51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1091 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1091  prepilin peptidase transmembrane protein  100 
 
 		 168 aa  319  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293448  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4245  peptidase A24A prepilin type IV  73.1 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501953  normal  0.336859 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4355  peptidase A24A prepilin type IV  73.1 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2318  peptidase A24A prepilin type IV  44.25 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20935 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1293  peptidase, putative  45.28 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1938  hypothetical protein  45.28 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0398561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1051  peptidase A24A, prepilin type IV  45.28 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.192261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1786  peptidase A24A, prepilin type IV  45.28 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0114  putative peptidase  45.28 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.619912  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1781  putative peptidase  45.28 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1765  peptidase A24A, prepilin type IV  44.34 
 
 		 166 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4612  peptidase A24A prepilin type IV  44.12 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2545  peptidase, putative  39.17 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.316658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1440  peptidase A24A prepilin type IV  41.59 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.609911  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5406  peptidase A24A, prepilin type IV  42.75 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4443  peptidase A24A prepilin type IV  41.12 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1650  peptidase A24A prepilin type IV  38.89 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.315486  normal  0.814556 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0550  peptidase A24A prepilin type IV  38.17 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2074  peptidase A24A prepilin type IV  43.66 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.672296  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1038  peptidase A24A, prepilin type IV  38.79 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000360772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1518  peptidase A24A, prepilin type IV  38.79 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000376133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1494  peptidase A24A prepilin type IV  38.79 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768093  hitchhiker  0.0000106849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1735  peptidase A24A prepilin type IV  34.59 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000711664  hitchhiker  0.0000368667 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4658  peptidase A24A, prepilin type IV  34.25 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000621846  hitchhiker  0.00310528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1400  peptidase A24A, prepilin type IV  37.33 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174968  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2546  peptidase A24A, prepilin type IV  40.82 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.0487377 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1335  peptidase A24A, prepilin type IV  33.04 
 
 		 209 aa  52.4  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.936907  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0790  peptidase A24A, prepilin type IV  35.4 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1170  peptidase A24A prepilin type IV  33.33 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1517  peptidase A24A prepilin type IV  37.36 
 
 		 194 aa  48.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0417  peptidase A24A, prepilin type IV  38.76 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  32.79 
 
 		 274 aa  46.6  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1526  peptidase A24A, prepilin type IV  33.59 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0594  peptidase A24A prepilin type IV  36.19 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.833394  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0796  peptidase A24A prepilin type IV  33.86 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5318  peptidase A24A prepilin type IV  36.44 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.857567  hitchhiker  0.00150352 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5993  peptidase A24A prepilin type IV  35.09 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.363598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3082  peptidase A24A, prepilin type IV  37.72 
 
 		 204 aa  44.7  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1491  peptidase A24A, prepilin type IV  28.76 
 
 		 187 aa  44.3  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2801  putative prepilin peptidase transmembrane protein, CpaA like  36.78 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6289  peptidase A24A, prepilin type IV  33.33 
 
 		 180 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00506337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2957  peptidase A24A, prepilin type IV  37.84 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0852  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  33.83 
 
 		 281 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579083  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2265  peptidase, putative  36.75 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1308  type IV prepilin peptidase-like protein  37.84 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0650  peptidase A24A, prepilin type IV  39.64 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.976184  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2557  peptidase A24A domain protein  27.07 
 
 		 248 aa  42  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2480  peptidase A24A prepilin type IV  33.93 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139077 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2641  peptidase A24A, prepilin type IV  35 
 
 		 190 aa  40.8  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0236  peptidase A24A domain-containing protein  28.38 
 
 		 260 aa  40.8  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000968421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0892  peptidase A24A domain protein  29.08 
 
 		 251 aa  40.8  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>