More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0455 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0312  Sigma 54 interacting domain protein  61.85 
 
 
934 aa  1160    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2475  sigma-54 dependent transcriptional regulator  65.15 
 
 
903 aa  1196    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.198348  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0330  putative phytochrome sensor protein  61.85 
 
 
925 aa  1151    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0176  transcriptional regulator  52.5 
 
 
940 aa  968    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.544454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0763  putative GAF sensor protein  64.49 
 
 
936 aa  1201    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0551  putative GAF sensor protein  65.19 
 
 
937 aa  1223    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0455  putative GAF sensor protein  100 
 
 
937 aa  1919    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.704561  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3326  putative phytochrome sensor protein  68.2 
 
 
935 aa  1285    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1152  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  32.43 
 
 
534 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0929318 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0282  transcriptional regulator NifA  30.16 
 
 
525 aa  174  7.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.262632  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0684  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.66 
 
 
456 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1311  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  31.68 
 
 
538 aa  172  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0530064  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4849  NifA subfamily transcriptional regulator  33.85 
 
 
566 aa  171  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.728864 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08281  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family protein  40.43 
 
 
388 aa  169  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1527  Nif-specific regulatory protein  32.02 
 
 
545 aa  169  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1244  transcriptional regulator, NifA, Fis Family  32.02 
 
 
545 aa  169  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.771278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4669  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  31.68 
 
 
533 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1028  response regulator receiver protein  35.1 
 
 
439 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163891  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2084  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  36.52 
 
 
477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2442  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.89 
 
 
480 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1981  two-component response regulator, sigma-54 related  39.74 
 
 
448 aa  166  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472322  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0183  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.94 
 
 
387 aa  165  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2207  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.62 
 
 
653 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000576072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0445  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.04 
 
 
481 aa  165  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2242  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.91 
 
 
464 aa  165  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.719582 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2176  NifA subfamily transcriptional regulator  31.43 
 
 
531 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000386185  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1788  sigma-54 factor, interaction region  34.9 
 
 
542 aa  165  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.337598  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51000  Nif-specific sigma54-dependent transcriptional activator protein, NifA  34.08 
 
 
522 aa  165  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.519777  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0734  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  36.3 
 
 
477 aa  165  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.942918  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0246  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  38.91 
 
 
469 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.487777  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0446  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.04 
 
 
481 aa  165  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01588  two-component system, response regulator  38.37 
 
 
464 aa  164  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.396226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0417  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.4 
 
 
474 aa  164  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.45134  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4144  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  38.02 
 
 
477 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1624  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  31.67 
 
 
561 aa  164  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.714408  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0356  putative two component response regulator  38.98 
 
 
492 aa  164  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3561  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  31.82 
 
 
469 aa  163  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.36 
 
 
457 aa  163  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2533  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.19 
 
 
483 aa  163  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1326  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.19 
 
 
485 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3475  anaerobic nitric oxide reductase transcription regulator  32.21 
 
 
529 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.232815  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0257  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  31.75 
 
 
471 aa  163  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000519324 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0764  transcriptional regulator NifA  32.87 
 
 
511 aa  162  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0352  nitrogen regulation protein NR(I)  38.22 
 
 
478 aa  162  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4822  helix-turn-helix, Fis-type:nitrogen regulation protein NR(I)  38.22 
 
 
478 aa  162  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5047  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.7 
 
 
387 aa  162  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0366  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  30.89 
 
 
508 aa  162  3e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0415  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  36.92 
 
 
478 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.855382 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0766  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  38.64 
 
 
477 aa  162  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2629  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.19 
 
 
483 aa  162  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14604  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2429  NifA subfamily transcriptional regulator  32.03 
 
 
522 aa  162  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0629809 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2901  nitrogen regulation protein NR(I)  33.23 
 
 
468 aa  162  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2519  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis Family  33.23 
 
 
468 aa  162  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.74 
 
 
481 aa  161  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0371  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  31.36 
 
 
470 aa  161  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.160254  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2200  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.75 
 
 
459 aa  162  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2554  type 4 fimbriae expression regulatory protein PilR  39.76 
 
 
452 aa  161  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0258  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  32.42 
 
 
469 aa  162  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1328  hitchhiker  0.00000193209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3968  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.08 
 
 
452 aa  161  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.175456  normal  0.229204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1811  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.59 
 
 
474 aa  161  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.053001 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1869  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.23 
 
 
464 aa  161  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0339  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  38.22 
 
 
478 aa  161  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3581  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.48 
 
 
490 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0374719 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3764  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  32.42 
 
 
471 aa  161  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2777  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  41.67 
 
 
516 aa  161  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0285959 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3203  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  38.4 
 
 
493 aa  160  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0512  transcriptional regulator, NifA, Fis Family  33.15 
 
 
524 aa  160  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1954  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.23 
 
 
464 aa  160  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.611403  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1701  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  36.19 
 
 
514 aa  160  9e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0309772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5101  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  36.56 
 
 
478 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26490  sigma54-dependent activator protein  31.81 
 
 
485 aa  160  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.593646  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1748  transcriptional regulator, NifA, Fis Family  28.99 
 
 
542 aa  160  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0508  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  30.89 
 
 
495 aa  160  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3211  transcriptional regulator, NifA, Fis Family  31.02 
 
 
535 aa  160  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2982  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  37.94 
 
 
520 aa  160  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3615  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.88 
 
 
383 aa  160  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.176603 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.65 
 
 
466 aa  160  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1010  NifA subfamily transcriptional regulator  29.7 
 
 
510 aa  160  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4753  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  41.26 
 
 
557 aa  160  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.050677  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2966  transcriptional regulator NifA  29.68 
 
 
515 aa  160  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0282  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  31.79 
 
 
471 aa  159  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.675957  hitchhiker  0.000000421571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5048  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  36.2 
 
 
478 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4472  nitrogen regulation protein NR(I)  32.42 
 
 
471 aa  159  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2061  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.11 
 
 
442 aa  159  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4923  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  36.2 
 
 
478 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.924842  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1347  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  29.81 
 
 
1082 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0220  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  32.57 
 
 
599 aa  159  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.205881  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0320  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  31.95 
 
 
470 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67680  two-component response regulator NtrC  38.22 
 
 
476 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000437551  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3648  transcriptional regulator, NifA, Fis Family  33.17 
 
 
576 aa  159  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.4281 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0058  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.28 
 
 
449 aa  159  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0148  sigma-54-dependent transcriptional regulator  39.57 
 
 
417 aa  159  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2500  two component Fis family transcriptional regulator  37.72 
 
 
476 aa  159  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03965  two-component system regulatory protein  37.63 
 
 
448 aa  159  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5859  two-component response regulator NtrC  38.22 
 
 
476 aa  159  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1295  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.07 
 
 
457 aa  159  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.62254e-16 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3458  nitrogen regulation protein NR(I)  32.93 
 
 
466 aa  159  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00165612  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3091  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.4 
 
 
457 aa  159  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0917  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.93 
 
 
568 aa  159  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3427  response regulator receiver protein  32.74 
 
 
470 aa  159  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.234711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>