73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0978 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  100 
 
 		 193 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  97.93 
 
 		 193 aa  380  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  92.75 
 
 		 193 aa  363  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  86.39 
 
 		 205 aa  337  9e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  78.24 
 
 		 193 aa  315  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  77.2 
 
 		 198 aa  310  9e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  75.65 
 
 		 198 aa  307  6.999999999999999e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  64.21 
 
 		 193 aa  238  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  59.36 
 
 		 193 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  58.82 
 
 		 193 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  59.36 
 
 		 193 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  58.51 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  59.89 
 
 		 193 aa  224  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  62.21 
 
 		 193 aa  222  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  51.31 
 
 		 210 aa  208  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  52.38 
 
 		 193 aa  205  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  49.47 
 
 		 192 aa  184  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  48.66 
 
 		 192 aa  177  8e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  48.13 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  46.32 
 
 		 194 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  49.73 
 
 		 200 aa  161  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  46.56 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  48.97 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  48.11 
 
 		 196 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  48.97 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  46.78 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  43.52 
 
 		 192 aa  149  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  45.79 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  41.71 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  43.85 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  43.02 
 
 		 192 aa  145  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  47.22 
 
 		 193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  41.4 
 
 		 214 aa  143  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  42.93 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  41.38 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  38.59 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  45.45 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  39.66 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  42.04 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  42.62 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  45.45 
 
 		 193 aa  131  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.39 
 
 		 195 aa  127  9.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  40.54 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  35.11 
 
 		 197 aa  124  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  40.23 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  42.47 
 
 		 416 aa  115  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  37.5 
 
 		 191 aa  115  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  41.52 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  34.71 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  33.54 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  31.9 
 
 		 190 aa  98.2  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  41.49 
 
 		 194 aa  97.8  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  39.1 
 
 		 204 aa  91.7  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  33.71 
 
 		 204 aa  84.3  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  33.99 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  34.62 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1314  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.15 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.38918  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  27.86 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  26.85 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  27.14 
 
 		 145 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  28.08 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  25.41 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3535  hypothetical protein  23.88 
 
 		 145 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2202  hypothetical protein  25.93 
 
 		 145 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0576  SNARE associated Golgi protein  31.3 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.27432  normal  0.183399 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  25.71 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4653  hypothetical protein  23.72 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.566627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2940  hypothetical protein  25.36 
 
 		 143 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11963  hypothetical protein  25.36 
 
 		 210 aa  42  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  27.34 
 
 		 246 aa  41.2  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2915  hypothetical protein  23.16 
 
 		 188 aa  41.2  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0335  hypothetical protein  24.62 
 
 		 142 aa  41.2  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>