192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02177 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  100 
 
 		 1309 aa  2558    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  55.06 
 
 		 4384 aa  524  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  33.17 
 
 		 1613 aa  294  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  43.04 
 
 		 1326 aa  273  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  28.74 
 
 		 1446 aa  264  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  47.94 
 
 		 877 aa  260  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  35.26 
 
 		 1090 aa  258  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  35.26 
 
 		 1090 aa  258  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  35.26 
 
 		 1090 aa  258  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  35.26 
 
 		 1074 aa  258  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  35.26 
 
 		 1122 aa  258  7e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  35.26 
 
 		 1122 aa  257  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  37.72 
 
 		 2868 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  35.13 
 
 		 1122 aa  256  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  32.37 
 
 		 1472 aa  242  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  41.67 
 
 		 735 aa  240  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  41.94 
 
 		 810 aa  230  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  30.86 
 
 		 1447 aa  220  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  34.93 
 
 		 990 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  29.96 
 
 		 1447 aa  216  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  36.28 
 
 		 3192 aa  214  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  30.95 
 
 		 967 aa  210  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  54.15 
 
 		 533 aa  207  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  29.53 
 
 		 1549 aa  204  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  38.93 
 
 		 3126 aa  197  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  30.05 
 
 		 1246 aa  196  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  28.12 
 
 		 1616 aa  194  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  40.16 
 
 		 2832 aa  194  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1616 aa  194  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  49.13 
 
 		 460 aa  193  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  49.13 
 
 		 378 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  27.97 
 
 		 1616 aa  191  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  27.97 
 
 		 1588 aa  191  9e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  51.22 
 
 		 373 aa  189  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  51.22 
 
 		 378 aa  189  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  51.22 
 
 		 373 aa  189  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  54.13 
 
 		 1186 aa  188  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  54.13 
 
 		 1068 aa  187  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  53.7 
 
 		 962 aa  187  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  54.17 
 
 		 1012 aa  187  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  42.06 
 
 		 472 aa  184  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  50.75 
 
 		 192 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  50.75 
 
 		 192 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2395  Haemagluttinin domain protein  37.97 
 
 		 2141 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819478  normal  0.219334 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  26.44 
 
 		 1674 aa  179  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  50.25 
 
 		 1654 aa  174  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1595  Hep_Hag family protein  49.76 
 
 		 617 aa  171  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.855766  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  37.99 
 
 		 4191 aa  169  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  48.15 
 
 		 525 aa  168  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2381  Hep_Hag family protein  47.72 
 
 		 1626 aa  167  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  47.72 
 
 		 1705 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  47.72 
 
 		 1669 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1776  surface-exposed protein  47.72 
 
 		 1766 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.885924  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  47.72 
 
 		 1535 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  47.72 
 
 		 715 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0112  Hep_Hag family protein  49.01 
 
 		 827 aa  166  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  35.31 
 
 		 716 aa  165  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  35.31 
 
 		 716 aa  165  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  38.34 
 
 		 3355 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.739468 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  37.89 
 
 		 820 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  37.89 
 
 		 831 aa  164  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  37.89 
 
 		 831 aa  164  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  37.89 
 
 		 816 aa  164  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  37.89 
 
 		 816 aa  164  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  37.89 
 
 		 816 aa  164  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  37.89 
 
 		 816 aa  164  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  37.89 
 
 		 831 aa  163  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  35.76 
 
 		 880 aa  162  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  34.82 
 
 		 876 aa  160  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4636  YadA domain-containing protein  38.77 
 
 		 3718 aa  158  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122431 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2439  YadA domain-containing protein  45.62 
 
 		 737 aa  155  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000109302  unclonable  0.0000000000563921 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8539  YadA domain protein  37.59 
 
 		 2157 aa  154  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3245  Haemagluttinin domain protein  32.76 
 
 		 1814 aa  154  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.691037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  56.44 
 
 		 4726 aa  152  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  33.88 
 
 		 878 aa  148  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4026  haemagglutinin family  28.39 
 
 		 753 aa  148  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  49.72 
 
 		 963 aa  147  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0146  hypothetical protein  49.7 
 
 		 135 aa  145  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0122  haemagluttinin family protein  49.7 
 
 		 135 aa  145  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  30.41 
 
 		 1125 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0774  YadA domain-containing protein  45.54 
 
 		 650 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000258117  hitchhiker  0.0000000471777 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7374  YadA/haemagluttinin like protein  33.8 
 
 		 1854 aa  140  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00142444  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  29.12 
 
 		 2396 aa  140  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  34.1 
 
 		 1471 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  34.1 
 
 		 1471 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  34.43 
 
 		 1072 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  39.33 
 
 		 1342 aa  132  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  39.23 
 
 		 279 aa  131  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6476  YadA domain-containing protein  34.48 
 
 		 1546 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  35 
 
 		 2504 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  29.45 
 
 		 1417 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  34.09 
 
 		 597 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4376  haemagglutinin and invasin like cell surface protein  51.16 
 
 		 977 aa  129  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  34.09 
 
 		 597 aa  129  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  34.09 
 
 		 597 aa  129  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  29.3 
 
 		 1197 aa  128  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  29.3 
 
 		 1197 aa  128  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  34.29 
 
 		 1390 aa  128  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6201  YadA domain-containing protein  34.31 
 
 		 1353 aa  128  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.984796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5930  YadA domain-containing protein  34.54 
 
 		 1434 aa  128  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>