More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0664 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
361 aa  735    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  39.89 
 
 
375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  38.78 
 
 
390 aa  239  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  36.54 
 
 
371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  34.79 
 
 
376 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  36.31 
 
 
346 aa  206  5e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 
365 aa  203  5e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  32.69 
 
 
369 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 
375 aa  192  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 
348 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  36.49 
 
 
370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  36.78 
 
 
374 aa  179  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 
393 aa  176  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  37.41 
 
 
309 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 
368 aa  149  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.51 
 
 
396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2187  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
386 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.763035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 
361 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 
399 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0755  glycosyl transferase, group 1  44.64 
 
 
420 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00665755  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
396 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  47.52 
 
 
419 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1252  GalNAc alpha-1,4-transferase  30.83 
 
 
366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  31.65 
 
 
386 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2332  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 
375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0955  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.85 
 
 
372 aa  116  5e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.512884  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.16 
 
 
386 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  44.05 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02469  putative glycosyltransferase  31.09 
 
 
379 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.43 
 
 
415 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.07 
 
 
420 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.07 
 
 
420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.86 
 
 
392 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3171  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
370 aa  113  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.86 
 
 
420 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.86 
 
 
420 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.86 
 
 
420 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  28.16 
 
 
365 aa  112  9e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  38.86 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0104  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.23 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00001508 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
364 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0115  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
358 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  28.01 
 
 
365 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
386 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02449  Glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
376 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.634775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
368 aa  106  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
374 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1269  general glycosylation pathway protein  28.46 
 
 
365 aa  106  6e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.871601  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1214  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.91 
 
 
374 aa  106  8e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0453  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  28.49 
 
 
374 aa  105  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.267053  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3984  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
356 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 
381 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3889  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
356 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1384  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.58 
 
 
373 aa  103  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  38.1 
 
 
399 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4093  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 
356 aa  102  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
396 aa  102  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0896  hypothetical protein  29.79 
 
 
393 aa  102  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.143199  hitchhiker  0.00101666 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
365 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 
1032 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4682  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.42 
 
 
356 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
762 aa  99.8  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  38.24 
 
 
384 aa  99.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4280  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
361 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
362 aa  99.4  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4335  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
361 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1179  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 
373 aa  99.4  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.383911  hitchhiker  0.00245828 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
350 aa  99.4  9e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4277  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
356 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.480153 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4553  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.729319  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1699  glycosyl transferase, group 1  35.51 
 
 
357 aa  98.6  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1385  general glycosylation pathway protein  26.88 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4472  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
356 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 
383 aa  97.4  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  35.18 
 
 
379 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0170  putative glycosyl transferase, group 1  26.28 
 
 
384 aa  96.7  5e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13013  wlae protein  28.15 
 
 
321 aa  96.7  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
409 aa  97.1  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  39.57 
 
 
359 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  36.6 
 
 
384 aa  96.3  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
377 aa  96.3  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4332  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 
356 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3024  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
356 aa  95.9  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4475  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
361 aa  95.5  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.921087 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0113  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
361 aa  94.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1409  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3987  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 
361 aa  94  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0634164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3895  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 
361 aa  94  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  38.73 
 
 
490 aa  94  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  38.73 
 
 
490 aa  94  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1216  general glycosylation pathway protein  28.91 
 
 
358 aa  93.6  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  28.19 
 
 
359 aa  93.6  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
403 aa  93.2  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
357 aa  92.8  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3700  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
366 aa  92.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14750  glycosyltransferase  36.57 
 
 
743 aa  92.4  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00041718 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1772  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 
359 aa  92  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4099  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
361 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.342089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
403 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>