232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5095 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  100 
 
 		 249 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  68.27 
 
 		 249 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  66.53 
 
 		 249 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  67.34 
 
 		 249 aa  344  8e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  67.34 
 
 		 249 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  66.53 
 
 		 249 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  67.34 
 
 		 249 aa  339  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  63.45 
 
 		 248 aa  315  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  59.68 
 
 		 248 aa  301  9e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  60.48 
 
 		 249 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  58.57 
 
 		 251 aa  292  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  35.41 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.74 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  31.02 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  30.63 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  32.53 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  34.38 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  30.64 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1904  pantothenate kinase  27.35 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  34.67 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2319  pantothenate kinase  27.35 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0559442  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0489  pantothenate kinase  30.8 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0583316 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  29.27 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1318  pantothenate kinase  26.69 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4227  pantothenate kinase  30.08 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  27.38 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  28.85 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  27.38 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2816  pantothenate kinase  27.76 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000416191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0171  Baf family transcriptional activator  26.61 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.86 
 
 		 269 aa  78.6  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  34.15 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0203  pantothenate kinase  27.88 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1934  pantothenate kinase  27.38 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.690584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  29.6 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0160  pantothenate kinase  26.98 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144798  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  32.5 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  31.5 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  32.89 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  36.54 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  27.71 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  29.92 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  27.45 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  26.95 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  26.97 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0655  pantothenate kinase  26.27 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2588  pantothenate kinase  25.93 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  27.35 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  29.02 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  35.9 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1986  pantothenate kinase  26.21 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.384312 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  29.79 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0086  pantothenate kinase  26.72 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000411745  normal  0.0255424 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  32.34 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4983  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.57 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442209  normal  0.98893 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  34.12 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4170  pantothenate kinase  27.95 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8379  pantothenate kinase  31.58 
 
 		 262 aa  72  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1678  putative transcriptional acitvator, Baf family  31.91 
 
 		 254 aa  72  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  33.12 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4379  pantothenate kinase  32 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.174078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  29.44 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  26.38 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.09 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0196  pantothenate kinase  33.33 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  30.77 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0549  pantothenate kinase  25.1 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  29.73 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  29.73 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  29.73 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  29.73 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  29.73 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2920  pantothenate kinase  29.34 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.937484 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  27.86 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_370  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000881986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  28.19 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  29.19 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6248  pantothenate kinase  29.29 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4483  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.95 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  28.46 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0136  pantothenate kinase  26.78 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000027573  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2291  pantothenate kinase  29.57 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0308  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.51 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000621846  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2905  pantothenate kinase  29.57 
 
 		 265 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0281691  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  27.05 
 
 		 262 aa  68.6  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0399  pantothenate kinase  28.68 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332128  normal  0.0172041 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2817  pantothenate kinase  28.96 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.301341  normal  0.188453 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3423  putative Baf family transcriptional acitvator  30.7 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.354519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1907  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.65 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2533  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0151685  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1970  Baf family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  25.57 
 
 		 284 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2954  pantothenate kinase  28.78 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0215  pantothenate kinase  32.72 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.113786 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1193  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.216883 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  35.88 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2387  pantothenate kinase  31.51 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10195  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0327  putative transcriptional acitvator, Baf family  30.43 
 
 		 261 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>