224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00180 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00180  transmembrane  100 
 
 		 253 aa  520  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384115  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  51.98 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  52.4 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1685  hypothetical protein  49.61 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.730157  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0733  hypothetical protein  49.61 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1688  hypothetical protein  49.61 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.330152  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1895  hypothetical protein  49.61 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.845232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2400  hypothetical protein  49.61 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2263  hypothetical protein  49.61 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.338192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0567  hypothetical protein  49.61 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.323416  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  53.33 
 
 		 251 aa  225  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0706  hypothetical protein  48.03 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4472  hypothetical protein  37.23 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  35.11 
 
 		 260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  35.24 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  40.34 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  35.11 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  35.11 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  34.35 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  35.11 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1189  hypothetical protein  34.8 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  34.53 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  31.98 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0119  hypothetical protein  31.66 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.420493  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1739  hypothetical protein  33.62 
 
 		 228 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  39.77 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  39.77 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  39.77 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  39.77 
 
 		 240 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  39.77 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  39.77 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1622  protein of unknown function DUF218  29.36 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.278756 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0103  hypothetical protein  31.22 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0106  hypothetical protein  31.22 
 
 		 272 aa  95.5  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  29.26 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  33.74 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  31 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  32.46 
 
 		 278 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  24.26 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  29.68 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  32.02 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  28.57 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2397  integral membrane protein  28.12 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  31.76 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  31.36 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  29.02 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  29.02 
 
 		 265 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  27.47 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  24.42 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  29.95 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  30.13 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  28.25 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2681  hypothetical protein  27.52 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  28.31 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  37.01 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  28.4 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  28.4 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3338  hypothetical protein  33.08 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  24.68 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  35.29 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  28.95 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  29.61 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  28.25 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1709  hypothetical protein  27.07 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.221791  normal  0.939525 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  36.36 
 
 		 268 aa  62  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  30.14 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  28.72 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  27.4 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2553  hypothetical protein  28.44 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  30.11 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0878  hypothetical protein  40 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0895  hypothetical protein  40 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  25.69 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  29.22 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0884  hypothetical protein  40 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.150087  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  31.34 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  30.9 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  30.81 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  28.17 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  29.79 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  31.97 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4365  hypothetical protein  29.57 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.980357  hitchhiker  0.000669718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4882  hypothetical protein  27.96 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000206501 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  27.02 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1217  hypothetical protein  27.01 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  25.69 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2141  protein of unknown function DUF218  34.67 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00423736  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0951  hypothetical protein  27.86 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  23.95 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  33.33 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  31.9 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  23.62 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  28.86 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1206  hypothetical protein  26.52 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1098  hypothetical protein  28.22 
 
 		 342 aa  54.7  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0131403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  27.12 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  24.68 
 
 		 282 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1507  hypothetical protein  26.97 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3433  hypothetical protein  32.17 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  35.05 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>