113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4702 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4702  dienelactone hydrolase  100 
 
 		 328 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1694  putative dienelactone hydrolase family protein  64.36 
 
 		 275 aa  354  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.986757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4106  dienelactone hydrolase  68.13 
 
 		 275 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3175  dienelactone hydrolase  58.55 
 
 		 272 aa  324  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1858  dienelactone hydrolase  62.95 
 
 		 275 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0385469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4585  dienelactone hydrolase  44.66 
 
 		 275 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0150817  normal  0.0493147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0227  dienelactone hydrolase  43.31 
 
 		 283 aa  192  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.771569 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4291  dienelactone hydrolase  36.05 
 
 		 283 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0072  dienelactone hydrolase  33.56 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.885053  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0047  dienelactone hydrolase  34.41 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4308  putative dienelactone hydrolase family protein, putative signal peptide  34.6 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3694  dienelactone hydrolase  37.18 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3371  dienelactone hydrolase  36.51 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  34.01 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  32.49 
 
 		 281 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7213  putative dienelactone hydrolase  35.29 
 
 		 284 aa  92.8  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.125525  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0055  putative signal peptide protein  33.19 
 
 		 325 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.250308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1217  dienelactone hydrolase domain-containing protein  31.7 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2873  hypothetical protein  26.13 
 
 		 299 aa  87.8  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3626  dienelactone hydrolase  29.96 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5282  hypothetical protein  29.22 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2471  dienelactone hydrolase  28.57 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164719  normal  0.138775 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2929  dienelactone hydrolase  30.77 
 
 		 291 aa  79  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4783  hypothetical protein  28.31 
 
 		 253 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0643  dienelactone hydrolase  28.24 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.424944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5026  hypothetical protein  25.65 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  29.44 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4797  hypothetical protein  28.5 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4116  dienelactone hydrolase  24.84 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0198407  normal  0.0302336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3572  dienelactone hydrolase  28.16 
 
 		 349 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.660184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0268  putative signal peptide protein  24.79 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3249  dienelactone hydrolase  27.67 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0127  putative signal peptide protein  26.29 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.498965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5100  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.52 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0119  conserved hypothetical signal peptide protein  25.26 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  27.31 
 
 		 251 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  23.45 
 
 		 277 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0146  putative signal peptide protein  27.27 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2293  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.88 
 
 		 602 aa  53.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7027  hypothetical protein  23.81 
 
 		 321 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00368212  normal  0.0842851 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0174  hypothetical protein  25.33 
 
 		 429 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0896  Carboxymethylenebutenolidase  24.65 
 
 		 250 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0078373  unclonable  0.000000019377 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0395  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  21.86 
 
 		 617 aa  52.8  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.46 
 
 		 653 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0375  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  24.45 
 
 		 423 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.89 
 
 		 656 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6013  carboxymethylenebutenolidase  28.96 
 
 		 409 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6309  carboxymethylenebutenolidase  29.86 
 
 		 409 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.301282  normal  0.405511 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2979  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  24.3 
 
 		 418 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2842  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  24.3 
 
 		 419 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  27.19 
 
 		 324 aa  49.7  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3931  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.58 
 
 		 695 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0988778 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  23.11 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  24.32 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  25.78 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3085  peptidase S15  25.11 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.918573  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  26.83 
 
 		 275 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3530  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  24.46 
 
 		 649 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00138387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  27.38 
 
 		 291 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  25.78 
 
 		 291 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 278 aa  47  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02809  dipeptidyl peptidase IV  24.3 
 
 		 729 aa  47  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0738  dienelactone hydrolase  25.1 
 
 		 270 aa  46.6  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.797206 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2945  dienelactone hydrolase and related enzyme-like protein  24.89 
 
 		 423 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4260  hypothetical protein  23.56 
 
 		 429 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2316  dienelactone hydrolase and related enzymes-like  29.06 
 
 		 423 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2930  dienelactone hydrolase and related enzymes-like protein  29.06 
 
 		 423 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.399688  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  25 
 
 		 339 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0166  dienelactone hydrolase  24.39 
 
 		 246 aa  46.2  0.0009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3088  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.37 
 
 		 661 aa  45.8  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350788 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6409  dienelactone hydrolase-like protein  26.98 
 
 		 346 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  24.57 
 
 		 256 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0341  hypothetical protein  24.08 
 
 		 423 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1669  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  30.71 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.77 
 
 		 594 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  26.4 
 
 		 256 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12091  hypothetical protein  28.71 
 
 		 237 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  24.57 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6273  dienelactone hydrolase  23.11 
 
 		 423 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25 
 
 		 631 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3635  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.39 
 
 		 652 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3708  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.39 
 
 		 652 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.291179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  24.57 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  24.57 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3640  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.39 
 
 		 652 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.392436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  24.57 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0456  hypothetical protein  23.08 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.891224  normal  0.426984 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4898  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.26 
 
 		 587 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  23.85 
 
 		 247 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  24.57 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1865  Carboxymethylenebutenolidase  25.49 
 
 		 242 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2210  carboxymethylenebutenolidase family protein  25.49 
 
 		 242 aa  44.3  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6348  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.11 
 
 		 629 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7177  carboxymethylenebutenolidase  26.7 
 
 		 415 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  25.79 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.86 
 
 		 610 aa  43.9  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  31.03 
 
 		 254 aa  43.5  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0092  carboxymethylenebutenolidase  25.75 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019242 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2013  peptidase  23.96 
 
 		 441 aa  43.1  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0393  hypothetical protein  23.96 
 
 		 442 aa  43.1  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>