More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0186 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0186  type II secretion system protein E  100 
 
 		 360 aa  736    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301874  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0202  type II secretion system protein E  84.85 
 
 		 199 aa  344  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.277035 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  43.65 
 
 		 477 aa  296  5e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0639  type II secretion system protein E  45.37 
 
 		 571 aa  295  9e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2705  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.67 
 
 		 575 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3108  type II secretion system protein E  44.77 
 
 		 573 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.275217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.78 
 
 		 577 aa  293  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.61 
 
 		 577 aa  293  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  48.62 
 
 		 515 aa  292  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3070  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.38 
 
 		 575 aa  292  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2034  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.12 
 
 		 577 aa  291  9e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.226289  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  48.12 
 
 		 471 aa  291  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2825  type IV pilus assembly protein  44.09 
 
 		 575 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00509282  normal  0.0351792 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0550  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.67 
 
 		 574 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  43.49 
 
 		 566 aa  289  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2960  type II secretion system protein E  44.54 
 
 		 586 aa  288  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548556  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3527  type IV fimbrial biogenesis protein,PilB  48.61 
 
 		 419 aa  288  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.54 
 
 		 568 aa  288  9e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  47.09 
 
 		 520 aa  288  9e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5488  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.81 
 
 		 580 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.388204  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2370  type IV pilus assembly protein, PilB  44.48 
 
 		 571 aa  288  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.881077  normal  0.0893992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.36 
 
 		 568 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0509  pilus biogenesis ATPase  44.78 
 
 		 572 aa  287  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0385141 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  45.15 
 
 		 558 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  48.3 
 
 		 495 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  48.3 
 
 		 497 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  48.3 
 
 		 497 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  48.3 
 
 		 497 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  48.3 
 
 		 497 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  48.3 
 
 		 497 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2114  pilus biogenesis protein  43.24 
 
 		 577 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  48.3 
 
 		 497 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  48.3 
 
 		 497 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.95 
 
 		 568 aa  286  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2902  type II secretion system protein E  44.21 
 
 		 577 aa  286  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0504  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  46.73 
 
 		 431 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823394  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  48.3 
 
 		 522 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0777  hypothetical protein  49.84 
 
 		 481 aa  286  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.336131 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  48.3 
 
 		 499 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  45.33 
 
 		 497 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0665  hypothetical protein  47.11 
 
 		 473 aa  286  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0805  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.93 
 
 		 577 aa  286  5e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  48.61 
 
 		 498 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2655  type II secretion system protein E  46.31 
 
 		 432 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  48.61 
 
 		 499 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0768  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.11 
 
 		 577 aa  285  7e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  48.3 
 
 		 499 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  48.3 
 
 		 499 aa  285  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  47.04 
 
 		 571 aa  285  7e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  43.07 
 
 		 568 aa  285  8e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1044  type II secretion system protein E  46.55 
 
 		 482 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  48.3 
 
 		 499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  43.36 
 
 		 568 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  42.77 
 
 		 579 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0766  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.12 
 
 		 578 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.59759  normal  0.16115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  48.3 
 
 		 499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4179  type II secretion system protein E  46.55 
 
 		 482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.262241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4820  type II secretion system protein E  43.47 
 
 		 566 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0841  type II secretion system protein E  43.82 
 
 		 578 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0657263  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.81 
 
 		 569 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.67 
 
 		 549 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.36 
 
 		 568 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  43.79 
 
 		 557 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  43.66 
 
 		 591 aa  283  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.36 
 
 		 568 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1136  type II/IV secretion system protein  47.99 
 
 		 423 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3506  type IV pilus biogenesis protein PilB  47.99 
 
 		 407 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1072  general secretory pathway protein E  48.57 
 
 		 463 aa  282  5.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.538099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1047  type II secretion system protein E  46.08 
 
 		 483 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3680  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.81 
 
 		 578 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.48 
 
 		 578 aa  282  6.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1413  general secretory pathway protein E  44.79 
 
 		 498 aa  281  8.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1088  type II secretion system protein E  46.08 
 
 		 482 aa  281  9e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  43.62 
 
 		 561 aa  281  9e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1311  type II/IV secretion system protein  47.99 
 
 		 407 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  44.08 
 
 		 556 aa  281  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2531  type II/IV secretion system protein  47.99 
 
 		 419 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3531  type IV pilus biogenesis protein PilB  47.99 
 
 		 407 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3251  type II/IV secretion system protein  47.99 
 
 		 407 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1330  type II secretion system protein E  49.84 
 
 		 474 aa  281  1e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0453  type II/IV secretion system protein  47.99 
 
 		 407 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0163  hypothetical protein  45.35 
 
 		 461 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104571  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.78 
 
 		 569 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0755  general secretory pathway protein E  44.79 
 
 		 469 aa  281  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  47.15 
 
 		 469 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  46.08 
 
 		 468 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  46.69 
 
 		 484 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  44.44 
 
 		 520 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.92 
 
 		 569 aa  280  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2818  type II secretion system protein E  47.77 
 
 		 455 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.016239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.98 
 
 		 563 aa  280  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  45.05 
 
 		 523 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0156  hypothetical protein  45.35 
 
 		 461 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.836049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0157  hypothetical protein  45.35 
 
 		 461 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.208845 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0155  hypothetical protein  45.35 
 
 		 461 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  45.09 
 
 		 498 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  45.57 
 
 		 520 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  44.41 
 
 		 554 aa  280  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.79 
 
 		 562 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  47.15 
 
 		 469 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>