231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2724 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  736    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  87.89 
 
 		 355 aa  667    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  82.82 
 
 		 355 aa  631  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  78.87 
 
 		 355 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  78.03 
 
 		 355 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  77.46 
 
 		 355 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  78.03 
 
 		 355 aa  592  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  77.46 
 
 		 355 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  78.09 
 
 		 356 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  78.09 
 
 		 356 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  57.75 
 
 		 354 aa  436  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  51.25 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  55.29 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  51.41 
 
 		 354 aa  387  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  48.6 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  49.15 
 
 		 403 aa  366  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  48.73 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  49.57 
 
 		 357 aa  363  3e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  49.44 
 
 		 380 aa  357  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  47.03 
 
 		 348 aa  351  1e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  47.81 
 
 		 348 aa  344  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  50.29 
 
 		 358 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  49.14 
 
 		 358 aa  339  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  50.29 
 
 		 876 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2653  phosphotransferase enzyme family protein  50.29 
 
 		 358 aa  338  8e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  51.07 
 
 		 379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  50 
 
 		 358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  50 
 
 		 358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  50 
 
 		 358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  50 
 
 		 358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  48.64 
 
 		 354 aa  333  3e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  44.18 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  43.24 
 
 		 344 aa  295  8e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  42.57 
 
 		 363 aa  293  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  44.64 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  41.14 
 
 		 350 aa  275  9e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  41.03 
 
 		 351 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  40.7 
 
 		 358 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  38.3 
 
 		 352 aa  259  6e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  40.18 
 
 		 357 aa  250  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.2 
 
 		 815 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  38.6 
 
 		 338 aa  219  6e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  36.31 
 
 		 353 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  37.28 
 
 		 354 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  35.38 
 
 		 356 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  41.5 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  38.41 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  35.14 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  34.65 
 
 		 356 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  39.18 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  38.24 
 
 		 359 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  36.55 
 
 		 345 aa  209  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  37.04 
 
 		 364 aa  208  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  36.01 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  35.17 
 
 		 344 aa  202  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  34.71 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  35.94 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  35.42 
 
 		 341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  36.81 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1653  aminoglycoside phosphotransferase  33.92 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.793508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  36.3 
 
 		 451 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  34.13 
 
 		 355 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  34.97 
 
 		 358 aa  196  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4543  aminoglycoside phosphotransferase  38.05 
 
 		 359 aa  195  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.180797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  35.96 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  35.59 
 
 		 348 aa  193  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  35.91 
 
 		 342 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  34.18 
 
 		 349 aa  192  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2171  aminoglycoside phosphotransferase  35.21 
 
 		 362 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0620475  normal  0.0229307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  35.93 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  36.68 
 
 		 362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1847  aminoglycoside phosphotransferase  34.51 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.126827  decreased coverage  0.00532112 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0182  aminoglycoside phosphotransferase  37.05 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3038  aminoglycoside phosphotransferase  34.81 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.145633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  33.53 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1952  hypothetical protein  35.69 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  33.05 
 
 		 358 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2016  hypothetical protein  34.07 
 
 		 358 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.120817  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  34.62 
 
 		 368 aa  182  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5078  aminoglycoside phosphotransferase  34.1 
 
 		 357 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5019  aminoglycoside phosphotransferase  34.22 
 
 		 343 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  32.43 
 
 		 344 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5841  aminoglycoside phosphotransferase  34.22 
 
 		 343 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4338  aminoglycoside phosphotransferase  34.22 
 
 		 343 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  35.26 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  36.16 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3218  aminoglycoside phosphotransferase  33.92 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  34.38 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  36.05 
 
 		 338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0232  aminoglycoside phosphotransferase  34.95 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  34.98 
 
 		 353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  35.49 
 
 		 353 aa  180  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4490  aminoglycoside phosphotransferase  34.44 
 
 		 344 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  34.06 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  34.8 
 
 		 353 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  31.53 
 
 		 352 aa  179  7e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  34.81 
 
 		 336 aa  179  8e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  33.43 
 
 		 358 aa  179  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0226  aminoglycoside phosphotransferase  34.65 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6405  aminoglycoside phosphotransferase  34.09 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>