More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2410 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2410  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 		 408 aa  845    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262762  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3170  hypothetical protein  49.75 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1366  hypothetical protein  50.25 
 
 		 418 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.496364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1655  hypothetical protein  48.28 
 
 		 419 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.151005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2174  hypothetical protein  47.78 
 
 		 405 aa  363  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2320  hypothetical protein  48.17 
 
 		 421 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1429  hypothetical protein  47.74 
 
 		 405 aa  351  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.834024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2901  hypothetical protein  50 
 
 		 521 aa  350  3e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0623331  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2848  monooxygenase FAD-binding  51.83 
 
 		 404 aa  346  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2327  hypothetical protein  46.44 
 
 		 414 aa  325  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0143705  normal  0.574012 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1503  hypothetical protein  45.76 
 
 		 405 aa  310  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2386  monooxygenase FAD-binding protein  44.06 
 
 		 412 aa  306  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.611075  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0456  hypothetical protein  44.01 
 
 		 400 aa  307  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.558276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2049  hypothetical protein  43.11 
 
 		 409 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2982  hypothetical protein  42.01 
 
 		 419 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0506  hypothetical protein  44.9 
 
 		 420 aa  305  7e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3035  hypothetical protein  43.52 
 
 		 399 aa  301  9e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3882  monooxygenase FAD-binding protein  38.71 
 
 		 410 aa  300  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0442  hypothetical protein  46.93 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6078  hypothetical protein  44.88 
 
 		 421 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3289  monooxygenase FAD-binding protein  43.78 
 
 		 405 aa  296  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6010  monooxygenase FAD-binding  48.04 
 
 		 410 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5898  monooxygenase FAD-binding protein  47.95 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.106816 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0437  hypothetical protein  39.95 
 
 		 423 aa  288  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00330  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  42 
 
 		 405 aa  287  2.9999999999999996e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1898  monooxygenase FAD-binding protein  40.98 
 
 		 391 aa  286  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11769  hypothetical protein  42.98 
 
 		 460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.196079  hitchhiker  0.00000209473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09000  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  42.3 
 
 		 416 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2633  monooxygenase FAD-binding protein  43.89 
 
 		 415 aa  283  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1606  monooxygenase FAD-binding protein  44.58 
 
 		 413 aa  282  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0304  hypothetical protein  44.79 
 
 		 415 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.605002  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1983  hypothetical protein  39.76 
 
 		 431 aa  273  5.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1232  monooxygenase FAD-binding protein  41.03 
 
 		 417 aa  266  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0108745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1565  hypothetical protein  41.52 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000000103303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3972  monooxygenase FAD-binding  34.25 
 
 		 416 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762736  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3557  monooxygenase FAD-binding protein  43.05 
 
 		 383 aa  200  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  30.88 
 
 		 404 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1747  hypothetical protein  30.06 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0945012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3774  monooxygenase, FAD-binding  27.62 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.343223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  25.8 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2964  monooxygenase FAD-binding  28.48 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000808449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3284  hypothetical protein  25.75 
 
 		 554 aa  74.7  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  26.52 
 
 		 506 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4276  Electron-transferring-flavoproteindehydrogenase  34.59 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  25.24 
 
 		 505 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0541  hypothetical protein  23.98 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1117  monooxygenase, FAD-binding  27.38 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  28 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.67 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  25.23 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4043  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  23.54 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  25.59 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.07 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5592  monooxygenase FAD-binding protein  27.38 
 
 		 524 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  29.38 
 
 		 498 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  26.14 
 
 		 493 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  25.68 
 
 		 486 aa  66.2  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3838  4-hydroxybenzoate 3-monooxygenase  24.06 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.83 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  24.93 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1006  hypothetical protein  23.77 
 
 		 543 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  26.07 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04530  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  24.36 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.722855  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  26.67 
 
 		 529 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  22.74 
 
 		 535 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  28.75 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2944  monooxygenase, FAD-binding protein  27.24 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04210  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  24.78 
 
 		 510 aa  63.2  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  26.09 
 
 		 486 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3750  monooxygenase, FAD-binding  23.39 
 
 		 511 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0581872  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1277  monooxygenase FAD-binding  27.47 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0163  2-polyprenyl-6-methoxyphenol 4-hydroxylase  22.54 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1150  monooxygenase FAD-binding protein  24.93 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.862466  normal  0.995827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  23.8 
 
 		 483 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  27.36 
 
 		 553 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3394  hypothetical protein  25.63 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  27.25 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  22.43 
 
 		 540 aa  60.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3292  hypothetical protein  25.63 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.61616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3227  hypothetical protein  25.63 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.470901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3289  hypothetical protein  25.63 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.672486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3214  hypothetical protein  25.63 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00565491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5423  monooxygenase FAD-binding  25 
 
 		 382 aa  60.1  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224517  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2031  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  22.25 
 
 		 410 aa  59.7  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3896  monooxygenase FAD-binding protein  24.4 
 
 		 537 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.95 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  22.4 
 
 		 480 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  27.11 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  26.81 
 
 		 502 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9228  hypothetical protein  26.93 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187294  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2807  monooxygenase FAD-binding  24.7 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.461648  normal  0.985986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1937  monooxygenase FAD-binding  26.35 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000536386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5104  hypothetical protein  22.7 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1656  hypothetical protein  28.35 
 
 		 508 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.652016  normal  0.325297 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  26.67 
 
 		 502 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  27.5 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0596  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  25.23 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>