More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3108 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3108  rare lipoprotein A  100 
 
 		 339 aa  689    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66001  normal  0.467764 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  36.71 
 
 		 367 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4106  hypothetical protein  64.12 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322542  normal  0.202617 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1294  rare lipoprotein A  48.09 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2012  rare lipoprotein A  53.94 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127741  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1995  rare lipoprotein A  62.2 
 
 		 364 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.359065  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  63.85 
 
 		 408 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2676  rare lipoprotein A  58.33 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.36166  normal  0.127788 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  39.72 
 
 		 282 aa  179  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3111  rare lipoprotein A  62.6 
 
 		 315 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.829805  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1807  rare lipoprotein A  52.44 
 
 		 364 aa  179  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206051  hitchhiker  0.00189733 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2701  rare lipoprotein A  60.31 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2712  rare lipoprotein A  60.31 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.824805 
 
 
-
 
NC_004310  BR0990  rare lipoprotein A family protein  60.31 
 
 		 421 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2700  rare lipoprotein A  36.36 
 
 		 318 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0958  rare lipoprotein A family protein  60.31 
 
 		 419 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.138105  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2075  rare lipoprotein A  60.31 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1466  rare lipoprotein A  60.63 
 
 		 279 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  39.3 
 
 		 322 aa  172  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  49.72 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0545  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2153  rare lipoprotein A  58.02 
 
 		 382 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1506  rare lipoprotein A  53.29 
 
 		 442 aa  161  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0428333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  53.74 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4822  lipoprotein, rlpA family  35.74 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3581  rare lipoprotein A  51.88 
 
 		 468 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0743436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6925  rare lipoprotein A  55.3 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0552998  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6276  rare lipoprotein A  55.3 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.314639 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4362  rare lipoprotein A  35.74 
 
 		 342 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3390  rare lipoprotein A  55.47 
 
 		 474 aa  155  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.728179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4967  rare lipoprotein A  36.49 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3699  rare lipoprotein A  55.47 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1538  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 383 aa  153  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.516723  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  39.62 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0617  rare lipoprotein A  34.11 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0426495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08420  Rare lipoprotein, RlpA family  33.99 
 
 		 325 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.108645  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  38.85 
 
 		 342 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0496  rare lipoprotein A, putative  47.65 
 
 		 224 aa  147  3e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4679  rare lipoprotein A  39.48 
 
 		 333 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  37.26 
 
 		 337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4857  rare lipoprotein A  38.58 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0175  rare lipoprotein A  35.99 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365013  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4804  rare lipoprotein A family  38.58 
 
 		 333 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0241  rare lipoprotein A  35.14 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0482  rare lipoprotein A  58.49 
 
 		 303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.241212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  60.18 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  33.12 
 
 		 322 aa  137  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  32.85 
 
 		 321 aa  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3300  rare lipoprotein A  56.56 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.650023 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1988  drug/metabolite exporter (DME) family protein  35.83 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  33.58 
 
 		 297 aa  133  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  53.49 
 
 		 286 aa  132  7.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0458  30S ribosomal protein S16 (BS17)  58.41 
 
 		 270 aa  132  7.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 266 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 275 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  53.33 
 
 		 275 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  56.64 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2411  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1386  rare lipoprotein A  31.8 
 
 		 415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.166682  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  56.64 
 
 		 240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1255  rare lipoprotein A  31.94 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.994921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0025  Rare lipoprotein A  35.78 
 
 		 279 aa  129  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.674451  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0315  rare lipoprotein A  34.43 
 
 		 394 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2951  rare lipoprotein A  34.72 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078058  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  55.17 
 
 		 238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0111  rare lipoprotein A  32.62 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  47.13 
 
 		 243 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1316  rare lipoprotein A  31.33 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250086  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  53.91 
 
 		 270 aa  126  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2708  rare lipoprotein A  52.03 
 
 		 285 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2966  rare lipoprotein A  32 
 
 		 381 aa  126  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.508447  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  61.29 
 
 		 360 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  61.29 
 
 		 360 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1179  rare lipoprotein A  32.27 
 
 		 375 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00815633  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  57.89 
 
 		 265 aa  125  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1548  rare lipoprotein A  47.37 
 
 		 259 aa  125  9e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  60.22 
 
 		 124 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3023  rare lipoprotein A  34.03 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000107975  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3152  rare lipoprotein A  31.95 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00554597  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2845  rare lipoprotein A  31.8 
 
 		 311 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000926657  hitchhiker  0.0000043303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2322  rare lipoprotein A  46.84 
 
 		 255 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260351  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3447  rare lipoprotein A  31.84 
 
 		 423 aa  123  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  58.76 
 
 		 163 aa  122  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2633  rare lipoprotein A  50.82 
 
 		 257 aa  123  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  55.21 
 
 		 206 aa  122  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2235  rare lipoprotein A  49.68 
 
 		 249 aa  122  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1851  rare lipoprotein A  33.68 
 
 		 360 aa  122  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000580444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  53.15 
 
 		 186 aa  122  8e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  47.83 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1940  rare lipoprotein A  43.48 
 
 		 163 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  55.21 
 
 		 206 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  54.74 
 
 		 278 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  53.77 
 
 		 124 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2921  rare lipoprotein A, putative  33.22 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.303868  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2450  rare lipoprotein A  43.79 
 
 		 171 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0060097  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  57.3 
 
 		 150 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  60.23 
 
 		 335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2535  rare lipoprotein A  33.22 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.456339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2968  rare lipoprotein A  46.47 
 
 		 258 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>