More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2805 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 315 aa  652    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  37.28 
 
 		 279 aa  200  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  37.15 
 
 		 288 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  39.34 
 
 		 284 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  34.63 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  38.63 
 
 		 287 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  36.88 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  34.28 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  34.28 
 
 		 288 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  34.28 
 
 		 288 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  35.44 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  37.16 
 
 		 284 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  34.88 
 
 		 300 aa  169  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  39.24 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  38.82 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  33.6 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  32.84 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 		 284 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  37.92 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  33.72 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  33.69 
 
 		 284 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  33.72 
 
 		 282 aa  159  8e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  33.81 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  31.79 
 
 		 308 aa  156  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  32.51 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  32.97 
 
 		 359 aa  145  9e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  30.71 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  28.11 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  33.33 
 
 		 244 aa  135  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  31.37 
 
 		 284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  32.82 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  30.22 
 
 		 283 aa  126  5e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  28.38 
 
 		 299 aa  126  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  31.52 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  27.37 
 
 		 2762 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 		 289 aa  99.4  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.35 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  27.52 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  24.63 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  25.86 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  29.28 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  24.48 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  26.41 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  23.3 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  31.21 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  30.5 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  30.5 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  25.93 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  30.5 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  30.5 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  30.5 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  32.37 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  30.5 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  31.76 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  23.53 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  24.49 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 339 aa  67  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  34.45 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  30.87 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.8 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  31.69 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  24.48 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  31.69 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>