125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05217 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  100 
 
 		 263 aa  532  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  80.61 
 
 		 263 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  80.61 
 
 		 263 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  49.6 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  49.38 
 
 		 253 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  49.6 
 
 		 257 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  52.14 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  50.21 
 
 		 253 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  49.79 
 
 		 257 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  49.79 
 
 		 253 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  49.6 
 
 		 257 aa  248  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  49.6 
 
 		 257 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  49.6 
 
 		 281 aa  245  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  49.2 
 
 		 257 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  50 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  50 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  50 
 
 		 306 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  50 
 
 		 306 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  50 
 
 		 256 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  50 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  50 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  49.57 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  50 
 
 		 270 aa  232  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  46.47 
 
 		 273 aa  231  7.000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  46.61 
 
 		 268 aa  221  7e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.97 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.13 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.59 
 
 		 285 aa  85.9  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.5 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  27.08 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.39 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.18 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  24.82 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.97 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1560  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.98 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.142334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.59 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.85 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.18 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.97 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  34.04 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.03 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3011  ectoine hydroxylase  25 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.812874  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  26.96 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  24.15 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  27.09 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  24.54 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2748  hypothetical protein  23.05 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2621  hypothetical protein  23.05 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.95 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.14 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  24.73 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  25 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.73 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.39 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 394 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.18 
 
 		 394 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  25.91 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1161  ectoine hydroxylase  25.76 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.76 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.76 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.69 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  34.76 
 
 		 303 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3328  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.04 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  32.76 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.63 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1202  putative ectoine hydroxylase (ectD)  26.95 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.32 
 
 		 293 aa  52  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  29.32 
 
 		 299 aa  51.6  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  23.26 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.69 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1683  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.09 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.69 
 
 		 282 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.98 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.29 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1558  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.39 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.85 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.7 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3132  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.23 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.87 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  25.79 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.37 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  30.36 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  24.71 
 
 		 314 aa  49.7  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.22 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.25 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.71 
 
 		 230 aa  49.3  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  23.72 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2735  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.41 
 
 		 277 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.52 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.91 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35257  predicted protein  23.36 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.109347  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.53 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.91 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1922  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.46 
 
 		 390 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.902766  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.68 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3795  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.08 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  23.48 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_29381  predicted protein  24.03 
 
 		 329 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575053  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  23.93 
 
 		 258 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>