236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1208 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1208  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 366 aa  760    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.139759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0492  transport protein  57.3 
 
 		 369 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0468  ABC transport protein  58.36 
 
 		 372 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1074  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  30.36 
 
 		 358 aa  163  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5951  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 382 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5429  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.485743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1540  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  24.93 
 
 		 353 aa  103  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713242  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5813  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 376 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1360  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  24.66 
 
 		 377 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0349752 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3878  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 376 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4491  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 376 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3242  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 340 aa  96.7  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2187  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  28.28 
 
 		 316 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4390  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243685  normal  0.0624884 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3926  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.808306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4157  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 		 374 aa  90.1  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194913  normal  0.672619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2390  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  24.23 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.951238 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1180  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.43 
 
 		 349 aa  86.3  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1182  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.43 
 
 		 349 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.69652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1378  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.43 
 
 		 349 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00178306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1204  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 349 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1401  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.43 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1340  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.51 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1442  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.51 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.403507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4004  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  26.2 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000629977 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1202  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  27.64 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1300  spermidine/putrescine ABC transporter spermidine/putrescine-binding protein  27.64 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1010  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3366  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  24.14 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.424876  normal  0.320471 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3572  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like  24.66 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2234  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  23.1 
 
 		 377 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3216  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.018285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0892  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.388428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1703  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 398 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8157  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  24.85 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1769  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1330  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3076  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 		 351 aa  69.3  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574821 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1364  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0148  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.934394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0569  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.416765  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4308  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00256094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0132  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  22.94 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3308  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3847  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0747  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.389252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1534  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  23.1 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0863  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0124  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.996565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2583  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000231381  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1927  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.96322  hitchhiker  0.000000194914 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6036  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.62779 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2302  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 360 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3040  ABC permidine/putrescine transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.13 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276128  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3798  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.727469  normal  0.354571 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3635  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.248377 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0326  extracellular solute-binding protein family 1  22.1 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00599972  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2444  extracellular solute-binding protein family 1  22.51 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.512848  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3622  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.360569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2577  extracellular solute-binding protein  24.77 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3851  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0852756  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5285  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  22.71 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1486  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  22.16 
 
 		 381 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0980554 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0894  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2346  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 382 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00216942 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1048  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357098  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1938  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor  24.62 
 
 		 360 aa  56.6  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2816  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.293576  normal  0.888288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0386  periplasmic polyamine binding protein  22.34 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5429  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0960815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1052  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  23.31 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2045  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.42 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.600032  hitchhiker  0.000000000000249454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3274  extracellular solute-binding protein  22.77 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0910  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1454  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25.08 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01397  predicted spermidine/putrescine transporter subunit  23.12 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2206  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.313197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01408  hypothetical protein  23.12 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1524  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.12 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2219  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3767  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1619  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.12 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1734  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.12 
 
 		 381 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000404923 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1221  extracellular solute-binding protein family 1  22.11 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4132  extracellular solute-binding protein  21.62 
 
 		 383 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003485  ABC transporter periplasmic spermidine putrescine-binding protein PotD  24.09 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00749522  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4236  extracellular solute-binding protein  21.86 
 
 		 383 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3636  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 343 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.93135  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1408  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 336 aa  53.5  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.121808  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3297  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 348 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1064  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 373 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03855  periplasmic polyamine binding protein  23 
 
 		 353 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4664  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 348 aa  53.1  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0403055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4447  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 348 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.415415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3377  extracellular solute-binding protein family 1  24.9 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0107966  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3919  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 348 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3608  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 348 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2128  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 381 aa  53.1  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.205497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2913  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 363 aa  52.8  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>