103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0221 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0221  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 447 aa  923    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1978  hypothetical protein  27.86 
 
 		 489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2733  hypothetical protein  29.56 
 
 		 530 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.735957  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4033  Pyrrolo-quinoline quinone  28.6 
 
 		 431 aa  149  9e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3592  Pyrrolo-quinoline quinone  24.82 
 
 		 442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0598  Pyrrolo-quinoline quinone  26.96 
 
 		 441 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.118149  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4007  hypothetical protein  25.82 
 
 		 608 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0258  Pyrrolo-quinoline quinone  23.32 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0982  Pyrrolo-quinoline quinone  26.72 
 
 		 437 aa  98.6  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.18795  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1930  WD40-like protein repeat-like protein  25.44 
 
 		 466 aa  87.8  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00495857  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4240  Pyrrolo-quinoline quinone  29.02 
 
 		 490 aa  82.8  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00516774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2944  Pyrrolo-quinoline quinone  22.02 
 
 		 934 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186402  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0250  Pyrrolo-quinoline quinone  26.93 
 
 		 434 aa  78.2  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2376  Pyrrolo-quinoline quinone  25.33 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1848  Pyrrolo-quinoline quinone  25.99 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337625  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  25.16 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  24.76 
 
 		 1812 aa  63.5  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  25.68 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  26.89 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3506  WD40-like protein repeat-like protein  22.13 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16267  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  23.58 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  27.56 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.83 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  24.02 
 
 		 432 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 392 aa  54.3  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1863  Pyrrolo-quinoline quinone  23.63 
 
 		 462 aa  53.5  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.77 
 
 		 392 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.77 
 
 		 392 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.77 
 
 		 392 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.77 
 
 		 392 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.77 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.06 
 
 		 393 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  23.94 
 
 		 457 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0751  Pyrrolo-quinoline quinone  22.4 
 
 		 453 aa  51.2  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.7044  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.38 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  22.15 
 
 		 475 aa  51.2  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.16 
 
 		 392 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  24.34 
 
 		 392 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.34 
 
 		 392 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.34 
 
 		 392 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.34 
 
 		 392 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  24.34 
 
 		 392 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1359  Pyrrolo-quinoline quinone  24.85 
 
 		 377 aa  50.1  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000339921 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.95 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.01 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.01 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.01 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.61 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.61 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.79 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.77 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.34 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  24.77 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  20.63 
 
 		 797 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  23.81 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.61 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.83 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  21.1 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  24.58 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  23.97 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  23.97 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.03 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  21.23 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  26.34 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4255  Pyrrolo-quinoline quinone  24.63 
 
 		 630 aa  47.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2426  Pyrrolo-quinoline quinone  25.23 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.23 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  24.46 
 
 		 363 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.32 
 
 		 395 aa  46.6  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2943  Pyrrolo-quinoline quinone  25.5 
 
 		 593 aa  47  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  30.29 
 
 		 411 aa  46.6  0.0009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.55 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  22.59 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.77 
 
 		 386 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  22.65 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6478  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  22.93 
 
 		 606 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.975384  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.78 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  23.13 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3015  Pyrrolo-quinoline quinone  30.88 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  24.71 
 
 		 556 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  23.21 
 
 		 387 aa  45.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  26.77 
 
 		 561 aa  45.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3002  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.78 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0839555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.78 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0657183 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1376  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.78 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.877608  normal  0.696352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.2 
 
 		 393 aa  44.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.64 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2427  methanol dehydrogenase-like protein (xoxF)  21.09 
 
 		 605 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0410852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  25.5 
 
 		 438 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3309  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.18 
 
 		 395 aa  43.9  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  34.62 
 
 		 718 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  26.92 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2605  Pyrrolo-quinoline quinone  21.51 
 
 		 381 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.623065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.73 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  29.17 
 
 		 349 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  36.67 
 
 		 380 aa  43.9  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  23.39 
 
 		 687 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  25 
 
 		 386 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  22.86 
 
 		 371 aa  43.1  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>