108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04134 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04134  outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3483  Lipocalin family protein  60.76 
 
 		 200 aa  216  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5827  Lipocalin family protein  37.74 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6584  lipocalin-like protein  37.11 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7080  Lipocalin family protein  36.26 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0197  putative outer membrane lipoprotein  32.16 
 
 		 202 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1313  Lipocalin family protein  36.51 
 
 		 159 aa  85.9  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1894  putative outer membrane lipoprotein, lipocalin Blc like  32.56 
 
 		 193 aa  85.1  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.930658 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0052  Lipocalin family protein  32.05 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0126  Lipocalin family protein  30.18 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1238  Lipocalin family protein  33.07 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5543  Lipocalin family protein  28.74 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.472799  normal  0.93837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  29.45 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  31.5 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1950  Lipocalin family protein  26.86 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.100956  normal  0.0832884 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46924  predicted protein  25.73 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0938391  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  32.62 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  29.01 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  29.86 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  31.71 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03292  outer membrane lipoprotein; lipocalin  28.57 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.658699  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  31.06 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  25.75 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  29.73 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  24.54 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  26.51 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0469  outer membrane lipoprotein Blc  31.08 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0639  Lipocalin family protein  29.37 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  25.75 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  25.9 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  30.25 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  29.66 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  23.39 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1667  Lipocalin family protein  26.59 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047645  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  23.49 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  26.09 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3785  lipocalin-like protein  26.99 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  decreased coverage  0.000240027 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  26.59 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  28.14 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  26.61 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  25.66 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  27.61 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  30.83 
 
 		 164 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  28.24 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  25.28 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  27.61 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  26.83 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  27.63 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45620  Lipocalin-like protein  29.41 
 
 		 184 aa  51.2  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  24.85 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  24.85 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000042  lipoprotein Blc  27.59 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  29.41 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  29.73 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  28.48 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  26.19 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  28.68 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  28.49 
 
 		 174 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  26.75 
 
 		 221 aa  48.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05664  lipocalin  26.05 
 
 		 173 aa  48.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  27.56 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  26.17 
 
 		 171 aa  48.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  28.57 
 
 		 174 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1788  Lipocalin family protein  25.98 
 
 		 176 aa  47.8  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0445  Lipocalin family protein  24.64 
 
 		 629 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  25.35 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  28.49 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  26.28 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  27.5 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  24.26 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  24.26 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  24.02 
 
 		 171 aa  47  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  28.49 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0140  Lipocalin family protein  27.03 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0911152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  25.58 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  25.58 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  25.58 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  25.68 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  26.96 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  24.18 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  26.53 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  27.15 
 
 		 171 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  26.02 
 
 		 176 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4942  Lipocalin family protein  29.7 
 
 		 127 aa  45.1  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.122636  normal  0.309932 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  26.8 
 
 		 171 aa  45.1  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  25.58 
 
 		 202 aa  44.7  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  24.29 
 
 		 177 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  25.5 
 
 		 177 aa  44.7  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1991  outer membrane lipoprotein, lipocalin  27.35 
 
 		 182 aa  44.7  0.0009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.486908  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  25 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0865  Lipocalin family protein  24.63 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85479  hitchhiker  0.00294878 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  23.89 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  24.56 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1177  Lipocalin family protein  25.4 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  24.29 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  24 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  24.36 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  26.02 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3556  Lipocalin family protein  23.84 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  24.81 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>