More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0954 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0954  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 1168 aa  2395    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.859689  normal  0.0860777 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0396  formate dehydrogenase alpha subunit  73.79 
 
 		 1175 aa  1803    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0603241 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1056  formate dehydrogenase  77.87 
 
 		 1168 aa  1939    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1408  formate dehydrogenase  71.79 
 
 		 1170 aa  1810    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1994  molybdopterin oxidoreductase  75.17 
 
 		 1168 aa  1871    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00248434  normal  0.623022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.76 
 
 		 1059 aa  273  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.26 
 
 		 1010 aa  272  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.79 
 
 		 879 aa  270  1e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.8 
 
 		 1016 aa  267  8e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.69 
 
 		 1009 aa  265  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.49 
 
 		 1020 aa  265  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.73 
 
 		 1061 aa  265  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.49 
 
 		 1020 aa  264  8e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  28.66 
 
 		 1010 aa  260  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  28.62 
 
 		 1010 aa  260  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.080154 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2373  formate dehydrogenase large subunit  30.56 
 
 		 999 aa  259  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446398 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0827  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.64 
 
 		 1050 aa  258  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.798346  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  32.94 
 
 		 899 aa  254  9.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.18 
 
 		 925 aa  253  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.96 
 
 		 1004 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.54 
 
 		 963 aa  252  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.19 
 
 		 893 aa  251  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0099  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.96 
 
 		 1004 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0401  formate dehydrogenase alpha subunit  30.02 
 
 		 964 aa  251  8e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.16 
 
 		 988 aa  250  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.16 
 
 		 988 aa  250  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.78 
 
 		 988 aa  249  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.76 
 
 		 685 aa  249  2e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1570  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.18 
 
 		 1014 aa  249  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.37 
 
 		 963 aa  249  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2182  molybdopterin oxidoreductase  30.22 
 
 		 1001 aa  248  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.461283  normal  0.03262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.03 
 
 		 900 aa  248  6e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2586  molybdopterin oxidoreductase  30.22 
 
 		 1001 aa  247  8e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.537244  normal  0.227265 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.21 
 
 		 961 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.45 
 
 		 754 aa  247  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.91 
 
 		 898 aa  246  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3709  molybdopterin oxidoreductase  29.82 
 
 		 970 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0337  molybdopterin oxidoreductase  29.61 
 
 		 949 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.7 
 
 		 945 aa  244  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.67 
 
 		 989 aa  244  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.11 
 
 		 893 aa  243  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3087  molybdopterin oxidoreductase  30.49 
 
 		 987 aa  243  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.12 
 
 		 989 aa  243  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3464  molybdopterin oxidoreductase  29.84 
 
 		 989 aa  242  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.226361 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.83 
 
 		 989 aa  242  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.96 
 
 		 989 aa  241  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4509  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.17 
 
 		 949 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.23 
 
 		 933 aa  241  6.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.4 
 
 		 957 aa  240  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0233  molybdopterin oxidoreductase  28.57 
 
 		 950 aa  240  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4136  molybdopterin oxidoreductase  28.57 
 
 		 950 aa  240  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.448434  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.21 
 
 		 924 aa  239  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0057  twin-arginine translocation pathway signal  29.32 
 
 		 949 aa  239  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0971  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.82 
 
 		 1011 aa  239  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.893461  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1217  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.38 
 
 		 1008 aa  239  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0663541 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.58 
 
 		 927 aa  239  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4224  molybdopterin oxidoreductase  28.43 
 
 		 950 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.22 
 
 		 900 aa  238  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4106  molybdopterin oxidoreductase  28.43 
 
 		 950 aa  238  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.61 
 
 		 668 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2533  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.97 
 
 		 1010 aa  238  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0682  twin-arginine translocation pathway signal  29.52 
 
 		 1012 aa  237  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.7 
 
 		 937 aa  237  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3720  formate dehydrogenase alpha subunit  28.18 
 
 		 950 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2791  molybdopterin oxidoreductase  28.91 
 
 		 989 aa  235  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0527141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6354  putative formate dehydrogenase alpha subunit  31.05 
 
 		 909 aa  235  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4421  molybdopterin oxidoreductase  29.02 
 
 		 949 aa  235  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1915  formate dehydrogenase alpha subunit  29.18 
 
 		 953 aa  235  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3791  formate dehydrogenase alpha subunit  28.06 
 
 		 950 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3510  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.26 
 
 		 1015 aa  235  4.0000000000000004e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3916  formate dehydrogenase alpha subunit  28.51 
 
 		 950 aa  234  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733885 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4813  molybdopterin oxidoreductase  29.07 
 
 		 949 aa  234  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.517826 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1398  molybdopterin oxidoreductase  29.15 
 
 		 992 aa  234  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5278  molybdopterin oxidoreductase  29.95 
 
 		 979 aa  234  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940063  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02278  hypothetical protein  29.08 
 
 		 951 aa  233  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0059  molybdopterin oxidoreductase  29.45 
 
 		 949 aa  233  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.65892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0834  molybdopterin oxidoreductase  29.78 
 
 		 991 aa  232  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3728  molybdopterin oxidoreductase  29.46 
 
 		 994 aa  231  5e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0457  molybdopterin oxidoreductase  29.6 
 
 		 980 aa  231  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.37 
 
 		 987 aa  231  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0389  molybdopterin oxidoreductase  29.82 
 
 		 980 aa  231  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2761  twin-arginine translocation pathway signal  31.48 
 
 		 1025 aa  231  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.297303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.36 
 
 		 1012 aa  231  6e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0937  twin-arginine translocation pathway signal  30.98 
 
 		 991 aa  231  7e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63605  formate dehydrogenase-O, major subunit  26.69 
 
 		 1026 aa  231  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3613  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.28 
 
 		 949 aa  231  8e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.982249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1120  putative formate dehydrogenase, alpha subunit  29.47 
 
 		 951 aa  230  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4062  molybdopterin oxidoreductase  30.1 
 
 		 996 aa  230  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.818132  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003494  formate dehydrogenase-O major subunit  28.61 
 
 		 951 aa  230  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3281  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.33 
 
 		 979 aa  230  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  30.39 
 
 		 745 aa  229  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3045  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.07 
 
 		 1015 aa  229  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4137  molybdopterin oxidoreductase  28.87 
 
 		 949 aa  229  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0063  molybdopterin oxidoreductase  28.28 
 
 		 951 aa  229  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.92 
 
 		 979 aa  228  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2352  molybdopterin oxidoreductase  33.76 
 
 		 1111 aa  228  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.92 
 
 		 979 aa  228  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3795  formate dehydrogenase alpha subunit  28.11 
 
 		 950 aa  228  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3920  formate dehydrogenase alpha subunit  28.11 
 
 		 950 aa  228  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.922429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0421  molybdopterin oxidoreductase  29.7 
 
 		 980 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273483  normal  0.81793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>