More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4185 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4185  Rep B partitioning protein/ParB-like protein  100 
 
 		 328 aa  661    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324966  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4022  parB-like partition protein  54.23 
 
 		 338 aa  348  6e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4103  parB-like partition protein  41.13 
 
 		 274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4022  ParB-like partition protein  35.86 
 
 		 316 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7171  plasmid partitioning protein RepB  36.51 
 
 		 331 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29862 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6016  plasmid partitioning protein RepB  42.41 
 
 		 331 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0995392  normal  0.26849 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9502  replication protein B  33.44 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.627889  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  31.74 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7788  plasmid partitioning protein RepB  41.33 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256779  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1203  replication protein RepB  32.67 
 
 		 328 aa  122  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00462835  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4584  parB-like partition proteins  42.54 
 
 		 335 aa  122  7e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1105  replication protein RepB  32.34 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000199163  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8704  plasmid partitioning protein RepB  34.54 
 
 		 312 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5001  replication protein B  35.16 
 
 		 360 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868981  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4518  parB-like partition proteins  31.62 
 
 		 339 aa  119  6e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5376  plasmid partitioning protein RepB  40.61 
 
 		 349 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224219  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9002  replication protein B  39.51 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4455  parB-like partition protein  31.35 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00154333  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4672  parB-like partition protein  42.29 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5872  plasmid partitioning protein RepB  40.61 
 
 		 351 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136486  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3735  plasmid partitioning protein RepB  41.51 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4790  parB-like partition protein  32.97 
 
 		 335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6163  plasmid partitioning protein RepB  31.27 
 
 		 332 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.331476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4090  parB-like partition protein  42.86 
 
 		 333 aa  115  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4688  plasmid partitioning protein RepB  32.35 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0002  ParB family protein  33.8 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.295488 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4190  parB-like partition protein  33.67 
 
 		 358 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.33147 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5194  plasmid partitioning protein RepB  38.97 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223628  normal  0.149754 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5556  plasmid partitioning protein RepB  37.06 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal  0.913858 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4191  parB-like partition proteins  37.1 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.529264  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6053  plasmid partitioning protein RepB  37.79 
 
 		 326 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5913  plasmid partitioning protein RepB  39.77 
 
 		 336 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.339623  normal  0.0259303 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6491  parB-like partition protein  35.65 
 
 		 340 aa  105  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.880766 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6316  plasmid partitioning protein RepB  37.06 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.758859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4823  parB-like partition protein  37.5 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000278259  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8001  replication protein B  34.11 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7001  replication protein B  37.02 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6500  plasmid partitioning protein RepB  40.72 
 
 		 350 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5616  plasmid partitioning protein RepB  30.23 
 
 		 334 aa  103  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.389719  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5464  plasmid partitioning protein RepB  37.21 
 
 		 333 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424565 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4710  parB-like partition protein  31.44 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.946547  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4280  RepB plasmid partition  37.56 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4572  parB-like partition proteins  38.28 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3275  parB-like partition protein  37.14 
 
 		 322 aa  99.4  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4355  ParB family protein  36.56 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5174  parB-like partition protein  30.31 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.690841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3562  plasmid partitioning protein RepB  42.11 
 
 		 353 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5479  plasmid partitioning protein RepB  35.59 
 
 		 342 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9801  replication protein B  35.88 
 
 		 345 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4533  parB-like partition protein  34.12 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8200  replication protein B  32.35 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  29.35 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  31.34 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52240  chromosome partition ParB  31.11 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  33.88 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  33.88 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  35.96 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  35.96 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  34.67 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  32.46 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  32.52 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  35.11 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  32.45 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  31.71 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  35.29 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0096  parB-like partition protein  37.61 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  35.94 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  35.94 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  35.94 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  35.94 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0087  parB-like partition proteins  37.61 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  35.94 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  35.94 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  35.94 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0097  parB-like partition protein  37.61 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  32.67 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  35.94 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  37.61 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  37.07 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  35.94 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  37.61 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  34.43 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  35.16 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  25 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  32 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  28.19 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  32 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0036  putative repB protein  26.15 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0068  DNA-binding protein  26.18 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0656  parB-like partition protein  29.56 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.235927  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  33.61 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  35.29 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1422  ParB-like nuclease  31.23 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  33.82 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22180  parB-like partition protein  29.55 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28480  ParB-like partition protein  29.93 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.327957  hitchhiker  0.00126502 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3492  nuclease  30.88 
 
 		 361 aa  57  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0639009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  30.22 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  33.05 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>