More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0244 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  100 
 
 		 253 aa  526  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  30.49 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  30.49 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  31.84 
 
 		 236 aa  92.8  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1413  yecA family protein  31.56 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3093  yecA family protein  33.2 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.062887  normal  0.759909 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0342  SEC-C motif domain protein  28.99 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0940465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0353  SecC motif-containing protein  28.99 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  27.87 
 
 		 432 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0706  yecA family protein  28.57 
 
 		 314 aa  72  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  26.83 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1895  YgfB and YecA  28.69 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0804  YecA  29.53 
 
 		 283 aa  70.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1306  hypothetical protein  30.05 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  hitchhiker  0.00000000164009 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2153  hypothetical protein  30.05 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000183931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2093  hypothetical protein  30.05 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.228892  hitchhiker  0.0000586575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2100  hypothetical protein  30.05 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.45396e-18 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2490  hypothetical protein  30.59 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1183  hypothetical protein  31.94 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.022199  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3722  SecC motif-containing protein  25.42 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000837198  decreased coverage  0.00531296 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2224  YgfB and YecA  27.24 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.358802 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  26.81 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  22.93 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0426  SecC motif-containing protein  26.47 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1735  yecA family protein  27.92 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000279922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  28.14 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1728  hypothetical protein  27.92 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000258214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2006  hypothetical protein  27.92 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000852324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2141  hypothetical protein  27.92 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1275  hypothetical protein  27.92 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000031022  hitchhiker  0.000229612 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2648  hypothetical protein  28.57 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.265395  hitchhiker  0.000000180818 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01876  conserved metal-binding protein  28.16 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000425313  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01865  hypothetical protein  28.16 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000280044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  28.64 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1035  hypothetical protein  27.76 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000463904  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  86.21 
 
 		 864 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  27.43 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5710  SecC motif-containing protein  25.21 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  67.65 
 
 		 917 aa  62.4  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0943  yecA family protein  27.44 
 
 		 254 aa  62  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4482  SecC motif-containing protein  25.65 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  26.21 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  76.67 
 
 		 909 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  67.65 
 
 		 859 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  73.33 
 
 		 907 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  67.65 
 
 		 834 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  85.19 
 
 		 896 aa  60.1  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  80 
 
 		 844 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  88 
 
 		 897 aa  60.1  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  73.33 
 
 		 907 aa  60.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  70.97 
 
 		 908 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  70.97 
 
 		 888 aa  59.7  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  78.57 
 
 		 896 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  88 
 
 		 848 aa  59.3  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3702  SecA-related metal-binding protein  27.14 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.569831 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  84.62 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  88 
 
 		 910 aa  59.3  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  91.3 
 
 		 866 aa  59.3  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  80.77 
 
 		 912 aa  58.9  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  88 
 
 		 836 aa  58.9  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  68.75 
 
 		 903 aa  58.5  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4211  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 908 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0495  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 909 aa  58.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000941581  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  68.75 
 
 		 907 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  38.55 
 
 		 980 aa  57.8  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  24.14 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3562  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 908 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000100986  hitchhiker  0.00000109112 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0394  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 908 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000626619  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3735  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 908 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000386708  hitchhiker  0.00000368272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 907 aa  57.4  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 908 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0409  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 908 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000766764  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0410  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 908 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000668842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0435  preprotein translocase subunit SecA  70 
 
 		 911 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000241961  hitchhiker  0.0000000033715 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  80.77 
 
 		 837 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  24.68 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 		 903 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  73.33 
 
 		 922 aa  57  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  75 
 
 		 909 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 907 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  70.97 
 
 		 858 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  55.81 
 
 		 899 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  95.45 
 
 		 921 aa  56.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  84 
 
 		 593 aa  56.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  53.23 
 
 		 910 aa  56.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0479  SEC-C motif domain protein  53.06 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  88.46 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1859  preprotein translocase subunit SecA  75.86 
 
 		 869 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0385967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  52.5 
 
 		 830 aa  55.8  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  70 
 
 		 901 aa  55.8  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  84.62 
 
 		 833 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0060  hypothetical protein  87.5 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000251524  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  73.33 
 
 		 909 aa  55.8  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3796  preprotein translocase subunit SecA  62.86 
 
 		 906 aa  55.8  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000547853  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  95.24 
 
 		 838 aa  55.8  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  80.77 
 
 		 872 aa  55.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  55 
 
 		 894 aa  55.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 957 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  80.77 
 
 		 907 aa  55.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  65.62 
 
 		 166 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>