More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2537 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1882  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  63.93 
 
 
854 aa  1061    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2537  fused sensor protein/response regulator  100 
 
 
842 aa  1723    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2246  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  63.07 
 
 
854 aa  1021    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00766594  normal  0.0928411 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1871  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  60.7 
 
 
856 aa  1019    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3319  putative two-component sensor  47.26 
 
 
868 aa  733    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38970  putative two-component sensor  47.66 
 
 
881 aa  733    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.687207  normal  0.985828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.95 
 
 
635 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2172  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.77 
 
 
645 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2664  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.58 
 
 
655 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.215528  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0869  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1316 aa  425  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0225926  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2557  histidine kinase  41.07 
 
 
1142 aa  313  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257497  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2742  sensor histidine kinase/response regulator  37.27 
 
 
1145 aa  310  5e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2522  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.73 
 
 
1146 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00042371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1972  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.95 
 
 
574 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0539187 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1864  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.49 
 
 
1159 aa  308  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0562222 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2348  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.64 
 
 
1145 aa  307  7e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.45 
 
 
1140 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178694  hitchhiker  0.00103188 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1753  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.55 
 
 
1146 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2078  sensor histidine kinase/response regulator  40.32 
 
 
1141 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.45474  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1749  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 
1146 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0353406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2531  histidine kinase  40.32 
 
 
1146 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014523  hitchhiker  0.00504999 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 
1146 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248753 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1792  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 
1146 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.103598  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2433  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.33 
 
 
1146 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0799381 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0898  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.53 
 
 
1172 aa  303  9e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.149338  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35230  integral membrane sensor hybrid histidine protein kinase  38.35 
 
 
1161 aa  300  7e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234785  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1534  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 
1140 aa  297  5e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.254728  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1470  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.27 
 
 
1140 aa  293  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21700  putative two-component sensor  41.65 
 
 
1159 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1850  putative two-component sensor  41.65 
 
 
1159 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.460329  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3900  sensory box histidine kinase/response regulator  35.93 
 
 
1157 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0699  signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
744 aa  280  6e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.324444  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3301  putative two-component sensor  35.32 
 
 
577 aa  280  7e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15238  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2683  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.61 
 
 
567 aa  279  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.259535  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2340  histidine kinase  35.7 
 
 
487 aa  278  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266723 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.14 
 
 
554 aa  279  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0189072  normal  0.493238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3079  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 
556 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38740  putative two-component sensor  36.6 
 
 
594 aa  278  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.924619  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1660  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.87 
 
 
1156 aa  277  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0486727  normal  0.0112915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1292  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
1159 aa  276  9e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0372313  normal  0.867611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 
1159 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948496  normal  0.574545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1585  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.48 
 
 
1158 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.484303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
880 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1250  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
1158 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0252543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0860  putative two-component hybrid sensor histidine kinase and response regulator  32.97 
 
 
1169 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0827695 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4823  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.68 
 
 
1169 aa  270  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002203  sensor histidine kinase  38.22 
 
 
1055 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0837  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1168 aa  268  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.303418 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2695  sensor histidine kinase  38.37 
 
 
1147 aa  266  8.999999999999999e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4025  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 
1159 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0792472  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00164  sensor histidine kinase  37.07 
 
 
1177 aa  264  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0921  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1169 aa  264  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.306622  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2829  membrane associated response regulator, histidine kinase  38.32 
 
 
1148 aa  263  8.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  35.02 
 
 
881 aa  261  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0291  sensor histidine kinase  32.49 
 
 
545 aa  260  6e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3519  histidine kinase  39.01 
 
 
448 aa  260  9e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0922492  normal  0.751112 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0992  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 
662 aa  260  9e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0262  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
545 aa  257  5e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.446369  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0620  two component sensor kinase/response regulator hybrid  34.43 
 
 
1169 aa  257  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
1172 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0090  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
1163 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0274  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 
1169 aa  255  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41273  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
883 aa  254  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3139  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 
1161 aa  254  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.305564 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0224  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 
1167 aa  253  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1985  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 
1138 aa  252  2e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2060  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
1111 aa  251  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.749505  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4564  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
1169 aa  249  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.519353  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.93 
 
 
1174 aa  249  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854881  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0165  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.47 
 
 
1168 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53132  normal  0.851256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2613  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
1166 aa  247  8e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2935  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.85 
 
 
817 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1526  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 
733 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0396333  normal  0.047905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0058  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
1170 aa  245  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950876  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2880  signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
733 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1424  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 
1152 aa  244  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.68675 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2676  histidine kinase  35.33 
 
 
676 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00458174  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0316  sensor histidine kinase/response regulator  35.42 
 
 
1174 aa  244  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1817  histidine kinase  36.76 
 
 
454 aa  242  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3952  histidine kinase  34.97 
 
 
747 aa  242  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 
733 aa  241  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1926  ATPase domain-containing protein  37.5 
 
 
454 aa  241  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.82384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2202  histidine kinase  37.5 
 
 
447 aa  241  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3978  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
1152 aa  238  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.169335 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3169  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 
1168 aa  239  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2571  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 
634 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0964097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3255  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 
1177 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0680649  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3284  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.78 
 
 
1168 aa  237  7e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.431447 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02752  two-component system sensor protein  30.67 
 
 
1150 aa  237  8e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0663  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 
1172 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.564919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 
1168 aa  235  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3460  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 
1175 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.549126 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0409  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
1171 aa  232  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2939  histidine kinase  34.23 
 
 
447 aa  231  6e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4194  histidine kinase  33.49 
 
 
452 aa  230  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100725  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7668  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 
571 aa  229  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1829  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 
1185 aa  228  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3419  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.84 
 
 
1184 aa  228  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0523  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.22 
 
 
1179 aa  225  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.183484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0467  sensor histidine kinase  32.11 
 
 
758 aa  225  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>