203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6312 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6312  surface protein  100 
 
 
356 aa  717    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0868  hemagglutination repeat-containing protein  51.42 
 
 
716 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0871  YadA domain-containing protein  51.42 
 
 
716 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  51.42 
 
 
880 aa  189  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  51.01 
 
 
876 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  50 
 
 
878 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0872  YadA domain-containing protein  47.59 
 
 
1440 aa  162  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.263955  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0992  surface protein  47.59 
 
 
1190 aa  162  9e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0868  surface protein  46.03 
 
 
1390 aa  160  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.431588  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0780  hypothetical protein  45.5 
 
 
2504 aa  158  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.544411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  45.74 
 
 
597 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  45.74 
 
 
597 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  45.21 
 
 
597 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6526  YadA-like  44.31 
 
 
1197 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.542717  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6760  YadA domain-containing protein  44.31 
 
 
1197 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116787  normal  0.0242941 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6349  YadA domain-containing protein  44.31 
 
 
1197 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  42.32 
 
 
330 aa  142  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  33.9 
 
 
1446 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7171  hemagluttinin/autotransporter adhesin  43.11 
 
 
1451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  36.65 
 
 
472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  33.9 
 
 
1472 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6072  YadA domain-containing protein  42.51 
 
 
1125 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.613322 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6369  YadA domain-containing protein  42.51 
 
 
1204 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.771283  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2315  YadA domain protein  36.82 
 
 
1713 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241675 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3970  putative autotransporter  33.58 
 
 
1447 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.800804 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4015  putative autotransporter  33.58 
 
 
1447 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.84402 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4077  putative autotransporter  33.58 
 
 
1342 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2582  YadA domain-containing protein  35.2 
 
 
4384 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000293422 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  43.85 
 
 
831 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  43.85 
 
 
831 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  43.85 
 
 
831 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  43.85 
 
 
816 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  43.85 
 
 
820 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  43.85 
 
 
816 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  43.85 
 
 
816 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  43.85 
 
 
816 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  39.35 
 
 
877 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3814  putative haemagglutinin  30.82 
 
 
1674 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0557041  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  43.68 
 
 
575 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146936 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03460  putative adhesin  31.51 
 
 
1616 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03411  hypothetical protein  31.51 
 
 
1616 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4028  putative adhesin  31.39 
 
 
279 aa  129  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0377  YadA-like protein  47.59 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.337345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4975  Hep_Hag family protein  30.3 
 
 
1588 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3939  haemagluttinin family protein  30.82 
 
 
1549 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.78822 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4106  putative haemagglutinins/invasins protein  30.3 
 
 
1616 aa  126  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  40.85 
 
 
990 aa  125  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_003296  RS02177  putative hemagglutinin-related protein  41.3 
 
 
1309 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.732104  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1514  outer membrane protein, putative autotransporter and adhesin  44.39 
 
 
810 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.71119  normal  0.170139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0323  YadA-like haemagluttinin  42.63 
 
 
589 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.445866  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  38.3 
 
 
536 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0749  hemagglutinin domain-containing protein  40.31 
 
 
373 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2118  hemagglutinin domain-containing protein  40.31 
 
 
378 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0929674  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1666  intracellular motility protein A  40.31 
 
 
373 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0599  intracellular motility protein A  40.64 
 
 
192 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0710  intracellular motility protein A  40.64 
 
 
192 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0528  Hep_Hag family protein  41.44 
 
 
378 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  45.64 
 
 
655 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2020  intracellular motility protein A  41.08 
 
 
460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6591  hemaglutinin/autotransporter like protein  35.69 
 
 
1326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266295  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  46.98 
 
 
3635 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0875  Hep_Hag family protein  39.78 
 
 
533 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190664  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  36.2 
 
 
3192 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4704  YadA domain-containing protein  40.34 
 
 
1072 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.818119 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1526  YadA domain-containing protein  42.57 
 
 
735 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.373525 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1225  YadA-like protein  40.94 
 
 
2095 aa  98.2  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.342692 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6245  YadA domain-containing protein  36.51 
 
 
1117 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  35.94 
 
 
525 aa  97.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  39.31 
 
 
2832 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6584  YadA domain-containing protein  43.79 
 
 
898 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4338  YadA domain-containing protein  39.31 
 
 
3126 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0794  outer membrane protein  37.11 
 
 
1516 aa  95.1  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00112166  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0586  putative membrane-anchored cell surface protein, haemagluttinin  40.64 
 
 
4726 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3149  hemagluttinin domain-containing protein  43.07 
 
 
2868 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2271  hemagluttinin like protein  40.69 
 
 
1246 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.137713  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  36.41 
 
 
1265 aa  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  39.87 
 
 
1012 aa  90.9  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  39.87 
 
 
1068 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  36.42 
 
 
473 aa  90.5  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  40.26 
 
 
962 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  38.46 
 
 
1122 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  38.46 
 
 
1122 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6038  YadA domain protein  39.31 
 
 
963 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.408762 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6865  YadA domain-containing protein  37.16 
 
 
967 aa  89.7  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557127  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  38.46 
 
 
1122 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  38.46 
 
 
1090 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  38.46 
 
 
1090 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  38.46 
 
 
1090 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  38.46 
 
 
1074 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  47.17 
 
 
989 aa  89.4  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0544  YadA domain protein  39.22 
 
 
2392 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14824 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  40 
 
 
1186 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2168  hemagluttinin motif-containing protein  39.74 
 
 
1654 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.306442  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6824  YadA domain-containing protein  37.97 
 
 
1417 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.335586  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0813  haemagluttinin motif-containing protein  37.7 
 
 
715 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.783026  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0649  hemagluttinin motif-containing protein  37.7 
 
 
1535 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0499566  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  40.76 
 
 
1613 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3152  YadA domain-containing protein  35.48 
 
 
4191 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1168  surface-exposed protein  37.7 
 
 
1705 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1090  haemagluttinin motif-containing protein  37.7 
 
 
1669 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>