More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2557 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2557  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  100 
 
 
631 aa  1266    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22051  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0704  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  36.49 
 
 
797 aa  105  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  33.96 
 
 
761 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  37.02 
 
 
842 aa  101  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  30.51 
 
 
885 aa  98.6  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  29.47 
 
 
887 aa  98.2  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  30.5 
 
 
885 aa  96.7  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  31.71 
 
 
754 aa  96.3  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3057  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  35.38 
 
 
811 aa  96.3  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118124  decreased coverage  0.000000211627 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  25.84 
 
 
874 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  34.27 
 
 
907 aa  95.9  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  40.11 
 
 
886 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  38.25 
 
 
826 aa  94.7  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1949  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.43 
 
 
868 aa  94.7  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1818  pyruvate, water dikinase  38.1 
 
 
788 aa  94  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0545713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1185  pyruvate, water dikinase  35.79 
 
 
275 aa  93.6  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3805  Pyruvate, water dikinase  34.11 
 
 
842 aa  91.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  34.63 
 
 
840 aa  91.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3918  Pyruvate, water dikinase  34.11 
 
 
842 aa  91.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4990  phosphoenolpyruvate synthase  32.57 
 
 
765 aa  91.3  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.82613  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  32.24 
 
 
788 aa  91.3  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.02 
 
 
902 aa  91.3  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  34.78 
 
 
873 aa  91.3  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  30.69 
 
 
890 aa  90.9  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  33.69 
 
 
837 aa  90.5  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1069  Pyruvate, water dikinase  37.91 
 
 
835 aa  90.9  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  24.92 
 
 
868 aa  90.5  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3011  phosphoenolpyruvate synthase  32.51 
 
 
726 aa  90.5  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000544209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  27.27 
 
 
869 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  32.35 
 
 
761 aa  89.7  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  34.95 
 
 
869 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  35.82 
 
 
867 aa  89.7  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  35.91 
 
 
810 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  29.65 
 
 
758 aa  88.6  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  29.2 
 
 
758 aa  89  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0493  pyruvate, water dikinase  38.17 
 
 
791 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0510  pyruvate, water dikinase  32.02 
 
 
334 aa  87.8  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.749276  normal  0.163777 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  29.2 
 
 
758 aa  87.4  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  27.27 
 
 
868 aa  87  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  27.27 
 
 
868 aa  87  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  28.23 
 
 
866 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  27.27 
 
 
869 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  30.19 
 
 
780 aa  85.9  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  30.9 
 
 
971 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.29 
 
 
975 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  30.84 
 
 
892 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  27 
 
 
870 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  28.71 
 
 
868 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  31.88 
 
 
799 aa  85.1  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  32.3 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  28.23 
 
 
868 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  26.79 
 
 
868 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  27.27 
 
 
868 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  32.67 
 
 
865 aa  84.7  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  36.02 
 
 
821 aa  84  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2388  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  27.54 
 
 
812 aa  84  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  28.83 
 
 
762 aa  84  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.11 
 
 
903 aa  83.2  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  32.2 
 
 
762 aa  83.2  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0441  PEP-utilising enzyme, mobile region  36.02 
 
 
963 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.299176 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  31.03 
 
 
906 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  29.3 
 
 
785 aa  82.4  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  34.43 
 
 
950 aa  82  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0607  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.15 
 
 
971 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  29.3 
 
 
825 aa  82  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  31.23 
 
 
795 aa  81.6  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  26.99 
 
 
887 aa  81.6  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  35.15 
 
 
835 aa  81.3  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  27.91 
 
 
760 aa  81.3  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  30.19 
 
 
785 aa  81.3  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3610  PEP-utilising enzyme, mobile region  37 
 
 
1240 aa  80.5  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66232  normal  0.099174 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0623  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  30.15 
 
 
971 aa  80.5  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252366  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  29.18 
 
 
891 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1574  pyruvate,water dikinase  34.29 
 
 
366 aa  80.5  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.328565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5147  phosphoenolpyruvate synthase  34.72 
 
 
414 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  31.88 
 
 
779 aa  79.3  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  28.9 
 
 
782 aa  79.3  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  29.69 
 
 
764 aa  79.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  26.32 
 
 
868 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  28.91 
 
 
871 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4240  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.5 
 
 
302 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  29.38 
 
 
781 aa  79  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  31.25 
 
 
812 aa  79  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  34.16 
 
 
795 aa  78.2  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  30.77 
 
 
810 aa  78.2  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  27.63 
 
 
757 aa  78.2  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.09 
 
 
884 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  28.7 
 
 
891 aa  78.6  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4547  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.33 
 
 
386 aa  78.2  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.529657  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  29.36 
 
 
758 aa  77.8  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1613  pyruvate, water dikinase  28.95 
 
 
854 aa  77.8  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3844  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.3 
 
 
889 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193358  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2434  Pyruvate, water dikinase  33.67 
 
 
434 aa  77  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3169  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.49 
 
 
852 aa  77  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486845  hitchhiker  0.0000002594 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0133  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  36.9 
 
 
956 aa  77  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.967311  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1867  phosphoenolpyruvate synthase  32.06 
 
 
794 aa  75.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2869  phosphoenolpyruvate synthase  31.25 
 
 
810 aa  75.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4726  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.43 
 
 
959 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0267018  normal  0.466648 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  32.06 
 
 
824 aa  76.3  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1843  phosphoenolpyruvate synthase  32 
 
 
794 aa  75.5  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>