More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01689 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  100 
 
 		 206 aa  411  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  63.18 
 
 		 234 aa  269  2e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  62.69 
 
 		 234 aa  266  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  65.41 
 
 		 210 aa  238  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  47.9 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  46.11 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  42.53 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  42.77 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  44.44 
 
 		 199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  41.92 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  39.88 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  39.88 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  43.18 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  43.79 
 
 		 197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  41.57 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  41.88 
 
 		 207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  39.29 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  37.79 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  38.92 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  40.85 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  39.16 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  37.08 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  37.06 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  36.9 
 
 		 209 aa  117  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  37.5 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  36.78 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0976  YceI  42.53 
 
 		 213 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  36.21 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  40.72 
 
 		 213 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  36.93 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  36.9 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  30.86 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  37.21 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  35.09 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  35.4 
 
 		 205 aa  105  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  39.53 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  31.22 
 
 		 213 aa  104  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  31.22 
 
 		 213 aa  104  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  35.83 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  34.81 
 
 		 204 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  36.93 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  35 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  36.67 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  36.93 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  36.93 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  36.78 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  36.93 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  36.93 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  36.93 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  36.78 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  35.09 
 
 		 198 aa  101  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  33.51 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  33.91 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  37.21 
 
 		 183 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  37.93 
 
 		 195 aa  99.4  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  32.6 
 
 		 207 aa  98.2  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  34.88 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  30.64 
 
 		 193 aa  96.3  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  33.52 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  35.87 
 
 		 181 aa  95.9  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  30.06 
 
 		 177 aa  95.9  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  33.73 
 
 		 192 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  34.25 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  33.73 
 
 		 192 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  32.2 
 
 		 192 aa  94.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  32.45 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  31.36 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  31.82 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  30.53 
 
 		 182 aa  94  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0834  YceI family protein  35.33 
 
 		 201 aa  94  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.929023  hitchhiker  0.00225936 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  33.91 
 
 		 192 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  32 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  32.61 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  30.51 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  34.81 
 
 		 181 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  34.3 
 
 		 198 aa  91.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  32.56 
 
 		 201 aa  91.7  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  28.49 
 
 		 196 aa  91.3  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  32.56 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  32.56 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  32.4 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  33.72 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  32.4 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  32.02 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  34.1 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  33.53 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  34.16 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  35.39 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  35.52 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  34.52 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  33.53 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  33.53 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  30.77 
 
 		 188 aa  89.7  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  33.7 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  32.42 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  32.24 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  33.52 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>