293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2904 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2904  putative FecR  100 
 
 		 327 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.161194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  43.34 
 
 		 322 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3127  putative FecR  42.9 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.892412  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2213  putative FecR  44.3 
 
 		 325 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2233  putative FecR  42.17 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.761744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0481  putative FecR  41.35 
 
 		 327 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.133336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2206  putative FecR  38.05 
 
 		 328 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.964925  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1077  putative FecR  37.13 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428658  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4834  transmembrane sensor  39.12 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55540  transmembrane sensor  38.68 
 
 		 319 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2103  anti-FecI sigma factor, FecR  39.45 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.678011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3197  putative FecR  37.58 
 
 		 312 aa  179  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0381932  hitchhiker  0.0038104 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2218  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  31.37 
 
 		 326 aa  153  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6087  anti-FecI sigma factor, FecR  34.69 
 
 		 332 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  30.79 
 
 		 320 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  32.7 
 
 		 329 aa  124  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  27.59 
 
 		 330 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  27.88 
 
 		 334 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  30.58 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  29.22 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  28.89 
 
 		 320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  28.26 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  27.33 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  26.23 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  28.71 
 
 		 311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3576  anti-FecI sigma factor, FecR  31.8 
 
 		 314 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2195  anti-FecI sigma factor, FecR  31.56 
 
 		 314 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  26.09 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  24.77 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  29.66 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  28 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  30.77 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  28.48 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  30.06 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  31.06 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  31.39 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  30.96 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  30.43 
 
 		 326 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  28.8 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1586  anti-FecI sigma factor, FecR  29.05 
 
 		 311 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.546792  normal  0.198446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  27.48 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  31.45 
 
 		 320 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  28.72 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  28.02 
 
 		 329 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  29 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  31.1 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  27.84 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1150  anti-FecI sigma factor, FecR  27.69 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2771  transmembrane sensor  29.74 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  25.16 
 
 		 321 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  26.43 
 
 		 377 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  26.3 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  27.6 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2581  FecR protein  27.09 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175988  normal  0.154477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2338  anti-FecI sigma factor, FecR  30.14 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  29.91 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  27.51 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  29.1 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  25.55 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0122  putative FecR  27.73 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.818445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  29.17 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32720  transmembrane sensor  29.18 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3085  transmembrane sensor, putative  29.87 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  28.89 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  30.35 
 
 		 328 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  28.76 
 
 		 326 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  26.82 
 
 		 326 aa  93.2  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5130  putative FecR  30.66 
 
 		 318 aa  92.4  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.293737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3797  putative FecR  29.05 
 
 		 319 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253699  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  29.08 
 
 		 317 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  30.5 
 
 		 311 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1718  putative transmembrane sensor  29.56 
 
 		 329 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  28 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  27.71 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  29.71 
 
 		 329 aa  90.5  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  27.1 
 
 		 327 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  26.52 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  31.39 
 
 		 313 aa  90.9  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  27.16 
 
 		 320 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0737  anti-FecI sigma factor, FecR  26.92 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  25.23 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  27.58 
 
 		 335 aa  89.4  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  29.79 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  33.7 
 
 		 320 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1382  FecR family protein  27.16 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00451744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  24.85 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  30.46 
 
 		 274 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4503  putative FecR  28.96 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0323465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0896  anti-FecI sigma factor, FecR  27.36 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.823331  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0910  anti-FecI sigma factor, FecR  27.44 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697892 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0866  anti-FecI sigma factor, FecR  26.84 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3323  anti-FecI sigma factor, FecR  29.71 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  27.3 
 
 		 329 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2389  cytochrome c oxidase cbb3-type, subunit I  27.14 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.12376  hitchhiker  0.0000606712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  28.93 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4480  anti-FecI sigma factor, FecR  27.07 
 
 		 318 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.876181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  27.5 
 
 		 320 aa  86.3  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  27.01 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  29.7 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0924  putative FecR  26.87 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>