More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3211 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3211  transcriptional regulator, NifA, Fis Family  100 
 
 
535 aa  1043    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.050202  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3032  NifA subfamily transcriptional regulator  63.16 
 
 
532 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1527  Nif-specific regulatory protein  44.71 
 
 
545 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1244  transcriptional regulator, NifA, Fis Family  44.71 
 
 
545 aa  426  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.771278 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1445  transcriptional regulator NifA  43.04 
 
 
572 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0161309 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1372  transcriptional regulator NifA  40.85 
 
 
593 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1570  transcriptional regulator NifA  42.43 
 
 
569 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal  0.572476 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3648  transcriptional regulator, NifA, Fis Family  42.16 
 
 
576 aa  395  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.4281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5933  NifA subfamily transcriptional regulator  41.32 
 
 
580 aa  395  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4475  transcriptional regulator NifA  41.07 
 
 
580 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.391339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0957  transcriptional regulator NifA  41.61 
 
 
583 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1061  transcriptional regulator NifA  40.61 
 
 
582 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.798583  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5113  transcriptional regulator, NifA, Fis Family  40.79 
 
 
584 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3529  transcriptional regulator NifA  41.08 
 
 
608 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0603248  normal  0.0582265 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0393  transcriptional regulator NifA  39.4 
 
 
627 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2966  transcriptional regulator NifA  43.77 
 
 
515 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0082  transcriptional regulator NifA  40.46 
 
 
597 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.765061 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1785  NifA subfamily transcriptional regulator  40.19 
 
 
507 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1577  transcriptional regulator, NifA, Fis Family  41.74 
 
 
581 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1010  NifA subfamily transcriptional regulator  40.75 
 
 
510 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4004  transcriptional regulator, NifA, Fis Family  41.13 
 
 
599 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51000  Nif-specific sigma54-dependent transcriptional activator protein, NifA  43.04 
 
 
522 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.519777  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7728  transcriptional regulator NifA  41.3 
 
 
547 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0594  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  40.56 
 
 
529 aa  364  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00846378  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1146  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  43.16 
 
 
522 aa  363  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0993  transcriptional regulator NifA  39.04 
 
 
600 aa  363  4e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0512  transcriptional regulator, NifA, Fis Family  43.71 
 
 
524 aa  363  4e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0282  transcriptional regulator NifA  43.54 
 
 
525 aa  363  5.0000000000000005e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.262632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0570  NifA subfamily transcriptional regulator  42.29 
 
 
508 aa  363  5.0000000000000005e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.106051  normal  0.50757 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2528  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  40.28 
 
 
579 aa  346  7e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1228  Fis family transcriptional regulator  34.46 
 
 
549 aa  342  7e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1625  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  35.45 
 
 
544 aa  343  7e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0165781  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49020  sigma54-dependent transcriptional activator for the iron only nitrogenase, AnfA  38.01 
 
 
537 aa  340  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1487  helix-turn-helix, Fis-type:Nif-specific regulatory protein  40.04 
 
 
549 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.659732 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1920  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  34.42 
 
 
543 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0127788  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1204  transcriptional regulator NifA  40.69 
 
 
550 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.132443  hitchhiker  0.00777378 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0764  transcriptional regulator NifA  41.18 
 
 
511 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1527  Fis family transcriptional regulator  34.55 
 
 
537 aa  334  2e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2617  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  42.55 
 
 
535 aa  333  4e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0884  NifA subfamily transcriptional regulator  38.29 
 
 
539 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.871675 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1157  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  33.77 
 
 
502 aa  333  4e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02780  vanadium nitrogenase sigma54-dependent transcriptional activator, VnfA  43.71 
 
 
522 aa  333  6e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274487  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1624  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  38.18 
 
 
561 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.714408  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1388  NifA subfamily transcriptional regulator  38.98 
 
 
533 aa  332  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0689  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  33.39 
 
 
544 aa  329  8e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.430174  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1748  transcriptional regulator, NifA, Fis Family  34.23 
 
 
542 aa  326  7e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26490  sigma54-dependent activator protein  39.51 
 
 
485 aa  326  7e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.593646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1919  Fis family transcriptional regulator  32.85 
 
 
545 aa  323  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0547  NifA subfamily transcriptional regulator  38.7 
 
 
581 aa  316  8e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.202829  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2198  transcriptional regulator NifA  38.7 
 
 
581 aa  316  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6232  transcriptional regulator NifA  37.82 
 
 
541 aa  313  6.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0965  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  38.81 
 
 
546 aa  313  6.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.17468 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0608  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  36.2 
 
 
527 aa  312  9e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000979337 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1240  transcriptional regulator NifA  39.51 
 
 
582 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0431383  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1311  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  39.24 
 
 
538 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0530064  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2207  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  36.04 
 
 
539 aa  303  7.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1152  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  39.05 
 
 
534 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0929318 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1635  Fis family transcriptional regulator  36.4 
 
 
576 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.980236  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1219  NifA subfamily transcriptional regulator  35.53 
 
 
529 aa  300  6e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.832328  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2176  NifA subfamily transcriptional regulator  38.25 
 
 
531 aa  299  7e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000386185  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4669  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  38.65 
 
 
533 aa  299  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0366  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  36.35 
 
 
508 aa  298  2e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0831  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  36.03 
 
 
517 aa  295  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0724194  normal  0.196373 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33440  sigma54-dependent activator protein  37.86 
 
 
493 aa  295  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4389  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  51.17 
 
 
495 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205713  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47100  sigma54-dependent activator protein  37.41 
 
 
517 aa  294  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4925  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  48.24 
 
 
360 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0168  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  48.37 
 
 
459 aa  294  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.564625  normal  0.730975 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2442  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  47.63 
 
 
480 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2629  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.93 
 
 
483 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14604  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1326  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  47.93 
 
 
485 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4849  NifA subfamily transcriptional regulator  41.69 
 
 
566 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.728864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1635  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.51 
 
 
457 aa  291  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2533  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.63 
 
 
483 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1032  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.97 
 
 
461 aa  290  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.454426 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0050  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  47.83 
 
 
515 aa  290  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0532507 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3407  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.86 
 
 
458 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2200  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.88 
 
 
459 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3111  NifA subfamily transcriptional regulator  36.12 
 
 
547 aa  287  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2591  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  46.63 
 
 
457 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.313706  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1397  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  45.1 
 
 
458 aa  286  9e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1505  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  33.72 
 
 
522 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.034794  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0035  NifA subfamily transcriptional regulator  34.92 
 
 
564 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1510  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.44 
 
 
448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0372  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  43.08 
 
 
461 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2678  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  46.15 
 
 
457 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4240  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  49.28 
 
 
469 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4192  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.48 
 
 
454 aa  282  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00227342  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1287  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.36 
 
 
452 aa  281  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.541874  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4373  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  49.28 
 
 
469 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1385  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  47.93 
 
 
460 aa  281  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4396  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  49.28 
 
 
469 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3158  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  42.07 
 
 
462 aa  279  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3599  two component Fis family transcriptional regulator  45.4 
 
 
459 aa  279  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  45.7 
 
 
459 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0538681  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5044  transcriptional regulator, Fis family  43.36 
 
 
361 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000694611  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0427  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.32 
 
 
458 aa  276  7e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1430  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  41.42 
 
 
461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.324678  hitchhiker  0.00137179 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3903  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.4 
 
 
455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000574971 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2369  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  41.42 
 
 
461 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0790211  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>