137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0918 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0918  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  396  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.670285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01230  hypothetical protein  76.56 
 
 		 197 aa  311  3.9999999999999997e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3045  hypothetical protein  56.48 
 
 		 195 aa  225  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3249  hypothetical protein  55.56 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.987033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2465  hypothetical protein  53.12 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1829  hypothetical protein  53.72 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00879192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2380  hypothetical protein  52.6 
 
 		 198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.697373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2687  hypothetical protein  52.6 
 
 		 198 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.500791  normal  0.525319 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1619  hypothetical protein  55.32 
 
 		 198 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2565  hypothetical protein  51.32 
 
 		 206 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4749  hypothetical protein  36.65 
 
 		 200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269123  normal  0.291326 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1632  hypothetical protein  32.99 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1185  hypothetical protein  29.67 
 
 		 237 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1202  hypothetical protein  29.67 
 
 		 237 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1212  hypothetical protein  29.67 
 
 		 237 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.118712 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6085  hypothetical protein  31.61 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.195869 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3477  hypothetical protein  28.5 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.247317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2330  hypothetical protein  29.84 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3746  hypothetical protein  27.98 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5710  hypothetical protein  31.28 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.589749  normal  0.302517 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1329  hypothetical protein  31.05 
 
 		 205 aa  88.6  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2657  hypothetical protein  31.05 
 
 		 204 aa  88.2  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0942  hypothetical protein  29.29 
 
 		 232 aa  85.9  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.84686  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0329  hypothetical protein  28.88 
 
 		 233 aa  84.7  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1324  hypothetical protein  27.92 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2652  hypothetical protein  27.41 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2558  hypothetical protein  30.12 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.706217  normal  0.107979 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1891  hypothetical protein  28.73 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4532  hypothetical protein  27.27 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.668981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4884  hypothetical protein  28.57 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.180519  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1589  urea carboxylase-associated protein 1  27.32 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.138345  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2605  urea carboxylase-associated protein 1  29.02 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00607415 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3978  hypothetical protein  30 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1339  hypothetical protein  30.22 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2501  hypothetical protein  26.71 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1223  hypothetical protein  27.68 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0296211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2187  hypothetical protein  25.73 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4242  hypothetical protein  29.83 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3976  hypothetical protein  29.83 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.647355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0037  hypothetical protein  26.49 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0850268  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6519  urea carboxylase-associated protein 2  28.12 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.507732 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0073  hypothetical protein  29.67 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2796  hypothetical protein  27.27 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0112112  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6106  urea carboxylase-associated protein 1  26.46 
 
 		 216 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.483915 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4018  urea carboxylase-associated protein 1  24.86 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3723  hypothetical protein  24.86 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6518  urea carboxylase-associated protein 1  25.93 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.499426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1061  hypothetical protein  27.32 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6107  urea carboxylase-associated protein 2  27.5 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.501248 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2360  hypothetical protein  27.32 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.579731  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3088  urea carboxylase-associated protein 1  25.97 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.712577  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2682  urea carboxylase-associated protein 1  27.47 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1359  hypothetical protein  28.57 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.136941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3901  hypothetical protein  24.86 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.388062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4036  hypothetical protein  25.64 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278861  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0046  urea carboxylase-associated protein 1  28.11 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2395  urea carboxylase-associated protein 1  28.02 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06335  conserved hypothetical protein  23.63 
 
 		 312 aa  68.9  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2524  hypothetical protein  26.74 
 
 		 310 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578809  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2305  urea carboxylase-associated protein 1  24.73 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1791  hypothetical protein  26.34 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0797  urea carboxylase-associated protein 1  26.92 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2775  urea carboxylase-associated protein 1  24.87 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0927346  normal  0.026048 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4087  hypothetical protein  27.14 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1328  hypothetical protein  23.26 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.921345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2728  hypothetical protein  25.38 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4448  hypothetical protein  25 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3791  hypothetical protein  25.82 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.846028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1224  hypothetical protein  25.14 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3315  hypothetical protein  25.53 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0802  hypothetical protein  27.37 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4533  hypothetical protein  23.89 
 
 		 277 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2729  hypothetical protein  25.29 
 
 		 260 aa  64.7  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.56 
 
 		 761 aa  64.3  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2500  hypothetical protein  25.14 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2396  urea carboxylase-associated protein 2  28.8 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1918  hypothetical protein  30.15 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4449  hypothetical protein  26.13 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1126  hypothetical protein  25.68 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3985  hypothetical protein  26.13 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.134584 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.97 
 
 		 789 aa  62.8  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4241  hypothetical protein  29.02 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2604  urea carboxylase-associated protein 2  25.45 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965132 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3087  urea carboxylase-associated protein 2  25.53 
 
 		 244 aa  62  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0903  hypothetical protein  22.29 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497608  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1314  hypothetical protein  23.98 
 
 		 302 aa  61.2  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  hitchhiker  0.0088422 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3975  hypothetical protein  28.5 
 
 		 241 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2656  hypothetical protein  22.94 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0607  hypothetical protein  26.74 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3668  hypothetical protein  21.76 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  24.46 
 
 		 757 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3977  hypothetical protein  28.06 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2683  urea carboxylase-associated protein 2  29.5 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0765  urea carboxylase-associated protein 1  26.46 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63227  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45364  predicted protein  26.7 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0471946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1360  hypothetical protein  28.57 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.101238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.43 
 
 		 772 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.932347  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0573  hypothetical protein  25.64 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.329017  normal  0.178207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3460  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.37 
 
 		 781 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5229  urea carboxylase-associated protein 1  25.67 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0105339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>