More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1929 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1929  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 255 aa  509  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298264 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  44.35 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  45.53 
 
 		 242 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  43.53 
 
 		 241 aa  201  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  44.72 
 
 		 242 aa  201  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  43.92 
 
 		 243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4871  beta-lactamase domain protein  38.06 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936336  normal  0.586773 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  30.49 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  26.38 
 
 		 261 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2285  beta-lactamase-like  30.77 
 
 		 311 aa  95.1  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.35 
 
 		 347 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06040  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  30.08 
 
 		 303 aa  86.3  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.692713 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2963  beta-lactamase domain-containing protein  29.39 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.955909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1485  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000168088  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0660  beta-lactamase domain-containing protein  28 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000276126  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1524  beta-lactamase domain-containing protein  25.98 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  30.7 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0272  beta-lactamase domain protein  23.79 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000021825  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  22.46 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  26.42 
 
 		 215 aa  62  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1480  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  26.45 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  26.48 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  24.89 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  24.53 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.19 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  29.95 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1067  hypothetical protein  29.76 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.21331  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  27.82 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  26.15 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  35.64 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  25.65 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  26.11 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  28.12 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  26.67 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  25.51 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  26.52 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  25.57 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2870  metal-dependent hydrolase  27.84 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.154446  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  24.89 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3140  metallo-beta-lactamase family protein  27.98 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0313805  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.45 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2128  metal-dependent hydrolase  26.94 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  27.11 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  25.45 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  23.11 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3110  metallo-beta-lactamase family protein  26.94 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  24.68 
 
 		 325 aa  54.7  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1061  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  25.57 
 
 		 294 aa  54.7  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  54.55 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  27.03 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  30.16 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  26.53 
 
 		 334 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  21.46 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  23.28 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2884  beta-lactamase domain protein  27.59 
 
 		 191 aa  53.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4870  beta-lactamase domain protein  28.06 
 
 		 341 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.434908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  26.7 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  28.83 
 
 		 329 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2138  beta-lactamase-like  26.04 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0796003  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1625  beta-lactamase domain protein  23.87 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224285  normal  0.185558 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  27.21 
 
 		 330 aa  53.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  23.96 
 
 		 208 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2751  beta-lactamase domain-containing protein  23.87 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  24.05 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3118  metallo-beta-lactamase family protein  27.32 
 
 		 281 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1544  beta-lactamase domain protein  41.67 
 
 		 294 aa  52.8  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.393561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  31.89 
 
 		 354 aa  53.1  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  27.57 
 
 		 259 aa  53.1  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2900  metallo-beta-lactamase family protein  27.32 
 
 		 285 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248774  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.45 
 
 		 212 aa  52.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  40.54 
 
 		 317 aa  52.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  28.22 
 
 		 374 aa  52.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3121  metallo-beta-lactamase family protein  25.77 
 
 		 285 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  23.87 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  22.84 
 
 		 322 aa  52  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  25.33 
 
 		 221 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  25.58 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  25.58 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  23.22 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2827  metal-dependent hydrolase  27.46 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0133277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3142  metallo-beta-lactamase family protein  27.46 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0970008  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  28.7 
 
 		 299 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  31.58 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  25.58 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  24.87 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1074  glyoxalase II family protein  27.45 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.905224  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  25.58 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  25.58 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  25.58 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  26.64 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  24.89 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2563  beta-lactamase domain protein  26.18 
 
 		 282 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  24.48 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  24.48 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  25.39 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>