213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4813 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4813  penicillin amidase  100 
 
 		 790 aa  1622    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.911238  normal  0.40468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0920  peptidase S45, penicillin amidase  41.27 
 
 		 825 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3142  penicillin amidase  39.18 
 
 		 812 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  30.72 
 
 		 783 aa  216  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  27 
 
 		 821 aa  216  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  30.04 
 
 		 821 aa  209  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  31.31 
 
 		 803 aa  204  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0038  peptidase S45 penicillin amidase  26.95 
 
 		 807 aa  199  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00221465  normal  0.102906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3370  penicillin amidase  29.97 
 
 		 822 aa  197  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  27.63 
 
 		 779 aa  197  9e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  29.55 
 
 		 829 aa  196  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  29.23 
 
 		 789 aa  194  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  30.21 
 
 		 817 aa  192  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  29.03 
 
 		 769 aa  192  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  31.09 
 
 		 770 aa  191  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  28.23 
 
 		 787 aa  189  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  29.17 
 
 		 823 aa  188  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3478  peptidase S45 penicillin amidase  27.77 
 
 		 847 aa  188  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1674  peptidase S45 penicillin amidase  28.12 
 
 		 806 aa  187  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  27.96 
 
 		 796 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  28.32 
 
 		 796 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5635  penicillin amidase (peptidase S45)  25.43 
 
 		 812 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  27.23 
 
 		 843 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  27.67 
 
 		 804 aa  184  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.96 
 
 		 796 aa  184  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  28.14 
 
 		 796 aa  183  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.79 
 
 		 796 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  26.65 
 
 		 827 aa  183  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.79 
 
 		 796 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  27.96 
 
 		 796 aa  182  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.79 
 
 		 796 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  26.68 
 
 		 827 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.96 
 
 		 796 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  27.79 
 
 		 796 aa  180  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4199  peptidase S45 penicillin amidase  25.18 
 
 		 809 aa  180  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4309  peptidase S45 penicillin amidase  25.18 
 
 		 809 aa  180  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3277  penicillin amidase  25.67 
 
 		 782 aa  179  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  26.84 
 
 		 818 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21490  penicilin amidase  25.06 
 
 		 841 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  28.28 
 
 		 855 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4248  peptidase S45 penicillin amidase  26.1 
 
 		 857 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409218  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0788  penicillin amidase  25.96 
 
 		 872 aa  170  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2327  penicillin amidase  27.99 
 
 		 826 aa  170  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00682213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1448  penicillin amidase  26.3 
 
 		 823 aa  170  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.103625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  26.05 
 
 		 808 aa  170  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1495  penicillin amidase  26.5 
 
 		 821 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.505124  normal  0.225613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3311  peptidase S45 penicillin amidase  24.47 
 
 		 811 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2845  putative penicillin acylase (penicillin amidase)  26.14 
 
 		 823 aa  167  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  28.75 
 
 		 809 aa  165  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  26.67 
 
 		 854 aa  164  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  27.21 
 
 		 807 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2103  peptidase S45 penicillin amidase  27.8 
 
 		 810 aa  161  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4858  penicillin amidase  25.25 
 
 		 795 aa  161  6e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  26.56 
 
 		 761 aa  159  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1354  penicillin amidase  27.54 
 
 		 829 aa  159  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.342409  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5300  penicillin amidase family protein  25.19 
 
 		 795 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  28.71 
 
 		 818 aa  157  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  28.4 
 
 		 809 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  27.68 
 
 		 813 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  28.67 
 
 		 854 aa  154  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0898  peptidase S45 penicillin amidase  27.8 
 
 		 785 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1565  acylase precursor  26.83 
 
 		 827 aa  151  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0134254  normal  0.042074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0396  hypothetical protein  26.42 
 
 		 795 aa  151  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0371  putative penicillin amidase  28.46 
 
 		 837 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4754  peptidase S45 penicillin amidase  26.64 
 
 		 792 aa  147  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11589  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0278  putative penicillin amidase  28.46 
 
 		 837 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23695  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1726  penicillin acylase  28.46 
 
 		 837 aa  147  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  25.33 
 
 		 870 aa  146  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03980  hypothetical protein  27.45 
 
 		 795 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0887  putative penicillin amidase  28.25 
 
 		 837 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1174  putative penicillin amidase  28.25 
 
 		 837 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2152  putative penicillin amidase  28.25 
 
 		 837 aa  145  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1877  putative penicillin amidase  28.25 
 
 		 823 aa  145  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  25.88 
 
 		 792 aa  144  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6210  peptidase S45 penicillin amidase  29.11 
 
 		 858 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4805  peptidase S45 penicillin amidase  25.16 
 
 		 844 aa  140  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4245  peptidase S45 penicillin amidase  27.42 
 
 		 784 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423428  normal  0.359084 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0858  penicillin acylase  26.9 
 
 		 780 aa  139  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.459366  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1594  peptidase S45 penicillin amidase  25.88 
 
 		 836 aa  138  5e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1547  penicillin amidase  25.22 
 
 		 809 aa  137  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  25.9 
 
 		 788 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2452  penicillin amidase  25.38 
 
 		 889 aa  136  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288116  normal  0.271218 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  27.03 
 
 		 864 aa  135  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1553  penicillin amidase  25.17 
 
 		 774 aa  134  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0275425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2798  penicillin amidase  24.9 
 
 		 848 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000130023  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  26.42 
 
 		 788 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3025  penicillin acylase II  25.53 
 
 		 786 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  23.68 
 
 		 795 aa  132  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  24.32 
 
 		 903 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  27.39 
 
 		 787 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  26.09 
 
 		 712 aa  129  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  23.44 
 
 		 819 aa  128  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5217  peptidase S45 penicillin amidase  26.71 
 
 		 787 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3871  penicillin amidase  26.97 
 
 		 824 aa  126  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.633889 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  24.22 
 
 		 821 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3892  penicillin amidase  25.94 
 
 		 947 aa  126  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1174  penicillin amidase  24.3 
 
 		 874 aa  126  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.141613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4133  penicillin amidase family protein  27.13 
 
 		 824 aa  125  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.699184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50980  putative penicillin amidase  23.92 
 
 		 847 aa  125  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.646025  hitchhiker  0.000000127919 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  27.1 
 
 		 724 aa  124  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>