More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0635 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0635  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 181 aa  370  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00101027  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4785  Sel1 domain protein repeat-containing protein  90.06 
 
 		 181 aa  304  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4839  Sel1 domain-containing protein  90.06 
 
 		 181 aa  303  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4661  Sel1 domain-containing protein  89.5 
 
 		 181 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.150722  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4343  Sel1 repeat-containing protein  74.32 
 
 		 182 aa  273  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12370  hypothetical protein  73.77 
 
 		 182 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4948  Sel1 repeat-containing protein  76.63 
 
 		 184 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.962981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4802  hypothetical protein  73.77 
 
 		 182 aa  255  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3776  Sel1 domain-containing protein  68.85 
 
 		 182 aa  236  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.17848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1130  hypothetical protein  72.68 
 
 		 182 aa  234  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09250  tetratricopeptide TPR-like helical protein  66.85 
 
 		 181 aa  233  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  36.79 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.11 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  40.48 
 
 		 2413 aa  67  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  33.62 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  32.17 
 
 		 295 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  40.86 
 
 		 789 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  32.26 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  39.5 
 
 		 448 aa  64.7  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.19 
 
 		 231 aa  64.3  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  39.58 
 
 		 274 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  40.79 
 
 		 850 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  33.62 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  34.75 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  41.11 
 
 		 831 aa  62.8  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  36.51 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  38.2 
 
 		 552 aa  61.6  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  42.67 
 
 		 961 aa  61.2  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  46.25 
 
 		 490 aa  61.2  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  32.98 
 
 		 303 aa  61.2  0.000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.98 
 
 		 1344 aa  61.2  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  46.25 
 
 		 490 aa  60.8  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  33.85 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  37.63 
 
 		 817 aa  60.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  43.06 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  44.74 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  30.3 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  39.33 
 
 		 684 aa  59.3  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.3 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  36.67 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.2 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1402 aa  58.5  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1992  Sel1 repeat-containing protein  37.62 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.722061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  31.47 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  31.82 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  40 
 
 		 1475 aa  58.2  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  38.71 
 
 		 1877 aa  57.8  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  29.32 
 
 		 344 aa  57.8  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  34.95 
 
 		 722 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  34.95 
 
 		 722 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0326  Sel1 domain-containing protein  29.41 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452789  normal  0.538319 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  41.89 
 
 		 647 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  34.95 
 
 		 722 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  37.86 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  32.84 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  34.88 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  34.88 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  35.92 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0483  Sel1 domain-containing protein  42.11 
 
 		 511 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0431486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  34.71 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  34.95 
 
 		 722 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2980  Sel1 domain-containing protein  31.62 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.456006 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00376  hypothetical protein  27.69 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0626977  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3857  Sel1 domain-containing protein  40.79 
 
 		 511 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.277473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0460  hypothetical protein  27.69 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392011  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0500  hypothetical protein  27.69 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113871  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1107  hypothetical protein  36.63 
 
 		 935 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.489454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  28.12 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  34.34 
 
 		 380 aa  55.5  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.15 
 
 		 565 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0462  Sel1 domain-containing protein  42.11 
 
 		 511 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.781261  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00380  hypothetical protein  35.23 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.067351  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  32.52 
 
 		 1493 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  33.88 
 
 		 509 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  37.08 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  32.79 
 
 		 971 aa  54.7  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  38.3 
 
 		 438 aa  54.7  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0465  hypothetical protein  29.23 
 
 		 311 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.730407 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  35.51 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.37 
 
 		 528 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 303 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  37.37 
 
 		 380 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  35.56 
 
 		 425 aa  54.3  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.79 
 
 		 971 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 321 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  35.56 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  32.67 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  33.06 
 
 		 509 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0486  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.79 
 
 		 511 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.96 
 
 		 270 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1323  hypothetical protein  34.41 
 
 		 765 aa  53.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  36.59 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.48 
 
 		 318 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  33.91 
 
 		 1281 aa  52.8  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  35.48 
 
 		 1002 aa  52.4  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  34.41 
 
 		 509 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  32.98 
 
 		 264 aa  52.4  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1905  sporulation related  32.26 
 
 		 396 aa  52.4  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.17994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  32.03 
 
 		 505 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.08 
 
 		 380 aa  52  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>