More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2418 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2418  ABC transporter extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 544 aa  1120    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311467  hitchhiker  0.0000215968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1660  extracellular solute-binding protein family 5  49.22 
 
 		 539 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.40005  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0716  peptide/oligopeptide/nickel ABC transporter substrate-binding protein  47.6 
 
 		 541 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4049  twin-arginine translocation pathway signal  48.27 
 
 		 539 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.684503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4660  extracellular solute-binding protein  47.7 
 
 		 540 aa  510  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.845725  normal  0.101671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0882  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  47.03 
 
 		 539 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2113  putative ABC transporter substrate-binding protein  38.85 
 
 		 539 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3888  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.54 
 
 		 550 aa  161  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.799639  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1686  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.41 
 
 		 516 aa  161  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4180  extracellular solute-binding protein family 5  29.33 
 
 		 547 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2706  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 538 aa  160  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1906  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 543 aa  159  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0377443  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2160  extracellular solute-binding protein family 5  29.57 
 
 		 516 aa  159  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0024579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.38 
 
 		 516 aa  159  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2099  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  29.38 
 
 		 516 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 516 aa  159  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5381  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  29.46 
 
 		 524 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121189  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  29.38 
 
 		 516 aa  157  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1750  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  28.78 
 
 		 516 aa  157  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.843018  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  28.69 
 
 		 515 aa  156  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2465  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 529 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.352303 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3852  extracellular solute-binding protein family 5  28.34 
 
 		 547 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7015  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.9 
 
 		 528 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0208042  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3867  extracellular solute-binding protein family 5  29.33 
 
 		 536 aa  153  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 501 aa  152  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4044  extracellular solute-binding protein family 5  28.86 
 
 		 536 aa  150  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3248  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein, putative  29.06 
 
 		 540 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1917  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2326  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 		 546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.294702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5173  extracellular solute-binding protein family 5  27.32 
 
 		 528 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12226  normal  0.127243 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  27.87 
 
 		 505 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1878  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 536 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1030  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  30.09 
 
 		 534 aa  147  6e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.180664  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 501 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7644  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 528 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.938913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2347  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 516 aa  146  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 529 aa  144  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5442  extracellular solute-binding protein family 5  27.4 
 
 		 528 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0169825 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  28.98 
 
 		 520 aa  144  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3088  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 538 aa  143  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.902972  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  27.58 
 
 		 503 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0844  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.98 
 
 		 532 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1880  extracellular solute-binding protein  32.32 
 
 		 536 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.70178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1000  glutathione-binding protein GsiB  30.3 
 
 		 512 aa  140  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3528  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 		 564 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.61993  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0917  glutathione-binding protein GsiB  30.1 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0950  glutathione-binding protein GsiB  30.1 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0807  ABC dipeptide transporter, substrate-binding subunit DdpA  27.7 
 
 		 538 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123514  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0979  glutathione-binding protein GsiB  30.1 
 
 		 512 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1965  extracellular solute-binding protein family 5  27.32 
 
 		 556 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0890  glutathione-binding protein GsiB  30.1 
 
 		 512 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362875  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3371  extracellular solute-binding protein family 5  28.54 
 
 		 536 aa  139  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1878  extracellular solute-binding protein family 5  27.7 
 
 		 531 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.558624  normal  0.335683 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0389  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 527 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000716553  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3537  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 556 aa  137  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0888  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.67 
 
 		 512 aa  137  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 501 aa  137  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2532  extracellular solute-binding protein family 5  26.64 
 
 		 525 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0135  extracellular solute-binding protein family 5  25.88 
 
 		 531 aa  136  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1692  extracellular solute-binding protein family 5  29.31 
 
 		 531 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0372  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 		 529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.132597  normal  0.149219 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  29.02 
 
 		 514 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3308  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 		 528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0855  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.97 
 
 		 512 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4004  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 		 535 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.95 
 
 		 535 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2814  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 512 aa  134  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.993061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0901  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.59 
 
 		 512 aa  134  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2812  extracellular solute-binding protein family 5  27.59 
 
 		 512 aa  133  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.431185  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2518  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.59 
 
 		 512 aa  134  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0981  glutathione ABC transporter, periplasmic glutathione-binding protein GsiB  27.59 
 
 		 512 aa  134  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00814  hypothetical protein  27.59 
 
 		 512 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.840204  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1248  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 537 aa  134  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.710714 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0038  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 532 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216937  normal  0.341252 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00797  predicted peptide transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  28.2 
 
 		 493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.719474  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  27.81 
 
 		 502 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0925  extracellular solute-binding protein family 5  25.85 
 
 		 523 aa  131  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.30323 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  25.58 
 
 		 534 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  28.6 
 
 		 524 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4012  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 		 529 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0256267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  27.81 
 
 		 509 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4474  extracellular solute-binding protein  30.19 
 
 		 529 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0385001  normal  0.989495 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1274  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.86 
 
 		 533 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2562  periplasmic solute-binding protein  30.86 
 
 		 533 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0518  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.86 
 
 		 533 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.886694  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1050  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.86 
 
 		 533 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0247  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.86 
 
 		 533 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.279993  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1392  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.86 
 
 		 533 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00928392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  24.62 
 
 		 532 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1311  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.86 
 
 		 533 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4017  extracellular solute-binding protein  30.81 
 
 		 533 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0465332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4479  extracellular solute-binding protein  30.81 
 
 		 533 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.027731  normal  0.668994 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5720  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174819  normal  0.308845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3783  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.44101  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4585  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 529 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3993  extracellular solute-binding protein family 5  24.85 
 
 		 531 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  26.01 
 
 		 535 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0210  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0873116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>