196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2343 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2343  amidohydrolase 2  100 
 
 		 275 aa  557  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2198  amidohydrolase 2  92 
 
 		 275 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  78.55 
 
 		 275 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  59.64 
 
 		 277 aa  338  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2095  amidohydrolase 2  55.64 
 
 		 279 aa  309  2.9999999999999997e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.815791 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  56.93 
 
 		 276 aa  303  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  37.5 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4044  amidohydrolase 2  35.45 
 
 		 306 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.814165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3931  amidohydrolase 2  35.45 
 
 		 306 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.788161 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0351  hydrolase  37.45 
 
 		 296 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0775  amidohydrolase 2  35.14 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1802  amidohydrolase family protein  37.45 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0947  hydrolase  37.45 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  33.95 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  32.23 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0433  hydrolase  37.45 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0212  hydrolase  37.45 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1392  amidohydrolase family protein  37.45 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  33.82 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  32.21 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1094  hydrolase  35.84 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0929655  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  32.97 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  32.97 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  33.33 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  34.3 
 
 		 289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  34.93 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_003296  RS05190  hydrolase transmembrane protein  34.69 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.208018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  32.45 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  30.22 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  33.94 
 
 		 281 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4021  amidohydrolase 2  34.93 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  31.85 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  30.4 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  31.48 
 
 		 304 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  32.59 
 
 		 330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  32.59 
 
 		 368 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4148  amidohydrolase 2  33.21 
 
 		 297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.476568 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  32.59 
 
 		 330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  32.59 
 
 		 330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  32.59 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  32.59 
 
 		 327 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  32.59 
 
 		 330 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  29.15 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  31.72 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  33.21 
 
 		 308 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  29.04 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1887  amidohydrolase family protein  37.77 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  33.21 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  31.88 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5192  amidohydrolase 2  34.3 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.653147  normal  0.0614546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  31.62 
 
 		 303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  31.23 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  33.21 
 
 		 290 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  29.63 
 
 		 306 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  34.57 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  34.53 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1296  amidohydrolase 2  31.62 
 
 		 277 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  28.46 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2797  amidohydrolase 2  30.4 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  27.34 
 
 		 312 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4454  amidohydrolase 2  36 
 
 		 304 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259325 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  28.62 
 
 		 312 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  28.25 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  28.21 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  32.59 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  32.59 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  28.52 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  30.11 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  29.74 
 
 		 321 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  28.95 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  32.14 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  27.56 
 
 		 320 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  32 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  29.78 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  29.78 
 
 		 275 aa  102  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  29.26 
 
 		 282 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  28.62 
 
 		 271 aa  102  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  32.72 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  29.41 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  28.32 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  28.62 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  31.11 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  28.15 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  27.44 
 
 		 327 aa  99  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  28.41 
 
 		 301 aa  99  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  27.74 
 
 		 272 aa  98.6  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 285 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  29.47 
 
 		 325 aa  95.9  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  29.89 
 
 		 296 aa  95.5  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  26.71 
 
 		 304 aa  95.5  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  28.52 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  29.35 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0971  amidohydrolase 2  30.04 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.675021  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  31.17 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  25.99 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  29.96 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  26.33 
 
 		 314 aa  92.8  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  30.77 
 
 		 297 aa  92.8  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  25.99 
 
 		 312 aa  92.4  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  27.9 
 
 		 287 aa  92.4  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>