82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1265 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1265  internalin-related protein  100 
 
 
400 aa  806    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.805237  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0892  internalin-related protein  65.84 
 
 
467 aa  526  1e-148  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0810  internalin-related protein  63.75 
 
 
400 aa  514  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448764  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  64.07 
 
 
400 aa  484  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1551  leucine-rich repeat protein  64.84 
 
 
399 aa  481  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.823905  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1202  internalin-related protein  58.17 
 
 
399 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.83099 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  55.5 
 
 
399 aa  440  9.999999999999999e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  34.65 
 
 
1085 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4750  internalin protein  27.43 
 
 
995 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1473  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.74 
 
 
341 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3741  hypothetical protein  29.33 
 
 
421 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162842  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  26.27 
 
 
772 aa  97.1  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  29.38 
 
 
531 aa  96.3  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  33.47 
 
 
498 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  28.26 
 
 
1088 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0523  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.13 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0540  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.13 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  23.91 
 
 
1070 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  23.91 
 
 
1070 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  23.91 
 
 
1112 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  31.58 
 
 
755 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  27.73 
 
 
1052 aa  87  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  28.24 
 
 
1351 aa  87  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  30.99 
 
 
766 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  27.27 
 
 
565 aa  86.7  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  29.61 
 
 
858 aa  83.6  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  24.89 
 
 
760 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  27.57 
 
 
766 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  24.14 
 
 
779 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  24.14 
 
 
765 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  23.81 
 
 
760 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  24.57 
 
 
772 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  27.06 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  23.81 
 
 
542 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0463  internalin protein  22.75 
 
 
954 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0349325  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0608  internalin protein  22.75 
 
 
1012 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  29.29 
 
 
284 aa  77  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0682  internalin protein  22.94 
 
 
993 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000101433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  22.48 
 
 
994 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  28.5 
 
 
1266 aa  71.2  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  28.66 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  31.4 
 
 
474 aa  70.5  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0907  protein of unknown function/lipoprotein, putative  25.25 
 
 
877 aa  70.5  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  27.72 
 
 
643 aa  70.1  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  26.61 
 
 
789 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  26.61 
 
 
789 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  34.51 
 
 
587 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0527  hypothetical protein  29.56 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0467  cell wall anchor domain-containing protein  26 
 
 
1011 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  29.96 
 
 
631 aa  66.2  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  26.97 
 
 
718 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0508  hypothetical protein  35.21 
 
 
238 aa  63.9  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2003  internalin-related protein  28.14 
 
 
424 aa  63.9  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000199876  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  26.87 
 
 
692 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6120  hypothetical protein  25 
 
 
211 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  30.52 
 
 
384 aa  58.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1060  leucine-rich repeat protein  33.33 
 
 
205 aa  56.6  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  29.14 
 
 
539 aa  56.6  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1860  cell wall protein  27.07 
 
 
318 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184578 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  36.56 
 
 
197 aa  53.1  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  27.12 
 
 
279 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  26.34 
 
 
1107 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03590  enzyme regulator, putative  27.48 
 
 
374 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05580  putative membrane-anchored cell surface protein  25.47 
 
 
1118 aa  51.2  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  26.89 
 
 
1024 aa  50.8  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  27.06 
 
 
886 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  27.12 
 
 
344 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0331  hypothetical protein  31.64 
 
 
290 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.178036  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  21.15 
 
 
535 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1045  hypothetical protein  27.97 
 
 
356 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0229946 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3264  hypothetical protein  24.22 
 
 
452 aa  46.6  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4766  internalin G  29.7 
 
 
254 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  32 
 
 
1231 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5337  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  31.53 
 
 
473 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  26.62 
 
 
486 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0020  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.89 
 
 
481 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120001  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28748  predicted protein  28.89 
 
 
935 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3237  hypothetical protein  26.6 
 
 
581 aa  43.5  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  27.15 
 
 
559 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4586  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.44 
 
 
1086 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  22.31 
 
 
1679 aa  43.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0822  LRR-like protein  29.23 
 
 
523 aa  43.1  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.297337  normal  0.386181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>