110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0533 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0533  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.773932 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  36.21 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1444  hypothetical protein  34.17 
 
 
144 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.578879  normal  0.348542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  36.59 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  33.04 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  34.43 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  35.58 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  37.82 
 
 
165 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  38.53 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7748  protein of unknown function DUF336  36.45 
 
 
133 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  37.5 
 
 
167 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  36.28 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  41.46 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  36.59 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  36.59 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6208  protein of unknown function DUF336  36.94 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.84662  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4093  hypothetical protein  35.04 
 
 
183 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305662  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2690  hypothetical protein  35.96 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  35.51 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  33.04 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  35.77 
 
 
137 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3190  hypothetical protein  35.45 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.226955 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  34.95 
 
 
134 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0030  hypothetical protein  36.89 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4567  hypothetical protein  36.89 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0335545 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  35.04 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  33.64 
 
 
144 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  33.62 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  36.11 
 
 
207 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  33.98 
 
 
134 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  37.37 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3558  glcG protein  32.76 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00214965  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  31.9 
 
 
134 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  31.75 
 
 
166 aa  50.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  30.33 
 
 
144 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  30.33 
 
 
144 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  31.73 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  34.26 
 
 
133 aa  50.4  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  30.33 
 
 
144 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0200  hypothetical protein  34.45 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27391 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  34.34 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  33.03 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  34.55 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  36.61 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  35 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43300  glyoxylate glcG protein  35.85 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.384329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  31.48 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  32.2 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  35.16 
 
 
183 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7347  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238753  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4061  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  31.03 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  30 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  37.11 
 
 
333 aa  47.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  35.85 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6609  hypothetical protein  31.58 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  32.73 
 
 
165 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  33.91 
 
 
169 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  31.73 
 
 
121 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  38.46 
 
 
150 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  38.46 
 
 
150 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  36.54 
 
 
197 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0219  hypothetical protein  36.9 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3070  hypothetical protein  31.62 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3334  hypothetical protein  31.19 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126632  hitchhiker  0.00217166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  29.69 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3164  hypothetical protein  37.04 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6724  hypothetical protein  31.97 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0913  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  35.29 
 
 
173 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  34.23 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  35.14 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1258  hypothetical protein  32 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6395  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1978  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.72681  normal  0.810178 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  30.63 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  34.58 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1475  protein of unknown function DUF336  32.89 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  31.19 
 
 
137 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3828  hypothetical protein  33.05 
 
 
143 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  39.29 
 
 
189 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44990  hypothetical protein  33.01 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3315  hypothetical protein  32.38 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173463  normal  0.388949 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1583  hypothetical protein  33.03 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6248  hypothetical protein  33.03 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.6551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2606  protein of unknown function DUF336  28.04 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982086  normal  0.117603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2583  hypothetical protein  35.37 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02845  hypothetical protein  32.08 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.250473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0720  protein of unknown function DUF336  32.08 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3748  hypothetical protein  30.7 
 
 
132 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  31.82 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  33.66 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3149  hypothetical protein  32.08 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3436  hypothetical protein  32.08 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0724  hypothetical protein  32.08 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3254  hypothetical protein  32.08 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  30.63 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02795  hypothetical protein  32.08 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.211483  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  31 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  32.65 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  35.04 
 
 
167 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>