More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0247 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0247  putative signal-transduction protein with CBS domains  100 
 
 		 148 aa  304  2.0000000000000002e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.414289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0126  CBS  88.51 
 
 		 148 aa  280  5.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0283  putative signal-transduction protein with CBS domains  89.19 
 
 		 148 aa  278  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.974941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2718  putative signal-transduction protein with CBS domains  87.84 
 
 		 150 aa  278  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2345  putative signal-transduction protein with CBS domains  89.19 
 
 		 148 aa  277  4e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0178  signal-transduction protein  88.51 
 
 		 148 aa  276  9e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1996  CBS  86.49 
 
 		 148 aa  275  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0307  signal-transduction protein  53.9 
 
 		 147 aa  164  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.400951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4660  CBS domain-containing protein  42.74 
 
 		 199 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0804  CBS domain containing protein  45 
 
 		 208 aa  103  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4391  CBS domain-containing protein  44.54 
 
 		 204 aa  99  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2130  CBS domain containing protein  41.6 
 
 		 208 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2061  protein of unknown function CP12  40.8 
 
 		 203 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3943  CBS domain-containing protein  41.27 
 
 		 197 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  41.13 
 
 		 208 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  41.13 
 
 		 208 aa  90.9  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3468  signal-transduction protein  38.4 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0167  hypothetical protein  32.84 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.457357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004143  hypothetical protein  33.06 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1950  CBS domain-containing protein  34.19 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.675111  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1500  signal transduction protein  33.33 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.722324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1090  putative signal transduction protein with CBS domains  31.01 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1223  signal-transduction protein  31.75 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1829  signal transduction protein  33.06 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0766712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1242  signal-transduction protein  28.17 
 
 		 213 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0804  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0784  signal-transduction protein  28.24 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1594  signal-transduction protein  32.77 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3476  signal-transduction protein  30 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52358 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0661  signal-transduction protein  31.25 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0346092  normal  0.201572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2274  signal-transduction protein  32.77 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000468461  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0262  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  28.68 
 
 		 586 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  30.33 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0310  hypothetical protein  33.87 
 
 		 284 aa  62  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  30.25 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2759  signal-transduction protein  28.1 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.210578  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1304  signal-transduction protein  29.69 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0214  putative signal transduction protein with CBS domains  30.95 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  30.33 
 
 		 148 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  33.05 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02457  hypothetical protein  31.06 
 
 		 626 aa  60.1  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  30.08 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  29.84 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1050  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  28.35 
 
 		 600 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2290  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  24.48 
 
 		 589 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  29.06 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1794  signal-transduction protein  36.92 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190963  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  34.11 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1768  signal-transduction protein  31.86 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00805181  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  30.23 
 
 		 863 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0568  signal-transduction protein  26.98 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.706815 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  29.84 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3328  putative signal transduction protein with CBS domains  31.5 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003608  Signal transduction protein  29.55 
 
 		 626 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  31.53 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0910  hypothetical protein  31.11 
 
 		 637 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.529281  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0269  signal transduction protein  32.84 
 
 		 688 aa  58.9  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  30.09 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  29.32 
 
 		 292 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  33.58 
 
 		 688 aa  57.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  29.31 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  31.9 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0100  putative cyclic nucleotide binding protein  31.58 
 
 		 626 aa  57  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  25.56 
 
 		 897 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  30.97 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2665  putative signal transduction protein with CBS domains  37.3 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000148572  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  29.2 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003141  Signal transduction protein  31.62 
 
 		 629 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  29.2 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1383  signal transduction protein  29.82 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.56563 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 		 615 aa  55.1  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2066  CBS domain containing protein  31.25 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480753 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0305  signal-transduction protein  29.69 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0743786  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2231  signal-transduction protein  33.85 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.943647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  28.21 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  31.06 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  28.8 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0764  CBS domain-containing protein  29.85 
 
 		 605 aa  54.3  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0514021 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2321  nucleotidyltransferase  28.47 
 
 		 627 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.477711  hitchhiker  0.00895935 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  32.5 
 
 		 688 aa  53.9  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0967  nucleotidyltransferase  28.79 
 
 		 641 aa  53.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.151654 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  29.69 
 
 		 598 aa  53.9  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  31.9 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0415  signal-transduction protein  28.47 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.682078  normal  0.0782148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3096  signal-transduction protein  29.13 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.67 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  28.17 
 
 		 859 aa  53.5  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  28.21 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2907  signal-transduction protein  34.53 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.986231 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1811  cyclic nucleotide-binding protein  25.55 
 
 		 625 aa  52.8  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  25 
 
 		 426 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0340  signal-transduction protein  31.45 
 
 		 120 aa  53.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0589746  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  23.58 
 
 		 141 aa  52.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  29.03 
 
 		 769 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  30.7 
 
 		 324 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1599  CBS domain containing protein  31.06 
 
 		 206 aa  52  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  25.38 
 
 		 618 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1198  CBS  28.93 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  30.19 
 
 		 120 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0345  signal transduction protein  30.82 
 
 		 411 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>