90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2789 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2789  Allergen V5/Tpx-1 related  100 
 
 		 203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0921233  normal  0.40167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6058  hypothetical protein  53.93 
 
 		 208 aa  188  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3184  SCP-like extracellular  52.68 
 
 		 218 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.14634  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2741  Allergen V5/Tpx-1 related  53.55 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446296  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2786  Allergen V5/Tpx-1 related  50.77 
 
 		 194 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3620  Allergen V5/Tpx-1 related  48.72 
 
 		 141 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.832332  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3221  SCP-like extracellular  39.1 
 
 		 169 aa  85.1  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1215  SCP-like extracellular  41.38 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2095  SCP-like extracellular  41.59 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.122143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1086  SCP-like extracellular  40.52 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4389  SCP-like extracellular  39.13 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311536  normal  0.985531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1020  SCP-like extracellular  39.83 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4689  SCP-like extracellular  34.92 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2796  SCP-like extracellular protein  38.46 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.95734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1386  Allergen V5/Tpx-1 related  33.59 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3556  Allergen V5/Tpx-1 related  35.25 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1406  Allergen V5/Tpx-1 related  32.81 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6973  hypothetical protein  34.48 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2756  hypothetical protein  34.15 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4125  SCP-like extracellular  40.87 
 
 		 161 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4004  Allergen V5/Tpx-1 related  31.97 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555051 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  36.97 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  36.97 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  34.95 
 
 		 300 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1443  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.58 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.477266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  32.21 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0159  SCP-like extracellular  31.58 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577627  normal  0.78157 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3058  SCP-like extracellular  32.48 
 
 		 169 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0142297  normal  0.0346516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  31.13 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  31.62 
 
 		 167 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  34.48 
 
 		 160 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  33.01 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1913  Allergen V5/Tpx-1 related  37.36 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  29.91 
 
 		 320 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1604  Allergen V5/Tpx-1 related  38.14 
 
 		 552 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0126507  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0940  hypothetical protein  23.95 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2003  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.66 
 
 		 140 aa  48.5  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  36 
 
 		 156 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  36 
 
 		 156 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  29.7 
 
 		 249 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  31.73 
 
 		 338 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  29 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4557  SCP-like extracellular  32.48 
 
 		 169 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313497  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  29.63 
 
 		 162 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  28.46 
 
 		 285 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  34 
 
 		 495 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0588  hypothetical protein  32.48 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2510  SCP-like extracellular  36.56 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0910  hypothetical protein  23.35 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  29.75 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  32.65 
 
 		 254 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  39.29 
 
 		 282 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  29.92 
 
 		 541 aa  45.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0749  SCP-like extracellular  32.35 
 
 		 237 aa  45.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0207585 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  29.2 
 
 		 347 aa  45.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0195  SCP-like extracellular  41.38 
 
 		 165 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2451  SCP-like extracellular  32.35 
 
 		 384 aa  45.4  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.645872  normal  0.0150957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4345  SCP-like extracellular  31.9 
 
 		 159 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0224  SCP-like extracellular  41.38 
 
 		 165 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  30.77 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  37.88 
 
 		 286 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  29 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  28.97 
 
 		 310 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  34.43 
 
 		 282 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  32.14 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  25.83 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  27.97 
 
 		 280 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  37.5 
 
 		 410 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  32.32 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1557  Allergen V5/Tpx-1 related  33.01 
 
 		 331 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  0.411468 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  25.37 
 
 		 276 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3165  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.25 
 
 		 568 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.845212  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0460  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.133435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  32.76 
 
 		 328 aa  42.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  36.36 
 
 		 288 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.75 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  29.59 
 
 		 260 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  44.19 
 
 		 293 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  35 
 
 		 294 aa  42  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3066  SCP-like extracellular  26.09 
 
 		 176 aa  42  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  25.19 
 
 		 270 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2258  SCP-like extracellular protein  37.29 
 
 		 553 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.266463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  25.19 
 
 		 275 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  25.19 
 
 		 275 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  25.19 
 
 		 263 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  25.19 
 
 		 275 aa  41.2  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  25.19 
 
 		 275 aa  41.2  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  25.19 
 
 		 275 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  30.48 
 
 		 245 aa  41.2  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  25.19 
 
 		 275 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>