115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0140 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0140  Lipocalin family protein  100 
 
 
177 aa  360  5.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0911152  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  44.2 
 
 
190 aa  127  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  40.61 
 
 
190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  39.86 
 
 
189 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  32.74 
 
 
181 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1313  Lipocalin family protein  38.13 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  34.68 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  28.92 
 
 
185 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  32.61 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  31.78 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  36.96 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  26.9 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  29.07 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1238  Lipocalin family protein  31.85 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  34.4 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  31.54 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  31.62 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1685  Lipocalin-like  35 
 
 
368 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  29.58 
 
 
226 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45620  Lipocalin-like protein  32.28 
 
 
184 aa  62.4  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  32.65 
 
 
189 aa  62  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  27.49 
 
 
192 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  27.27 
 
 
167 aa  60.8  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  29.41 
 
 
192 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  29.37 
 
 
189 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  28.36 
 
 
190 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  29.38 
 
 
164 aa  58.2  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5827  Lipocalin family protein  26.7 
 
 
206 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  26.49 
 
 
182 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  27.95 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0865  Lipocalin family protein  23.91 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85479  hitchhiker  0.00294878 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  27.85 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  26.97 
 
 
181 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7080  Lipocalin family protein  26.53 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  29.85 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  26.55 
 
 
181 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  25.37 
 
 
190 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  26.55 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  25.37 
 
 
190 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  27.33 
 
 
171 aa  55.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  25.28 
 
 
171 aa  54.7  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  25 
 
 
189 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  25.9 
 
 
171 aa  54.3  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  29.23 
 
 
164 aa  54.3  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  26.82 
 
 
188 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6584  lipocalin-like protein  26.67 
 
 
202 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1158  Lipocalin-like protein  30.66 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1175  Lipocalin family protein  30.66 
 
 
171 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.176258 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3140  Lipocalin family protein  27.34 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.276328  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  27.87 
 
 
180 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  28.14 
 
 
198 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  25.37 
 
 
190 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1788  Lipocalin family protein  27.86 
 
 
176 aa  52.4  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0188569  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0197  putative outer membrane lipoprotein  25.85 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3785  lipocalin-like protein  29.14 
 
 
211 aa  52  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  decreased coverage  0.000240027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1185  Lipocalin family protein  30.66 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180215  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  24.29 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  24.86 
 
 
174 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4922  Lipocalin family protein  30.99 
 
 
171 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  26.58 
 
 
176 aa  50.8  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1498  Lipocalin family protein  30.43 
 
 
166 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  27.98 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  24.86 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2835  Lipocalin family protein  27.14 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.345379  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  29.01 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  29.01 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  24.84 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  25 
 
 
202 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  22.78 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  26.01 
 
 
179 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3826  Lipocalin-like  26.32 
 
 
198 aa  49.3  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  27.41 
 
 
189 aa  48.9  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  25.61 
 
 
174 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1532  putative homolog of BLC protein  28.07 
 
 
149 aa  48.1  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  24.36 
 
 
202 aa  48.1  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05664  lipocalin  26.24 
 
 
173 aa  48.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  26.85 
 
 
200 aa  47.8  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  24.29 
 
 
147 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  28.57 
 
 
174 aa  47.8  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  26.43 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  29.2 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  25.14 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2134  Lipocalin family protein  27.22 
 
 
180 aa  47  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0834445  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  25.53 
 
 
172 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  21.3 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0342  putative Blc-like protein  26.89 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0595  hypothetical protein  27.34 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0414  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  24.46 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2248  Lipocalin family protein  27.34 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.385259 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0052  Lipocalin family protein  25.5 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04134  outer membrane lipoprotein  27.03 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0639  Lipocalin family protein  25.35 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  24.16 
 
 
174 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1894  putative outer membrane lipoprotein, lipocalin Blc like  26.47 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.930658 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  24.82 
 
 
170 aa  45.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0694  Lipocalin family protein  25.54 
 
 
174 aa  44.7  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000042  lipoprotein Blc  25.34 
 
 
177 aa  44.7  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  23.49 
 
 
176 aa  44.7  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2381  lipocalin-like protein  26.17 
 
 
201 aa  43.9  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0126  Lipocalin family protein  24.11 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>