More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1177 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  100 
 
 		 303 aa  623  1e-177  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  84.77 
 
 		 303 aa  533  1e-150  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  83.06 
 
 		 303 aa  528  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  83.39 
 
 		 303 aa  527  1e-148  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  81.79 
 
 		 303 aa  522  1e-147  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  80.13 
 
 		 303 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  80.13 
 
 		 303 aa  498  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  54.28 
 
 		 306 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  52.82 
 
 		 307 aa  349  3e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  53.64 
 
 		 305 aa  348  5e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  53.64 
 
 		 313 aa  345  6e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  52.17 
 
 		 305 aa  345  7e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  52.84 
 
 		 305 aa  341  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  53.18 
 
 		 305 aa  339  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  52.96 
 
 		 305 aa  338  7e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  52.65 
 
 		 307 aa  338  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  52.51 
 
 		 318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  52.84 
 
 		 305 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  51.66 
 
 		 304 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  52.63 
 
 		 306 aa  334  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  51.48 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  53 
 
 		 306 aa  318  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  50 
 
 		 313 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  49.01 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  49.01 
 
 		 314 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  49.01 
 
 		 314 aa  309  4e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  48.67 
 
 		 312 aa  305  6e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  46.03 
 
 		 308 aa  300  3e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  46.77 
 
 		 308 aa  285  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  45.85 
 
 		 304 aa  277  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  42.9 
 
 		 310 aa  264  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  40.94 
 
 		 297 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  39.8 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  30.19 
 
 		 320 aa  169  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  27.94 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  26.73 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  27.3 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  26.53 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  27.88 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  24.75 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  22.89 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  24.68 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  26.69 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  27.27 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  27.4 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  23.05 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  23.62 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  25.41 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  26.95 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  29.03 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  26.36 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  22.26 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  23.64 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0487  ribokinase-like domain-containing protein  23.47 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  27.07 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  25.08 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  26.35 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  38.21 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  26.69 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  26.01 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  26.01 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  36.13 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  26.01 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  26.01 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  26.01 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  26 
 
 		 333 aa  62.8  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  27.07 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  26.01 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  25.35 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  31.61 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  29.84 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  25.36 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  26.61 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  27.15 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45308  ribokinase  24.12 
 
 		 709 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.394155  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3268  PfkB domain protein  29.17 
 
 		 297 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.266121 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  36.36 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  25.74 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  25.15 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  28.04 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  33.94 
 
 		 329 aa  60.5  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  24.44 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  25.32 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  22.95 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  30.47 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  31.15 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  24.44 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  32.48 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3998  ribokinase-like domain-containing protein  27.94 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0662614  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  24.62 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  30.08 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  39.33 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  30.08 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  30.99 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  23 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  26.86 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  24.5 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  23 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  32.8 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  33.05 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>