119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2580 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2580  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 		 199 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.632979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2638  Allergen V5/Tpx-1 family protein  56.35 
 
 		 179 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.450247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1200  hypothetical protein  54.3 
 
 		 184 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2861  Allergen V5/Tpx-1 family protein  55.25 
 
 		 179 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3495  putative SCP-like extracellular protein  54.55 
 
 		 176 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2897  Allergen V5/Tpx-1 related  49.71 
 
 		 176 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.870748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  32.82 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.05 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0167  SCP-like extracellular  33.05 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.119271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  34.48 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  29.22 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4411  SCP-like extracellular  31.09 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  34.19 
 
 		 541 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0445  SCP-like extracellular  35.24 
 
 		 500 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000975734  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  31.3 
 
 		 495 aa  64.7  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  33.04 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4232  hypothetical protein  27.62 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.281804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  31.45 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  30.22 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  30.37 
 
 		 458 aa  62.8  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.11 
 
 		 444 aa  62.4  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.3 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2211  SCP-like extracellular protein  30.53 
 
 		 283 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1179  SCP-like extracellular  33.65 
 
 		 465 aa  62  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249096  hitchhiker  0.000057053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2381  Allergen V5/Tpx-1 related  29.29 
 
 		 310 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0357627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2104  Allergen V5/Tpx-1-like  30 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233408  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  29.77 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3563  hypothetical protein  29.77 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2817  SCP-like extracellular  29.91 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  29.55 
 
 		 294 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  29.41 
 
 		 317 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  29.77 
 
 		 283 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4362  Allergen V5/Tpx-1 related  28.21 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  29.34 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0393  SCP-like extracellular  33.33 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0611399  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2074  SCP-like extracellular  28.83 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.11 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  30.83 
 
 		 296 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  26.67 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2217  SCP-like extracellular  31.19 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  30.71 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  30.77 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  30.71 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  30.71 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  30.71 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  30.71 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  29.61 
 
 		 270 aa  55.1  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  30.71 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  30.71 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  30.71 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  27.19 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.33 
 
 		 321 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  29.31 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  31 
 
 		 293 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  29.91 
 
 		 287 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  29.92 
 
 		 270 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8010  SCP-like extracellular  30.47 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  28.95 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2976  Allergen V5/Tpx-1 related  31.06 
 
 		 334 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0120131  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  31 
 
 		 293 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3268  SCP-like extracellular  33.67 
 
 		 410 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1210  SCP-like extracellular  29.13 
 
 		 276 aa  51.6  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  29.17 
 
 		 338 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  24.68 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0402  SCP-like extracellular  27.97 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  28.57 
 
 		 283 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0598  SCP-like extracellular  30 
 
 		 276 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.845775  normal  0.23326 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1426  SCP-like extracellular  25 
 
 		 328 aa  49.7  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1293  Allergen V5/Tpx-1 related  30.82 
 
 		 335 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.224237  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2195  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.61 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0225446  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  31.86 
 
 		 282 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3137  SCP-like extracellular  28.46 
 
 		 286 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  27.93 
 
 		 260 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  27.13 
 
 		 245 aa  48.5  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0703  SCP/PR1 domain-containing proteins-like  32.69 
 
 		 338 aa  48.5  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501608  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1124  hypothetical protein  27.48 
 
 		 255 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4870  SCP-like extracellular  30.7 
 
 		 293 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.137537 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  26.82 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0309  hypothetical protein  26.5 
 
 		 139 aa  48.1  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0323  hypothetical protein  26.5 
 
 		 139 aa  48.1  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.970328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1412  SCP-like extracellular  35.48 
 
 		 407 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.787858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3450  SCP-like extracellular  35.48 
 
 		 405 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.538197 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0458  Allergen V5/Tpx-1 related  31.07 
 
 		 174 aa  48.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  27.12 
 
 		 285 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  27.13 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0488  Allergen V5/Tpx-1 related  30.95 
 
 		 299 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2711  SCP-like extracellular  33.73 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000599492  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1805  SCP-like extracellular  28.15 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000690986 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1399  Allergen V5/Tpx-1 family protein  33.33 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.235297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2424  SCP-like extracellular  30.77 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.572617  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  24.14 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0202  hypothetical protein  26.05 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00696457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1835  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.05 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.780904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0827  SCP-like extracellular  28.16 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274249  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1690  SCP-like extracellular protein  35.8 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0369  SCP-like extracellular  31.53 
 
 		 570 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.879788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1463  SCP-like extracellular  28.44 
 
 		 312 aa  45.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0639  SCP-like extracellular  25.15 
 
 		 283 aa  45.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>