More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2357 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2357  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.274737  normal  0.453516 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5188  response regulator receiver protein  73.58 
 
 		 125 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.196398 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5457  response regulator receiver protein  67.92 
 
 		 125 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274589  normal  0.0149713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1267  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1891  response regulator  36.13 
 
 		 379 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.750204  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2455  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  34.11 
 
 		 213 aa  77.8  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2681  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 		 670 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5523  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.56 
 
 		 210 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0182  response regulator receiver domain-containing protein  36.84 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.38 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  40 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0643  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0911  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 456 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1055  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 456 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.523432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.3 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5150  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.56838 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0348  transcriptional regulatory protein  40.17 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.242627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7367  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 212 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5433  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  35.38 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0225  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0872  histidine kinase  34.11 
 
 		 585 aa  72.4  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0443  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 256 aa  72  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1340  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 457 aa  72.8  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5632  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.653856 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.19 
 
 		 223 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.67 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1249  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 452 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3480  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000540997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.19 
 
 		 1121 aa  71.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4322  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35 
 
 		 444 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.713581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0212  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0463  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.966783  normal  0.711351 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0367  winged helix family two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0127671 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2407  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 461 aa  70.9  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 208 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  34.62 
 
 		 212 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  34.62 
 
 		 212 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  34.62 
 
 		 212 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  34.13 
 
 		 203 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  34.62 
 
 		 212 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  34.62 
 
 		 212 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0597  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 233 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  34.62 
 
 		 212 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  34.62 
 
 		 212 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3089  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 236 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2399  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 128 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0361  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 233 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324623  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 208 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4371  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.4 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109269  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  34.65 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1238  response regulator receiver  38.46 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0255  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02112 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0503  two component transcriptional regulator  31.15 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  42.5 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0111  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953605 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2739  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 451 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.693002  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4019  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  34.65 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0845  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4057  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1400  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.435154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1179  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.46 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.566879  normal  0.163877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1496  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190196  normal  0.699272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1975  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.06 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2845  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1401  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35 
 
 		 444 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5240  response regulator  35.96 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6901  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279255  normal  0.546779 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1530  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.754323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3571  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2539  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 487 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.846517  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>