More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3089 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3089  ABC transporter-like  100 
 
 		 265 aa  540  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2506  ABC transporter  85.43 
 
 		 261 aa  447  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0247071  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2778  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  82.26 
 
 		 263 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217633  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0968  ABC transporter related  70.52 
 
 		 256 aa  378  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212738  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4549  ABC transporter related  73.31 
 
 		 255 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5539  ABC transporter related  73.23 
 
 		 256 aa  362  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.364959 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5261  ABC transporter related  70.47 
 
 		 256 aa  353  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  58.94 
 
 		 242 aa  295  4e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  55.51 
 
 		 289 aa  292  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  58.3 
 
 		 242 aa  292  4e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  56.75 
 
 		 289 aa  290  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  55.65 
 
 		 244 aa  284  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  54.62 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  55.47 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  56.25 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  52.94 
 
 		 256 aa  280  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  53.57 
 
 		 249 aa  278  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0164  ABC transporter related  56.8 
 
 		 252 aa  278  7e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  54.76 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  55.2 
 
 		 258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  55.28 
 
 		 246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  55.06 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1711  ABC transporter related  54.72 
 
 		 259 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  53.85 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  55.37 
 
 		 252 aa  271  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  52.38 
 
 		 257 aa  271  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  53.17 
 
 		 257 aa  271  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  55.95 
 
 		 248 aa  271  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  56.18 
 
 		 249 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  53.17 
 
 		 257 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  52.55 
 
 		 252 aa  271  9e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  52.4 
 
 		 275 aa  270  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0312  ABC transporter-like  52.78 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  54.18 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  55.78 
 
 		 249 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  55.78 
 
 		 249 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  57.32 
 
 		 263 aa  268  5e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 		 268 aa  268  5e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6087  ABC transporter related  53.75 
 
 		 280 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4911  ABC transporter  51.98 
 
 		 257 aa  268  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0870  ABC transporter related  53.57 
 
 		 269 aa  268  7e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  53.2 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  54.22 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  56.4 
 
 		 244 aa  267  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  54 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  52.78 
 
 		 268 aa  267  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0371  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  53.75 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  54.66 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2015  ABC transporter related  53.75 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  53.41 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2851  ABC transporter related  53.12 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2698  ABC transporter related  53.6 
 
 		 264 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  55.12 
 
 		 254 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  52.17 
 
 		 259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  52 
 
 		 263 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  52.44 
 
 		 244 aa  265  5.999999999999999e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  56.3 
 
 		 250 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5811  ABC transporter related  51.34 
 
 		 268 aa  265  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306389  normal  0.349168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5357  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.19 
 
 		 257 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  53.2 
 
 		 255 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  51.63 
 
 		 240 aa  264  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  51.89 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.6 
 
 		 244 aa  264  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  51.7 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  55.88 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  53.82 
 
 		 254 aa  263  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1137  ABC transporter related  54.62 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11340  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.15 
 
 		 258 aa  263  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.571361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  52.65 
 
 		 282 aa  263  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.22 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  50.39 
 
 		 261 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5124  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.55 
 
 		 510 aa  262  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.214157  normal  0.101359 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  51.76 
 
 		 265 aa  263  3e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5420  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  57.55 
 
 		 516 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  52.67 
 
 		 260 aa  261  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3706  ABC transporter related  51.78 
 
 		 273 aa  261  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.85 
 
 		 251 aa  261  6.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  53.82 
 
 		 260 aa  261  6.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  55.6 
 
 		 245 aa  261  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  51.37 
 
 		 265 aa  261  8e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1977  glutamate ABC transporter ATP-binding protein  51.63 
 
 		 244 aa  261  8e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  52.99 
 
 		 245 aa  261  8e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  51.81 
 
 		 263 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0470  ABC transporter related  53.25 
 
 		 240 aa  261  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000946147  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  54.07 
 
 		 246 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  53.78 
 
 		 245 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  52.67 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  52.44 
 
 		 249 aa  260  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  52.78 
 
 		 246 aa  261  1e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  53.39 
 
 		 245 aa  260  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  52.59 
 
 		 245 aa  260  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  54.03 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0239  ABC transporter related  52.76 
 
 		 256 aa  259  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2606  ABC transporter related  53.78 
 
 		 254 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.0103017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  51.6 
 
 		 256 aa  259  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  53.44 
 
 		 268 aa  260  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  51.63 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  50.39 
 
 		 260 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.59 
 
 		 252 aa  259  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2587  ABC transporter related  50.41 
 
 		 240 aa  260  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.163007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>