More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1331 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1331  ABC transporter related  100 
 
 		 250 aa  486  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.58907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1518  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  40.1 
 
 		 376 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0559044 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0538  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  38.91 
 
 		 382 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1570  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  34.67 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.849947  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1021  ABC transporter related  36.79 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00128788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3680  ABC transporter related  34.76 
 
 		 364 aa  99.8  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0428  ABC transporter related  31.56 
 
 		 273 aa  99  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3800  ABC transporter related  33.8 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0089  ABC transporter related  36.97 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0163  ABC transporter related  33.33 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894776  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0161  ABC transporter related  33.33 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000199077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5458  ABC transporter related  35.48 
 
 		 416 aa  95.5  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0635  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 252 aa  94.4  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  34.23 
 
 		 342 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  33.95 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1341  ABC transporter related  34.72 
 
 		 362 aa  94.7  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.068199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  34.74 
 
 		 303 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1380  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 		 356 aa  94  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.33894  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  34.42 
 
 		 292 aa  94.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1206  ABC transporter related  34.33 
 
 		 299 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.508539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50650  Mo transporter, inner membrane ATP-binding component, ModC1  35.4 
 
 		 380 aa  94  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0400965  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1285  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  34.75 
 
 		 362 aa  93.6  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2860  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  34.6 
 
 		 369 aa  93.2  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.522615  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0678  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2922  maltose/mannitol ABC transporter ATP-binding protein  34.78 
 
 		 370 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0305281  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34370  putative ATP-binding component of ABC maltose/mannitol transporter  34.78 
 
 		 370 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0529926  normal  0.319042 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  27.19 
 
 		 299 aa  92  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  36.36 
 
 		 348 aa  92  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1694  ABC transporter related  28.4 
 
 		 299 aa  91.7  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3880  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  33.07 
 
 		 355 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.314115  decreased coverage  0.00984217 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2371  ABC transporter related  35.42 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0363679  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2849  ABC transporter-related protein  32.87 
 
 		 377 aa  91.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0912709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1552  ABC transporter related  30.61 
 
 		 302 aa  91.3  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  30.09 
 
 		 293 aa  91.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  36.7 
 
 		 320 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0537  ABC transporter related  26.78 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 290 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1620  ABC transporter related  29.44 
 
 		 302 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.479618  normal  0.235921 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2041  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.08 
 
 		 356 aa  90.5  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00607  sugar ABC transporter ATP-binding protein  35.45 
 
 		 365 aa  90.1  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0225  ABC transporter related  34.87 
 
 		 349 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.676299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6268  ABC transporter related  33.65 
 
 		 372 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2038  ABC transporter related  33.7 
 
 		 370 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0539483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  33.99 
 
 		 295 aa  89.7  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  32.24 
 
 		 292 aa  89.7  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0947  ABC transporter related  30.83 
 
 		 352 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0546  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein ugpC  35.33 
 
 		 338 aa  89.4  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  26.27 
 
 		 266 aa  89.4  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  30.67 
 
 		 362 aa  89.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5800  ABC transporter related  29.56 
 
 		 251 aa  89.4  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527391 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  31.09 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.62 
 
 		 313 aa  89  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1854  ABC transporter related protein  31.15 
 
 		 303 aa  89  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0626891  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  34.85 
 
 		 347 aa  89  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.18 
 
 		 291 aa  89  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2065  metal ABC transporter, ATP-binding protein  29.95 
 
 		 249 aa  89  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6367  ABC transporter related  31.61 
 
 		 371 aa  89  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.114303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  35.92 
 
 		 240 aa  89  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1174  ABC transporter related  32.37 
 
 		 233 aa  88.6  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0251725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4204  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  32.94 
 
 		 355 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1627  ABC transporter related  29.31 
 
 		 302 aa  88.6  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0889533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3818  ABC transporter related  31.92 
 
 		 370 aa  88.6  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1050  ABC transporter related  32.77 
 
 		 356 aa  88.6  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.125219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1205  ABC transporter related  28.35 
 
 		 275 aa  88.6  9e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00183606  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  33.49 
 
 		 303 aa  87.8  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  29.31 
 
 		 302 aa  87.8  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2437  ABC transporter:TOBE  34.78 
 
 		 368 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.274742  hitchhiker  0.00997212 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5585  ABC transporter galacturonide binding/ATPase protein  32.47 
 
 		 364 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00523647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  34.09 
 
 		 406 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3358  cytochrome c biogenesis protein CcmA  37.71 
 
 		 202 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.502748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5036  ABC transporter related  33.95 
 
 		 325 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0737  ABC transporter related  33.69 
 
 		 238 aa  88.6  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0135458 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  35.35 
 
 		 344 aa  87.8  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1766  ABC transporter related  30.52 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0708561  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0778  ABC transporter related protein  35.32 
 
 		 976 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.52 
 
 		 360 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  32.11 
 
 		 315 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  34.48 
 
 		 356 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6964  ABC transporter related  30.43 
 
 		 363 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  30.29 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  32.56 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1532  ABC transporter related  35.57 
 
 		 360 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0907  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  30.98 
 
 		 375 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0858146  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6306  ABC transporter related  30.43 
 
 		 363 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.517463 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  31.52 
 
 		 360 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.52 
 
 		 360 aa  87  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  28.09 
 
 		 306 aa  86.7  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1358  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.38 
 
 		 374 aa  87  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  33.01 
 
 		 360 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0900  ABC transporter, ATPase subunit  34.4 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.281064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  31.52 
 
 		 360 aa  87  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.52 
 
 		 360 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1651  ABC-type sugar transport system, ATPase component  32.85 
 
 		 402 aa  86.7  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  31.52 
 
 		 360 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  31.52 
 
 		 360 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  33.67 
 
 		 330 aa  86.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  28.57 
 
 		 310 aa  86.7  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3126  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 		 364 aa  86.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.97363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  34.83 
 
 		 306 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1233  ABC transporter related  29.79 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.954644  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>