139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1360 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  76.37 
 
 		 248 aa  384  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  74.68 
 
 		 248 aa  378  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  72.2 
 
 		 241 aa  370  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1340  hypothetical protein  75.1 
 
 		 241 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  72.2 
 
 		 241 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  71.61 
 
 		 235 aa  352  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  53.68 
 
 		 244 aa  255  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0941  hypothetical protein  50.65 
 
 		 243 aa  240  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.366625  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1790  hypothetical protein  48.05 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0038  hypothetical protein  52.84 
 
 		 244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119148  normal  0.345502 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2359  hypothetical protein  48.9 
 
 		 245 aa  239  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.205425  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0072  hypothetical protein  48.28 
 
 		 257 aa  235  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5230  urea carboxylase-associated protein 2  48.94 
 
 		 251 aa  229  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1382  hypothetical protein  48.94 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278837  normal  0.0134092 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0796  urea carboxylase-associated protein 2  48.05 
 
 		 245 aa  218  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5560  hypothetical protein  46.15 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.922437  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5925  hypothetical protein  46.15 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6432  hypothetical protein  45.73 
 
 		 251 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3790  hypothetical protein  44.1 
 
 		 276 aa  204  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4885  hypothetical protein  41.48 
 
 		 268 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131726  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1125  5'-3' exonuclease  43.56 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0047  urea carboxylase-associated protein 2  41.99 
 
 		 239 aa  188  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2306  urea carboxylase-associated protein 2  40.34 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  43.11 
 
 		 273 aa  171  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  42.22 
 
 		 273 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  42.04 
 
 		 275 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  41.59 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  39.57 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0764  urea carboxylase-associated protein 2  36.78 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4019  urea carboxylase-associated protein 2  37.61 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3902  hypothetical protein  37.17 
 
 		 270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1890  hypothetical protein  39.83 
 
 		 278 aa  151  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2186  hypothetical protein  38.05 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.977341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  37.17 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1590  urea carboxylase-associated protein 2  37.17 
 
 		 279 aa  148  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.247847  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3724  hypothetical protein  36.28 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.962728 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0608  hypothetical protein  39.22 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.619222  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4447  hypothetical protein  37.39 
 
 		 274 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2776  urea carboxylase-associated protein 2  35.4 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286269  normal  0.0650388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0902  hypothetical protein  36.56 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1838  hypothetical protein  37.62 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1885  hypothetical protein  37.62 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3726  urea carboxylase-associated protein 2  35.68 
 
 		 281 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1819  hypothetical protein  37.13 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3890  urea carboxylase-associated protein 2  33.91 
 
 		 287 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  33.33 
 
 		 215 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1592  urea carboxylase-associated protein 2  35.19 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1383  hypothetical protein  31.9 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247452  normal  0.0123851 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  32.37 
 
 		 210 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  31.9 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  28.02 
 
 		 214 aa  112  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  31.09 
 
 		 212 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  29 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  35.38 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  32.08 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  29 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  30.15 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3667  hypothetical protein  32.2 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  32.34 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  30.93 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  28.86 
 
 		 211 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  33.49 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  30.73 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  32 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  29.74 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1839  hypothetical protein  31.78 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  31.66 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1886  hypothetical protein  31.78 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1820  hypothetical protein  31.78 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  30.41 
 
 		 216 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2729  hypothetical protein  31.03 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  33.82 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  31.71 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  31.53 
 
 		 211 aa  105  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  31.37 
 
 		 211 aa  105  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  33.17 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  32.99 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5559  hypothetical protein  32.38 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412671  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5924  hypothetical protein  32.38 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.179476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  31.73 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  32.66 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  31.37 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  32.69 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6431  hypothetical protein  32.38 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  27.67 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  29.72 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  27.05 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  27.89 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  32.11 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  30.85 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  29.7 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  27.96 
 
 		 208 aa  93.6  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  29.9 
 
 		 211 aa  87.8  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  28 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  28.72 
 
 		 212 aa  86.7  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3727  urea carboxylase-associated protein 1  27.81 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.592231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3889  urea carboxylase-associated protein 1  27.62 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.127601  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  30.57 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>