More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2075 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
381 aa  769    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  47.21 
 
 
379 aa  351  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  47.48 
 
 
381 aa  296  5e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  44.06 
 
 
382 aa  294  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  42.29 
 
 
375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  42.02 
 
 
358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  43.42 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  38.52 
 
 
375 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 
374 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  32.53 
 
 
396 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
395 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  30.54 
 
 
377 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 
381 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  31.04 
 
 
359 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  30.81 
 
 
364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
372 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
666 aa  112  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  24.81 
 
 
384 aa  106  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  28.5 
 
 
357 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  33.21 
 
 
396 aa  103  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  29.81 
 
 
358 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  28.68 
 
 
397 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
386 aa  99.8  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
364 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  24.65 
 
 
382 aa  95.1  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  39.31 
 
 
392 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3138  glycosyltransferase (group I)  23.94 
 
 
797 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150629  normal  0.748341 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  40.16 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  28.78 
 
 
419 aa  82.8  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  27.88 
 
 
363 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1060  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 
789 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  40.82 
 
 
417 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  22.76 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0837  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
379 aa  77  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120693  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  19.61 
 
 
359 aa  77  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
747 aa  77  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
410 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6301  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
428 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322189 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  25.32 
 
 
364 aa  75.9  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  29.6 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3438  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1240  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  34.75 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
397 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  28.17 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  33.19 
 
 
362 aa  72.8  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
763 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  30.13 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
422 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  36.91 
 
 
385 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
360 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02589  Glycosyltransferase  30.63 
 
 
403 aa  71.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.147496  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
419 aa  71.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3169  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  26.91 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
436 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  22.77 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  36.6 
 
 
418 aa  69.7  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 
404 aa  69.3  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
373 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
767 aa  69.3  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4416  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
386 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 
384 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1455  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 
759 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.402299  normal  0.663839 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  34.94 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
364 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
780 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 
376 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
382 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 
446 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  35.81 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6058  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  27.14 
 
 
386 aa  67.4  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  36.02 
 
 
443 aa  67  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
388 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  33.87 
 
 
417 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  31.5 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2343  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
350 aa  67  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>