More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2380 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 316 aa  634    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  99.05 
 
 		 316 aa  627  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  91.77 
 
 		 316 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  80.7 
 
 		 316 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  72.76 
 
 		 314 aa  445  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  71.66 
 
 		 345 aa  431  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  71.52 
 
 		 316 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  70.89 
 
 		 316 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  62.01 
 
 		 327 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  65.36 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  62.66 
 
 		 327 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  63.73 
 
 		 329 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  64.05 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  64.05 
 
 		 330 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  64.05 
 
 		 330 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  63.07 
 
 		 329 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  63.07 
 
 		 329 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  63.07 
 
 		 329 aa  362  6e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  64.05 
 
 		 329 aa  361  9e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  60.38 
 
 		 320 aa  360  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  62.75 
 
 		 330 aa  355  5e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  62.75 
 
 		 330 aa  355  5e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  61.44 
 
 		 330 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  57.38 
 
 		 312 aa  351  8.999999999999999e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  62.46 
 
 		 329 aa  347  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  60.26 
 
 		 329 aa  346  4e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  57.7 
 
 		 319 aa  339  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  57.19 
 
 		 317 aa  339  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  57.28 
 
 		 314 aa  337  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  57.37 
 
 		 324 aa  322  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  57.09 
 
 		 306 aa  322  7e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  56.39 
 
 		 315 aa  316  4e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  54.19 
 
 		 340 aa  315  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  50.32 
 
 		 319 aa  311  7.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  36.6 
 
 		 313 aa  231  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.39 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  42.95 
 
 		 317 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.01 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.3 
 
 		 320 aa  203  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  40.32 
 
 		 329 aa  186  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  40.51 
 
 		 320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  40.39 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  40.6 
 
 		 326 aa  166  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  41.38 
 
 		 344 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  36.42 
 
 		 319 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  42.47 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  36.88 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  36.71 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  39.53 
 
 		 301 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  38.67 
 
 		 320 aa  148  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  38.11 
 
 		 314 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  37.99 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  37.67 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  39.29 
 
 		 323 aa  142  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  32.09 
 
 		 322 aa  142  9e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  30.45 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  40.15 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  36.16 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  39.33 
 
 		 320 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  36.84 
 
 		 318 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.12 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  40.76 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.51 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  27.56 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  33.45 
 
 		 298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  34.62 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 		 315 aa  123  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.48 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  33.01 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  33.01 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  34.15 
 
 		 326 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  30.12 
 
 		 628 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  31.89 
 
 		 645 aa  123  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  32.31 
 
 		 320 aa  122  9e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  29.81 
 
 		 628 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  32.9 
 
 		 309 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  34.69 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  33.55 
 
 		 343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.94 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  32.14 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  31.82 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  33.95 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  35.4 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  30.88 
 
 		 347 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  35.99 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  31.83 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  33.21 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  35.92 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  34.73 
 
 		 311 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.35 
 
 		 322 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  27.83 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  30.6 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  30.89 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  29.79 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  31.95 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  33.46 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>