More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2452 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2452  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  286  9e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2455  response regulator receiver domain-containing protein  56.56 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5691  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.263538 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4620  response regulator receiver protein  47.17 
 
 		 128 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 222 aa  97.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7251  response regulator receiver protein  41.73 
 
 		 133 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3179  response regulator receiver protein  43.36 
 
 		 132 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00699153  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.52 
 
 		 201 aa  97.1  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5088  response regulator receiver protein  45.28 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 209 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  38.1 
 
 		 212 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 208 aa  94.4  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 207 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  42.74 
 
 		 204 aa  94.4  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.07 
 
 		 212 aa  93.6  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 209 aa  92.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 208 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 208 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0182  response regulator receiver domain-containing protein  35.54 
 
 		 129 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 220 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 216 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 224 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 207 aa  91.3  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5742  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2381  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  36.59 
 
 		 205 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.29 
 
 		 205 aa  90.5  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 208 aa  90.1  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 256 aa  90.5  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  37.29 
 
 		 210 aa  89.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.98 
 
 		 211 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  37.7 
 
 		 212 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.98 
 
 		 211 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 210 aa  89  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.39 
 
 		 212 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  37.4 
 
 		 205 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 213 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 212 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 212 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 218 aa  89.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2885  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 123 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  39.84 
 
 		 205 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7266  response regulator receiver protein  55.7 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 212 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 207 aa  89.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 212 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 212 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 212 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5632  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.653856 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  37.21 
 
 		 210 aa  88.2  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  37.7 
 
 		 212 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  37.7 
 
 		 212 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  37.7 
 
 		 212 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  37.7 
 
 		 212 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.52 
 
 		 214 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 212 aa  88.6  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  37.7 
 
 		 212 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  37.7 
 
 		 212 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  37.7 
 
 		 212 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 214 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  38.26 
 
 		 209 aa  88.2  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 210 aa  87.8  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 214 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 214 aa  87.4  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1832  two component LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 208 aa  87.8  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  35.9 
 
 		 202 aa  87.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 214 aa  87  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 208 aa  87  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 		 215 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  36.52 
 
 		 212 aa  85.9  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5523  response regulator receiver protein  38.21 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 207 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 210 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2681  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  85.9  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2250  response regulator receiver domain-containing protein  39.13 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 220 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0212  response regulator receiver domain-containing protein  35.77 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 214 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 203 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 214 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.52 
 
 		 228 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  39.02 
 
 		 205 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 214 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 208 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5502  response regulator receiver protein  44.95 
 
 		 136 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.020979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 201 aa  84.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 216 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2399  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 203 aa  84  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0873  response regulator receiver domain-containing protein  34.88 
 
 		 135 aa  84  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 207 aa  84  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 208 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2568  response regulator protein  39.13 
 
 		 214 aa  83.6  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0467638  hitchhiker  0.0000000292578 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 208 aa  83.6  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  43.33 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5241  LuxR family DNA-binding response regulator  38.14 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>