 
 		 801 aa  130  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864288  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4429  capsular exopolysaccharide family  27.96 
 
 		 747 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1583  protein-tyrosine kinase  29.73 
 
 		 737 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.918295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4408  capsular exopolysaccharide family  27.76 
 
 		 746 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0136  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.04 
 
 		 228 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0141  exopolysaccharide tyrosine-protein kinase  30.04 
 
 		 228 aa  129  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0852  lipopolysaccharide biosynthesis  30.93 
 
 		 727 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0448301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1115  capsular exopolysaccharide family  28.96 
 
 		 730 aa  127  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>