More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3798 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3798  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  883    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3854  hypothetical protein  68.86 
 
 		 447 aa  620  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0176  hypothetical protein  67.58 
 
 		 440 aa  609  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4737  hypothetical protein  68.21 
 
 		 443 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4613  hypothetical protein  68.45 
 
 		 443 aa  598  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.527136  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1957  hypothetical protein  64.55 
 
 		 444 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24151  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4086  hypothetical protein  64.09 
 
 		 444 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.745854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4500  hypothetical protein  64.16 
 
 		 444 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.747245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3979  hypothetical protein  64.09 
 
 		 444 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.763643  normal  0.381679 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4280  hypothetical protein  64.09 
 
 		 444 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3437  hypothetical protein  64.09 
 
 		 444 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3496  hypothetical protein  63.64 
 
 		 444 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3480  hypothetical protein  66.59 
 
 		 442 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.634829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3803  hypothetical protein  66.59 
 
 		 442 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3685  hypothetical protein  67.05 
 
 		 442 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.531271 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2387  hypothetical protein  64.37 
 
 		 448 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3268  hypothetical protein  64.14 
 
 		 448 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1402  hypothetical protein  64.37 
 
 		 448 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3154  hypothetical protein  64.14 
 
 		 448 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2094  hypothetical protein  64.37 
 
 		 448 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0471832  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1483  hypothetical protein  64.14 
 
 		 448 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1122  hypothetical protein  64.37 
 
 		 448 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5220  hypothetical protein  62.73 
 
 		 445 aa  568  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275374 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2353  hypothetical protein  64.14 
 
 		 448 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1041  hypothetical protein  63.55 
 
 		 446 aa  568  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3602  hypothetical protein  63.78 
 
 		 444 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0673474  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1142  hypothetical protein  62.95 
 
 		 442 aa  564  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0809653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5468  hypothetical protein  62.5 
 
 		 442 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2003  hypothetical protein  64.19 
 
 		 446 aa  559  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1705  hypothetical protein  63.78 
 
 		 447 aa  556  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0167541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0344  hypothetical protein  63.22 
 
 		 441 aa  555  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2797  hypothetical protein  63.96 
 
 		 447 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94702  normal  0.289939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0398  hypothetical protein  62.93 
 
 		 441 aa  548  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1446  hypothetical protein  64.04 
 
 		 444 aa  550  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0289166  normal  0.430384 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0161  hypothetical protein  60.46 
 
 		 442 aa  544  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3668  hypothetical protein  63.01 
 
 		 451 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0082  hypothetical protein  63.59 
 
 		 450 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0798772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3345  hypothetical protein  62.67 
 
 		 451 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004322  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  57.18 
 
 		 443 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2328  hypothetical protein  58.76 
 
 		 444 aa  518  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.134065  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00991  aminotransferase, class III (AFU_orthologue; AFUA_1G16810)  47.29 
 
 		 448 aa  423  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.47575  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06930  conserved hypothetical protein  46.59 
 
 		 447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.406035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38281  aminotransferase  47.36 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.722642  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06180  class III aminotransferase, putative  43.64 
 
 		 469 aa  341  2e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0804287  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2288  aminotransferase class-III  44.19 
 
 		 442 aa  333  5e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7651  aminotransferase class-III  39.17 
 
 		 451 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2094  aminotransferase class-III  39.29 
 
 		 459 aa  317  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0920345  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2853  aminotransferase class-III  41.51 
 
 		 455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.382989  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3905  aminotransferase  41.84 
 
 		 451 aa  310  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.57399  decreased coverage  0.00444917 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0831  aminotransferase class-III  41.5 
 
 		 470 aa  297  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1177  aminotransferase class-III  43.98 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1551  hypothetical protein  38.48 
 
 		 458 aa  285  8e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0416519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1245  hypothetical protein  40.7 
 
 		 461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1570  hypothetical protein  40.6 
 
 		 461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3075  aminotransferase class-III  43.22 
 
 		 437 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1235  hypothetical protein  40.23 
 
 		 461 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0662195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1218  hypothetical protein  40.23 
 
 		 461 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2915  aminotransferase class-III  39.34 
 
 		 449 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0414678  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13361  hypothetical protein  43.54 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000267145  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4959  hypothetical protein  39.04 
 
 		 467 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.11014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2111  aminotransferase class-III  39.15 
 
 		 453 aa  280  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4862  hypothetical protein  41.01 
 
 		 462 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843286  normal  0.0653436 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4078  hypothetical protein  42.25 
 
 		 468 aa  280  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.90308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3136  hypothetical protein  40.28 
 
 		 456 aa  279  7e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.141218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1493  aminotransferase class-III  40.91 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1771  aminotransferase class-III  41.41 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0784  hypothetical protein  39.86 
 
 		 466 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0848  aminotransferase class-III  42.28 
 
 		 462 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0693468  decreased coverage  0.000282068 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0575  hypothetical protein  38.66 
 
 		 454 aa  277  2e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.088547  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0934  hypothetical protein  39.12 
 
 		 446 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2923  aminotransferase class-III  39.57 
 
 		 451 aa  277  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0806486  normal  0.849242 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0278  hypothetical protein  38.9 
 
 		 462 aa  276  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0404  aminotransferase class-III  39.58 
 
 		 454 aa  276  5e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1536  hypothetical protein  40.71 
 
 		 449 aa  276  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4780  hypothetical protein  38.89 
 
 		 446 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0421  aminotransferase  39.09 
 
 		 456 aa  276  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5503  hypothetical protein  38.89 
 
 		 446 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3587  hypothetical protein  38.89 
 
 		 446 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1364  hypothetical protein  40 
 
 		 449 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0944  hypothetical protein  40 
 
 		 449 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0142965  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0347  hypothetical protein  40 
 
 		 449 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31983  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0627  hypothetical protein  40 
 
 		 449 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.804751  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1275  hypothetical protein  40 
 
 		 449 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381328  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2467  hypothetical protein  40 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.549012  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1489  hypothetical protein  39.71 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147981  hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6095  hypothetical protein  39.95 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0821  aminotransferase class-III  40.55 
 
 		 460 aa  274  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.740249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000637  gamma-aminobutyrate:alpha-ketoglutarate aminotransferase  36.97 
 
 		 468 aa  273  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4687  hypothetical protein  39.35 
 
 		 446 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4163  hypothetical protein  39.58 
 
 		 446 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.45343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3821  hypothetical protein  39.35 
 
 		 446 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000353101 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1287  hypothetical protein  38.52 
 
 		 459 aa  271  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0354138  normal  0.112297 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1202  hypothetical protein  39.77 
 
 		 449 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1032  aminotransferase class-III  39.72 
 
 		 450 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3225  hypothetical protein  39.81 
 
 		 456 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210609  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3134  aminotransferase class-III  39.43 
 
 		 463 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.495081 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1328  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  39.13 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2908  aminotransferase class-III  39.67 
 
 		 485 aa  271  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.597811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1519  hypothetical protein  38.95 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0346179  hitchhiker  0.000407941 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3719  aminotransferase class-III  38.11 
 
 		 455 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>